Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXD4Q12950 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXD4Q12950 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXD4Q12950 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXD4Q12950 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXD4Q12950 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXD4Q12950 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXD4Q12950 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXD4Q12950 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXD4Q12950 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXD4Q12950 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXD4Q12950 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXD4Q12950 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXD4Q12950 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXD4Q12950 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXD4Q12950 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXD4Q12950 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXD4Q12950 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXD4Q12950 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXD4Q12950 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXD4Q12950 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXD4Q12950 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXD4Q12950 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXD4Q12950 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXD4Q12950 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXD4Q12950 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXD4Q12950 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXD4Q12950 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXD4Q12950 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXD4Q12950 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXD4Q12950 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXD4Q12950 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXD4Q12950 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXD4Q12950 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXD4Q12950 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXD4Q12950 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXD4Q12950 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXD4Q12950 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXD4Q12950 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXD4Q12950 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXD4Q12950 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXD4Q12950 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXD4Q12950 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXD4Q12950 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXD4Q12950 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXD4Q12950 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXD4Q12950 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXD4Q12950 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXD4Q12950 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FOXD4Q12950 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXD4Q12950 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXD4Q12950 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXD4Q12950 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXD4Q12950 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXD4Q12950 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXD4Q12950 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXD4Q12950 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXD4Q12950 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXD4Q12950 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXD4Q12950 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXD4Q12950 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXD4Q12950 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXD4Q12950 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXD4Q12950 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXD4Q12950 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXD4Q12950 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXD4Q12950 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXD4Q12950 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXD4Q12950 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXD4Q12950 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXD4Q12950 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXD4Q12950 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXD4Q12950 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXD4Q12950 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXD4Q12950 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXD4Q12950 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXD4Q12950 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXD4Q12950 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXD4Q12950 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXD4Q12950 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXD4Q12950 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXD4Q12950 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXD4Q12950 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXD4Q12950 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXD4Q12950 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXD4Q12950 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FOXD4Q12950 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXD4Q12950 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXD4Q12950 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXD4Q12950 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXD4Q12950 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXD4Q12950 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXD4Q12950 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXD4Q12950 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXD4Q12950 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FOXD4Q12950 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXD4Q12950 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXD4Q12950 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXD4Q12950 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FOXD4Q12950 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
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