Protein–RNA interactions for Protein: P57088

TMEM33, Transmembrane protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM33P57088 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM33P57088 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM33P57088 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM33P57088 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM33P57088 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM33P57088 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM33P57088 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM33P57088 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM33P57088 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM33P57088 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM33P57088 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM33P57088 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM33P57088 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM33P57088 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM33P57088 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM33P57088 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM33P57088 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM33P57088 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM33P57088 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM33P57088 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM33P57088 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TMEM33P57088 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM33P57088 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM33P57088 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM33P57088 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM33P57088 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM33P57088 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM33P57088 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM33P57088 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM33P57088 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM33P57088 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM33P57088 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM33P57088 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM33P57088 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM33P57088 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM33P57088 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM33P57088 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM33P57088 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM33P57088 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM33P57088 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM33P57088 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM33P57088 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM33P57088 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM33P57088 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM33P57088 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM33P57088 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM33P57088 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM33P57088 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM33P57088 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM33P57088 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM33P57088 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM33P57088 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM33P57088 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM33P57088 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM33P57088 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM33P57088 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM33P57088 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM33P57088 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM33P57088 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM33P57088 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM33P57088 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM33P57088 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM33P57088 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM33P57088 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM33P57088 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM33P57088 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM33P57088 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM33P57088 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM33P57088 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM33P57088 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM33P57088 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM33P57088 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM33P57088 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM33P57088 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM33P57088 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM33P57088 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM33P57088 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM33P57088 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM33P57088 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM33P57088 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM33P57088 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM33P57088 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM33P57088 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM33P57088 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM33P57088 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM33P57088 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM33P57088 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM33P57088 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM33P57088 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM33P57088 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM33P57088 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM33P57088 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM33P57088 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM33P57088 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM33P57088 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM33P57088 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM33P57088 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM33P57088 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM33P57088 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM33P57088 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms