Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
DDIT3P35638 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
DDIT3P35638 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
DDIT3P35638 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
DDIT3P35638 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
DDIT3P35638 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
DDIT3P35638 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
DDIT3P35638 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
DDIT3P35638 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
DDIT3P35638 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
DDIT3P35638 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
DDIT3P35638 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
DDIT3P35638 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
DDIT3P35638 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
DDIT3P35638 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
DDIT3P35638 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
DDIT3P35638 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
DDIT3P35638 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
DDIT3P35638 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
DDIT3P35638 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
DDIT3P35638 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
DDIT3P35638 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
DDIT3P35638 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
DDIT3P35638 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
DDIT3P35638 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
DDIT3P35638 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
DDIT3P35638 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
DDIT3P35638 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
DDIT3P35638 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
DDIT3P35638 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
DDIT3P35638 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
DDIT3P35638 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
DDIT3P35638 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
DDIT3P35638 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
DDIT3P35638 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
DDIT3P35638 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
DDIT3P35638 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
DDIT3P35638 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
DDIT3P35638 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
DDIT3P35638 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
DDIT3P35638 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
DDIT3P35638 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
DDIT3P35638 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
DDIT3P35638 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
DDIT3P35638 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
DDIT3P35638 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
DDIT3P35638 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
DDIT3P35638 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
DDIT3P35638 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
DDIT3P35638 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
DDIT3P35638 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
DDIT3P35638 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
DDIT3P35638 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
DDIT3P35638 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
DDIT3P35638 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
DDIT3P35638 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
DDIT3P35638 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
DDIT3P35638 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
DDIT3P35638 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
DDIT3P35638 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
DDIT3P35638 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
DDIT3P35638 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
DDIT3P35638 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
DDIT3P35638 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
DDIT3P35638 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
DDIT3P35638 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
DDIT3P35638 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
DDIT3P35638 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
DDIT3P35638 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
DDIT3P35638 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
DDIT3P35638 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
DDIT3P35638 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
DDIT3P35638 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
DDIT3P35638 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
DDIT3P35638 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
DDIT3P35638 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
DDIT3P35638 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
DDIT3P35638 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
DDIT3P35638 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
DDIT3P35638 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
DDIT3P35638 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
DDIT3P35638 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
DDIT3P35638 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
DDIT3P35638 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
DDIT3P35638 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
DDIT3P35638 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
DDIT3P35638 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
DDIT3P35638 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
DDIT3P35638 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
DDIT3P35638 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
DDIT3P35638 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
DDIT3P35638 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
DDIT3P35638 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
DDIT3P35638 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
DDIT3P35638 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
DDIT3P35638 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
DDIT3P35638 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
DDIT3P35638 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
DDIT3P35638 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
DDIT3P35638 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms