Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NCLP19338 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NCLP19338 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
NCLP19338 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NCLP19338 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NCLP19338 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NCLP19338 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NCLP19338 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NCLP19338 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NCLP19338 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NCLP19338 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NCLP19338 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NCLP19338 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NCLP19338 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NCLP19338 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NCLP19338 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NCLP19338 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NCLP19338 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NCLP19338 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NCLP19338 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NCLP19338 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
NCLP19338 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NCLP19338 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NCLP19338 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NCLP19338 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NCLP19338 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NCLP19338 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NCLP19338 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NCLP19338 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NCLP19338 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NCLP19338 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NCLP19338 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NCLP19338 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NCLP19338 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NCLP19338 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NCLP19338 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NCLP19338 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NCLP19338 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NCLP19338 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NCLP19338 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NCLP19338 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NCLP19338 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NCLP19338 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NCLP19338 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NCLP19338 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NCLP19338 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NCLP19338 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NCLP19338 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NCLP19338 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NCLP19338 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NCLP19338 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NCLP19338 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NCLP19338 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NCLP19338 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NCLP19338 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NCLP19338 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NCLP19338 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NCLP19338 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NCLP19338 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NCLP19338 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NCLP19338 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NCLP19338 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NCLP19338 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NCLP19338 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NCLP19338 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NCLP19338 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NCLP19338 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NCLP19338 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NCLP19338 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NCLP19338 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NCLP19338 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NCLP19338 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NCLP19338 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NCLP19338 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NCLP19338 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NCLP19338 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NCLP19338 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NCLP19338 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NCLP19338 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NCLP19338 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NCLP19338 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NCLP19338 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NCLP19338 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NCLP19338 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
NCLP19338 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NCLP19338 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NCLP19338 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NCLP19338 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NCLP19338 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NCLP19338 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NCLP19338 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NCLP19338 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NCLP19338 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NCLP19338 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NCLP19338 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NCLP19338 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NCLP19338 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NCLP19338 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NCLP19338 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NCLP19338 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms