Protein–RNA interactions for Protein: P0DMC3

APELA, Apelin receptor early endogenous ligand, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APELAP0DMC3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APELAP0DMC3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APELAP0DMC3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APELAP0DMC3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APELAP0DMC3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APELAP0DMC3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APELAP0DMC3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
APELAP0DMC3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APELAP0DMC3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
APELAP0DMC3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
APELAP0DMC3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
APELAP0DMC3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
APELAP0DMC3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
APELAP0DMC3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
APELAP0DMC3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APELAP0DMC3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APELAP0DMC3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
APELAP0DMC3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APELAP0DMC3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
APELAP0DMC3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APELAP0DMC3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APELAP0DMC3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APELAP0DMC3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
APELAP0DMC3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
APELAP0DMC3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APELAP0DMC3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APELAP0DMC3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APELAP0DMC3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APELAP0DMC3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APELAP0DMC3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APELAP0DMC3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APELAP0DMC3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APELAP0DMC3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APELAP0DMC3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APELAP0DMC3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APELAP0DMC3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APELAP0DMC3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APELAP0DMC3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APELAP0DMC3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APELAP0DMC3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APELAP0DMC3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APELAP0DMC3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APELAP0DMC3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APELAP0DMC3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APELAP0DMC3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APELAP0DMC3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APELAP0DMC3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
APELAP0DMC3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APELAP0DMC3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APELAP0DMC3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
APELAP0DMC3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APELAP0DMC3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APELAP0DMC3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APELAP0DMC3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APELAP0DMC3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APELAP0DMC3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APELAP0DMC3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APELAP0DMC3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APELAP0DMC3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APELAP0DMC3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APELAP0DMC3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
APELAP0DMC3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APELAP0DMC3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APELAP0DMC3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APELAP0DMC3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
APELAP0DMC3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APELAP0DMC3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APELAP0DMC3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APELAP0DMC3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APELAP0DMC3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APELAP0DMC3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APELAP0DMC3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APELAP0DMC3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APELAP0DMC3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APELAP0DMC3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APELAP0DMC3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
APELAP0DMC3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
APELAP0DMC3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
APELAP0DMC3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
APELAP0DMC3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
APELAP0DMC3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
APELAP0DMC3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
APELAP0DMC3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
APELAP0DMC3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
APELAP0DMC3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
APELAP0DMC3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
APELAP0DMC3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
APELAP0DMC3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
APELAP0DMC3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
APELAP0DMC3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
APELAP0DMC3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
APELAP0DMC3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
APELAP0DMC3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
APELAP0DMC3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
APELAP0DMC3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
APELAP0DMC3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
APELAP0DMC3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
APELAP0DMC3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
APELAP0DMC3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
APELAP0DMC3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms