Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC2BP0DI82 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC2BP0DI82 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC2BP0DI82 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC2BP0DI82 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC2BP0DI82 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC2BP0DI82 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC2BP0DI82 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRAPPC2BP0DI82 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC2BP0DI82 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC2BP0DI82 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC2BP0DI82 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC2BP0DI82 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC2BP0DI82 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC2BP0DI82 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC2BP0DI82 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC2BP0DI82 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC2BP0DI82 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC2BP0DI82 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRAPPC2BP0DI82 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC2BP0DI82 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC2BP0DI82 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC2BP0DI82 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC2BP0DI82 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRAPPC2BP0DI82 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC2BP0DI82 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC2BP0DI82 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC2BP0DI82 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC2BP0DI82 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRAPPC2BP0DI82 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC2BP0DI82 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC2BP0DI82 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC2BP0DI82 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAPPC2BP0DI82 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAPPC2BP0DI82 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAPPC2BP0DI82 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC2BP0DI82 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC2BP0DI82 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC2BP0DI82 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC2BP0DI82 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC2BP0DI82 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC2BP0DI82 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC2BP0DI82 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC2BP0DI82 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC2BP0DI82 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC2BP0DI82 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC2BP0DI82 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC2BP0DI82 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC2BP0DI82 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC2BP0DI82 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC2BP0DI82 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC2BP0DI82 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC2BP0DI82 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC2BP0DI82 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC2BP0DI82 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC2BP0DI82 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC2BP0DI82 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC2BP0DI82 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC2BP0DI82 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC2BP0DI82 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC2BP0DI82 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC2BP0DI82 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC2BP0DI82 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC2BP0DI82 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC2BP0DI82 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC2BP0DI82 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC2BP0DI82 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC2BP0DI82 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC2BP0DI82 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC2BP0DI82 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC2BP0DI82 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC2BP0DI82 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC2BP0DI82 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC2BP0DI82 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC2BP0DI82 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC2BP0DI82 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC2BP0DI82 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAPPC2BP0DI82 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC2BP0DI82 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRAPPC2BP0DI82 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC2BP0DI82 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC2BP0DI82 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC2BP0DI82 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRAPPC2BP0DI82 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC2BP0DI82 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC2BP0DI82 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC2BP0DI82 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC2BP0DI82 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAPPC2BP0DI82 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC2BP0DI82 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC2BP0DI82 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC2BP0DI82 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAPPC2BP0DI82 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC2BP0DI82 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC2BP0DI82 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC2BP0DI82 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC2BP0DI82 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAPPC2BP0DI82 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAPPC2BP0DI82 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAPPC2BP0DI82 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms