Protein–RNA interactions for Protein: O95900

TRUB2, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase TRUB2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRUB2O95900 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRUB2O95900 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRUB2O95900 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRUB2O95900 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRUB2O95900 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRUB2O95900 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRUB2O95900 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRUB2O95900 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRUB2O95900 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRUB2O95900 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRUB2O95900 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRUB2O95900 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRUB2O95900 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRUB2O95900 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRUB2O95900 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRUB2O95900 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRUB2O95900 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRUB2O95900 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRUB2O95900 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRUB2O95900 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TRUB2O95900 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRUB2O95900 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRUB2O95900 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TRUB2O95900 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRUB2O95900 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRUB2O95900 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRUB2O95900 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRUB2O95900 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRUB2O95900 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRUB2O95900 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRUB2O95900 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TRUB2O95900 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRUB2O95900 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRUB2O95900 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRUB2O95900 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRUB2O95900 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRUB2O95900 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRUB2O95900 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRUB2O95900 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRUB2O95900 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRUB2O95900 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRUB2O95900 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRUB2O95900 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRUB2O95900 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRUB2O95900 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRUB2O95900 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRUB2O95900 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRUB2O95900 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRUB2O95900 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRUB2O95900 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRUB2O95900 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRUB2O95900 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRUB2O95900 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRUB2O95900 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TRUB2O95900 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TRUB2O95900 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRUB2O95900 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRUB2O95900 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRUB2O95900 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRUB2O95900 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRUB2O95900 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRUB2O95900 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRUB2O95900 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRUB2O95900 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRUB2O95900 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRUB2O95900 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRUB2O95900 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRUB2O95900 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRUB2O95900 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRUB2O95900 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRUB2O95900 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRUB2O95900 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRUB2O95900 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRUB2O95900 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRUB2O95900 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRUB2O95900 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRUB2O95900 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRUB2O95900 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRUB2O95900 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TRUB2O95900 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TRUB2O95900 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRUB2O95900 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRUB2O95900 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRUB2O95900 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRUB2O95900 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRUB2O95900 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRUB2O95900 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRUB2O95900 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRUB2O95900 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRUB2O95900 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRUB2O95900 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRUB2O95900 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRUB2O95900 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRUB2O95900 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRUB2O95900 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRUB2O95900 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRUB2O95900 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRUB2O95900 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRUB2O95900 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TRUB2O95900 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms