Protein–RNA interactions for Protein: O15068

MCF2L, Guanine nucleotide exchange factor DBS, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2LO15068 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
MCF2LO15068 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
MCF2LO15068 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
MCF2LO15068 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
MCF2LO15068 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
MCF2LO15068 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
MCF2LO15068 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
MCF2LO15068 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
MCF2LO15068 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MCF2LO15068 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MCF2LO15068 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MCF2LO15068 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MCF2LO15068 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MCF2LO15068 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
MCF2LO15068 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MCF2LO15068 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MCF2LO15068 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MCF2LO15068 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MCF2LO15068 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
MCF2LO15068 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
MCF2LO15068 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MCF2LO15068 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MCF2LO15068 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MCF2LO15068 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MCF2LO15068 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MCF2LO15068 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MCF2LO15068 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MCF2LO15068 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MCF2LO15068 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MCF2LO15068 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MCF2LO15068 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MCF2LO15068 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MCF2LO15068 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MCF2LO15068 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MCF2LO15068 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MCF2LO15068 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MCF2LO15068 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
MCF2LO15068 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MCF2LO15068 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MCF2LO15068 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MCF2LO15068 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MCF2LO15068 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MCF2LO15068 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MCF2LO15068 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
MCF2LO15068 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MCF2LO15068 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MCF2LO15068 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MCF2LO15068 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MCF2LO15068 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MCF2LO15068 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MCF2LO15068 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MCF2LO15068 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MCF2LO15068 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MCF2LO15068 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MCF2LO15068 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MCF2LO15068 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCF2LO15068 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCF2LO15068 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCF2LO15068 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCF2LO15068 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCF2LO15068 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCF2LO15068 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCF2LO15068 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCF2LO15068 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCF2LO15068 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCF2LO15068 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCF2LO15068 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCF2LO15068 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCF2LO15068 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCF2LO15068 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCF2LO15068 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MCF2LO15068 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MCF2LO15068 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MCF2LO15068 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCF2LO15068 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
MCF2LO15068 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCF2LO15068 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCF2LO15068 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCF2LO15068 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCF2LO15068 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCF2LO15068 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCF2LO15068 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCF2LO15068 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCF2LO15068 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCF2LO15068 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCF2LO15068 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCF2LO15068 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MCF2LO15068 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCF2LO15068 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCF2LO15068 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCF2LO15068 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCF2LO15068 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCF2LO15068 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCF2LO15068 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCF2LO15068 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCF2LO15068 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MCF2LO15068 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCF2LO15068 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCF2LO15068 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MCF2LO15068 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.9 ms