Protein–RNA interactions for Protein: O00548

DLL1, Delta-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL1O00548 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DLL1O00548 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
DLL1O00548 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DLL1O00548 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
DLL1O00548 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DLL1O00548 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DLL1O00548 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DLL1O00548 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DLL1O00548 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DLL1O00548 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DLL1O00548 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DLL1O00548 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DLL1O00548 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DLL1O00548 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DLL1O00548 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DLL1O00548 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DLL1O00548 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DLL1O00548 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DLL1O00548 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DLL1O00548 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DLL1O00548 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DLL1O00548 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DLL1O00548 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DLL1O00548 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DLL1O00548 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DLL1O00548 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DLL1O00548 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DLL1O00548 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
DLL1O00548 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DLL1O00548 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DLL1O00548 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DLL1O00548 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DLL1O00548 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DLL1O00548 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DLL1O00548 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DLL1O00548 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DLL1O00548 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DLL1O00548 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DLL1O00548 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
DLL1O00548 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DLL1O00548 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DLL1O00548 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DLL1O00548 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DLL1O00548 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DLL1O00548 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DLL1O00548 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DLL1O00548 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DLL1O00548 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DLL1O00548 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DLL1O00548 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
DLL1O00548 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DLL1O00548 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DLL1O00548 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DLL1O00548 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DLL1O00548 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
DLL1O00548 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DLL1O00548 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DLL1O00548 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DLL1O00548 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DLL1O00548 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DLL1O00548 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DLL1O00548 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DLL1O00548 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DLL1O00548 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DLL1O00548 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DLL1O00548 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DLL1O00548 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DLL1O00548 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
DLL1O00548 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DLL1O00548 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DLL1O00548 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
DLL1O00548 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DLL1O00548 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DLL1O00548 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
DLL1O00548 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DLL1O00548 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DLL1O00548 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DLL1O00548 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DLL1O00548 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DLL1O00548 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
DLL1O00548 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DLL1O00548 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DLL1O00548 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DLL1O00548 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
DLL1O00548 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
DLL1O00548 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DLL1O00548 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DLL1O00548 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DLL1O00548 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DLL1O00548 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DLL1O00548 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
DLL1O00548 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DLL1O00548 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DLL1O00548 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DLL1O00548 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DLL1O00548 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DLL1O00548 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DLL1O00548 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DLL1O00548 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
DLL1O00548 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms