Protein–RNA interactions for Protein: A6NNY8

USP27X, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27XA6NNY8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
USP27XA6NNY8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
USP27XA6NNY8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP27XA6NNY8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP27XA6NNY8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
USP27XA6NNY8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP27XA6NNY8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP27XA6NNY8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP27XA6NNY8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP27XA6NNY8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP27XA6NNY8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP27XA6NNY8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP27XA6NNY8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP27XA6NNY8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP27XA6NNY8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP27XA6NNY8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP27XA6NNY8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP27XA6NNY8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP27XA6NNY8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP27XA6NNY8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP27XA6NNY8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP27XA6NNY8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP27XA6NNY8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
USP27XA6NNY8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP27XA6NNY8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP27XA6NNY8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP27XA6NNY8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP27XA6NNY8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP27XA6NNY8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP27XA6NNY8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP27XA6NNY8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP27XA6NNY8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP27XA6NNY8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP27XA6NNY8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP27XA6NNY8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP27XA6NNY8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP27XA6NNY8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP27XA6NNY8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP27XA6NNY8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP27XA6NNY8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
USP27XA6NNY8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP27XA6NNY8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP27XA6NNY8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP27XA6NNY8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP27XA6NNY8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP27XA6NNY8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP27XA6NNY8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP27XA6NNY8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP27XA6NNY8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP27XA6NNY8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP27XA6NNY8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
USP27XA6NNY8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP27XA6NNY8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP27XA6NNY8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
USP27XA6NNY8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP27XA6NNY8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP27XA6NNY8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP27XA6NNY8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP27XA6NNY8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP27XA6NNY8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
USP27XA6NNY8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP27XA6NNY8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP27XA6NNY8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP27XA6NNY8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP27XA6NNY8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP27XA6NNY8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP27XA6NNY8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP27XA6NNY8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP27XA6NNY8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP27XA6NNY8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP27XA6NNY8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP27XA6NNY8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP27XA6NNY8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP27XA6NNY8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP27XA6NNY8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP27XA6NNY8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP27XA6NNY8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP27XA6NNY8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP27XA6NNY8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
USP27XA6NNY8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP27XA6NNY8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP27XA6NNY8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP27XA6NNY8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP27XA6NNY8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP27XA6NNY8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP27XA6NNY8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP27XA6NNY8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP27XA6NNY8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP27XA6NNY8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP27XA6NNY8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP27XA6NNY8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP27XA6NNY8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP27XA6NNY8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP27XA6NNY8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP27XA6NNY8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP27XA6NNY8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP27XA6NNY8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP27XA6NNY8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP27XA6NNY8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP27XA6NNY8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms