RNA–Protein interactions for RNA: YJR003C

YJR003C, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YJR003C, Length 1,560 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YJR003CYJR003C FAP1P53971 965 aa11.78□□□□□ -0.52
YJR003CYJR003C PRY3P47033 881 aa11.13□□□□□ -0.63
YJR003CYJR003C MTC1P47018 478 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
YJR003CYJR003C DRS1P32892 752 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
YJR003CYJR003C HAA1Q12753 694 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
YJR003CYJR003C YCK3P39962 524 aa10.27□□□□□ -0.76
YJR003CYJR003C AAD16Q02895 342 aa10.18□□□□□ -0.78
YJR003CYJR003C PRI1P10363 409 aa9.93□□□□□ -0.82
YJR003CYJR003C BUD31P25337 157 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
YJR003CYJR003C TSR3Q12094 313 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
YJR003CYJR003C YGL015CP33199 130 aa9.21□□□□□ -0.93
YJR003CYJR003C ISW2Q08773 1120 aa9.16□□□□□ -0.94
YJR003CYJR003C RPG1P38249 964 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
YJR003CYJR003C DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
YJR003CYJR003C MRPL32P25348 183 aa9.01□□□□□ -0.97
YJR003CYJR003C RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
YJR003CYJR003C AVT3P36062 692 aa8.74□□□□□ -1.01
YJR003CYJR003C SIS1P25294 352 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
YJR003CYJR003C BFR2Q06631 534 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
YJR003CYJR003C RPL17AP05740 184 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
YJR003CYJR003C RPL17BP46990 184 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
YJR003CYJR003C REB1P21538 810 aa8.47□□□□□ -1.05
YJR003CYJR003C UBP9P39967 754 aa8.33□□□□□ -1.08
YJR003CYJR003C UBP10P53874 792 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
YJR003CYJR003C SPT21P35209 758 aa8.12□□□□□ -1.11
YJR003CYJR003C MAP2P38174 421 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
YJR003CYJR003C CDC27P38042 758 aa8.08□□□□□ -1.12
YJR003CYJR003C YKR023WP36119 530 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
YJR003CYJR003C TIF4632P39936 914 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
YJR003CYJR003C HOP09932 586 aa7.91□□□□□ -1.14
YJR003CYJR003C DCD1P06773 312 aa7.88□□□□□ -1.15
YJR003CYJR003C TGL3P40308 642 aa7.88□□□□□ -1.15
YJR003CYJR003C TFC8Q12308 588 aa7.87□□□□□ -1.15
YJR003CYJR003C RIM101P33400 625 aa7.83□□□□□ -1.16
YJR003CYJR003C SCY1P53009 804 aa7.67□□□□□ -1.18
YJR003CYJR003C SLX5P32828 619 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
YJR003CYJR003C BCH2P36122 765 aa7.62□□□□□ -1.19
YJR003CYJR003C OXP1P28273 1286 aa7.59□□□□□ -1.19
YJR003CYJR003C TFA1P36100 482 aa7.55□□□□□ -1.2
YJR003CYJR003C PTP3P40048 928 aa7.49□□□□□ -1.21
YJR003CYJR003C YJL171CP46992 396 aa7.49□□□□□ -1.21
YJR003CYJR003C YBL029C-AQ3E756 94 aa7.48□□□□□ -1.21
YJR003CYJR003C YIL055CP40523 627 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
YJR003CYJR003C EPS1P40557 701 aa7.43□□□□□ -1.22
YJR003CYJR003C YAH1Q12184 172 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
YJR003CYJR003C BDF1P35817 686 aa7.4□□□□□ -1.22
YJR003CYJR003C RSM7P47150 247 aa7.36□□□□□ -1.23
YJR003CYJR003C VNX1P42839 908 aa7.32□□□□□ -1.24
YJR003CYJR003C AIR2Q12476 344 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
YJR003CYJR003C AI2P03876 854 aa7.3□□□□□ -1.24
YJR003CYJR003C SPP1Q03012 353 aa7.29□□□□□ -1.24
YJR003CYJR003C BBC1P47068 1157 aa7.29□□□□□ -1.24
YJR003CYJR003C MST1P07236 462 aa7.26□□□□□ -1.25
YJR003CYJR003C YLR271WQ06152 274 aa7.25□□□□□ -1.25
YJR003CYJR003C FKH1P40466 484 aa7.2□□□□□ -1.26
YJR003CYJR003C YOR238WQ08634 303 aa7.19□□□□□ -1.26
YJR003CYJR003C BMT6Q12291 365 aa7.15□□□□□ -1.27
YJR003CYJR003C SSP1P38871 571 aa7.14□□□□□ -1.27
YJR003CYJR003C RGA2Q06407 1009 aa7.14□□□□□ -1.27
YJR003CYJR003C PSD2P53037 1138 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
YJR003CYJR003C WSC3Q12215 556 aa7.09□□□□□ -1.27
YJR003CYJR003C ARP8Q12386 881 aaKnown RBP RIP-Chip data7.09□□□□□ -1.27not detected
YJR003CYJR003C NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data7.08□□□□□ -1.28not detected
YJR003CYJR003C YAP5P40574 245 aa7.08□□□□□ -1.28
YJR003CYJR003C MRM1P25270 412 aa7.05□□□□□ -1.28
YJR003CYJR003C TIF11P38912 153 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
YJR003CYJR003C CST9Q06032 482 aa7.01□□□□□ -1.29
YJR003CYJR003C PIB1Q06651 286 aa6.98□□□□□ -1.29
YJR003CYJR003C MGA2P40578 1113 aa6.96□□□□□ -1.29
YJR003CYJR003C LDB19Q12502 818 aa6.95□□□□□ -1.3
YJR003CYJR003C GTT3P39996 337 aa6.94□□□□□ -1.3
YJR003CYJR003C RTG3P38165 486 aa6.87□□□□□ -1.31
YJR003CYJR003C VPS29P38759 282 aa6.86□□□□□ -1.31
YJR003CYJR003C RCR1P38212 213 aa6.86□□□□□ -1.31
YJR003CYJR003C YFR006WP43590 535 aa6.85□□□□□ -1.31
YJR003CYJR003C YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data6.85□□□□□ -1.31not detected
YJR003CYJR003C ULI1P43604 169 aa6.84□□□□□ -1.31
YJR003CYJR003C DBP1P24784 617 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
YJR003CYJR003C STS1P38637 319 aa6.82□□□□□ -1.32
YJR003CYJR003C IOC2Q12072 812 aa6.81□□□□□ -1.32
YJR003CYJR003C VMA1P17255 1071 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
YJR003CYJR003C BCK2P33306 851 aa6.75□□□□□ -1.33
YJR003CYJR003C SET4P42948 560 aa6.75□□□□□ -1.33
YJR003CYJR003C YOL036WQ08206 761 aa6.74□□□□□ -1.33
YJR003CYJR003C RGA1P39083 1007 aa6.72□□□□□ -1.33
YJR003CYJR003C MSB4Q12317 492 aa6.72□□□□□ -1.33
YJR003CYJR003C EAP1P36041 632 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
YJR003CYJR003C SAM3Q08986 587 aa6.68□□□□□ -1.34
YJR003CYJR003C NCR1Q12200 1170 aa6.68□□□□□ -1.34
YJR003CYJR003C TRP5P00931 707 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
YJR003CYJR003C RTG1P32607 177 aa6.64□□□□□ -1.35
YJR003CYJR003C RAM2P29703 316 aa6.63□□□□□ -1.35
YJR003CYJR003C GYP5Q12344 894 aa6.61□□□□□ -1.35
YJR003CYJR003C DCW1P36091 449 aa6.58□□□□□ -1.36
YJR003CYJR003C YNL035CP53962 389 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
YJR003CYJR003C MAK11P20484 414 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
YJR003CYJR003C MIF2P35201 549 aa6.57□□□□□ -1.36
YJR003CYJR003C HTA1P04911 132 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
YJR003CYJR003C HTA2P04912 132 aa6.54□□□□□ -1.36
YJR003CYJR003C EDS1P38073 919 aa6.54□□□□□ -1.36
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