RNA–Protein interactions for RNA: YHR157W

REC104, Transcript of Protein involved in early stages of meiotic recombination, yeastyeast

Gene REC104, Length 549 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
REC104YHR157W FAP1P53971 965 aa13.19□□□□□ -0.3
REC104YHR157W MTC1P47018 478 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
REC104YHR157W PRY3P47033 881 aa12.49□□□□□ -0.41
REC104YHR157W YCK3P39962 524 aa11.87□□□□□ -0.51
REC104YHR157W AAD16Q02895 342 aa11.71□□□□□ -0.53
REC104YHR157W PRI1P10363 409 aa11.62□□□□□ -0.55
REC104YHR157W HAA1Q12753 694 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
REC104YHR157W TSR3Q12094 313 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
REC104YHR157W RPG1P38249 964 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
REC104YHR157W ISW2Q08773 1120 aa10.85□□□□□ -0.67
REC104YHR157W DRS1P32892 752 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
REC104YHR157W MRPL32P25348 183 aa10.42□□□□□ -0.74
REC104YHR157W YGL015CP33199 130 aa10.38□□□□□ -0.75
REC104YHR157W BUD31P25337 157 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
REC104YHR157W CDC27P38042 758 aa9.77□□□□□ -0.85
REC104YHR157W RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
REC104YHR157W DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
REC104YHR157W REB1P21538 810 aa9.64□□□□□ -0.87
REC104YHR157W RPL17AP05740 184 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
REC104YHR157W MAP2P38174 421 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
REC104YHR157W RPL17BP46990 184 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
REC104YHR157W SIS1P25294 352 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
REC104YHR157W UBP10P53874 792 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
REC104YHR157W YKR023WP36119 530 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
REC104YHR157W UBP9P39967 754 aa9.25□□□□□ -0.93
REC104YHR157W DCD1P06773 312 aa9.24□□□□□ -0.93
REC104YHR157W HOP09932 586 aa9.19□□□□□ -0.94
REC104YHR157W TGL3P40308 642 aa9.13□□□□□ -0.95
REC104YHR157W SCY1P53009 804 aa9.13□□□□□ -0.95
REC104YHR157W TFC8Q12308 588 aa9.13□□□□□ -0.95
REC104YHR157W TIF4632P39936 914 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
REC104YHR157W SPT21P35209 758 aa9.1□□□□□ -0.95
REC104YHR157W SLX5P32828 619 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
REC104YHR157W AVT3P36062 692 aa8.96□□□□□ -0.98
REC104YHR157W BCH2P36122 765 aa8.8□□□□□ -1
REC104YHR157W YBL029C-AQ3E756 94 aa8.77□□□□□ -1.01
REC104YHR157W MST1P07236 462 aa8.6□□□□□ -1.03
REC104YHR157W VNX1P42839 908 aa8.56□□□□□ -1.04
REC104YHR157W AIR2Q12476 344 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
REC104YHR157W YOR238WQ08634 303 aa8.47□□□□□ -1.05
REC104YHR157W BDF1P35817 686 aa8.46□□□□□ -1.06
REC104YHR157W SPP1Q03012 353 aa8.46□□□□□ -1.06
REC104YHR157W EPS1P40557 701 aa8.45□□□□□ -1.06
REC104YHR157W RIM101P33400 625 aa8.41□□□□□ -1.06
REC104YHR157W WSC3Q12215 556 aa8.4□□□□□ -1.06
REC104YHR157W FKH1P40466 484 aa8.39□□□□□ -1.07
REC104YHR157W YJL171CP46992 396 aa8.39□□□□□ -1.07
REC104YHR157W NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data8.26□□□□□ -1.09not detected
REC104YHR157W TIF11P38912 153 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
REC104YHR157W YAP5P40574 245 aa8.2□□□□□ -1.1
REC104YHR157W LDB19Q12502 818 aa8.18□□□□□ -1.1
REC104YHR157W BMT6Q12291 365 aa8.17□□□□□ -1.1
REC104YHR157W OXP1P28273 1286 aa8.15□□□□□ -1.1
REC104YHR157W IOC2Q12072 812 aa8.11□□□□□ -1.11
REC104YHR157W ULI1P43604 169 aa8.08□□□□□ -1.12
REC104YHR157W GTT3P39996 337 aa8.06□□□□□ -1.12
REC104YHR157W PTP3P40048 928 aa8.01□□□□□ -1.13
REC104YHR157W BFR2Q06631 534 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
REC104YHR157W PIB1Q06651 286 aa7.96□□□□□ -1.14
REC104YHR157W BBC1P47068 1157 aa7.94□□□□□ -1.14
REC104YHR157W AI2P03876 854 aa7.91□□□□□ -1.14
REC104YHR157W YIL055CP40523 627 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
REC104YHR157W RTG1P32607 177 aa7.88□□□□□ -1.15
REC104YHR157W RSM7P47150 247 aa7.84□□□□□ -1.15
REC104YHR157W NCR1Q12200 1170 aa7.84□□□□□ -1.15
REC104YHR157W TRP5P00931 707 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
REC104YHR157W MSB4Q12317 492 aa7.78□□□□□ -1.16
REC104YHR157W SET4P42948 560 aa7.77□□□□□ -1.17
REC104YHR157W EAP1P36041 632 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
REC104YHR157W YOL036WQ08206 761 aa7.74□□□□□ -1.17
REC104YHR157W BCK2P33306 851 aa7.73□□□□□ -1.17
REC104YHR157W YNL035CP53962 389 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
REC104YHR157W SEC61P32915 480 aa7.7□□□□□ -1.18
REC104YHR157W RGA2Q06407 1009 aa7.7□□□□□ -1.18
REC104YHR157W YAH1Q12184 172 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
REC104YHR157W SAP30P38429 201 aa7.65□□□□□ -1.18
REC104YHR157W CHL1P22516 861 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
REC104YHR157W MRM1P25270 412 aa7.57□□□□□ -1.2
REC104YHR157W TFG1P41895 735 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
REC104YHR157W DAN4P47179 1161 aa7.54□□□□□ -1.2
REC104YHR157W PRE3P38624 215 aa7.53□□□□□ -1.2
REC104YHR157W PSD2P53037 1138 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
REC104YHR157W YFR006WP43590 535 aa7.51□□□□□ -1.21
REC104YHR157W YLR271WQ06152 274 aa7.5□□□□□ -1.21
REC104YHR157W YDL129WQ07555 291 aa7.5□□□□□ -1.21
REC104YHR157W VMA1P17255 1071 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
REC104YHR157W DBP1P24784 617 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
REC104YHR157W YDR344CQ05510 147 aa7.47□□□□□ -1.21
REC104YHR157W SAM3Q08986 587 aa7.46□□□□□ -1.22
REC104YHR157W VRP1P37370 817 aa7.45□□□□□ -1.22
REC104YHR157W XDJ1P39102 459 aa7.45□□□□□ -1.22
REC104YHR157W VPS29P38759 282 aa7.43□□□□□ -1.22
REC104YHR157W YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data7.43□□□□□ -1.22not detected
REC104YHR157W STS1P38637 319 aa7.42□□□□□ -1.22
REC104YHR157W RGA1P39083 1007 aa7.4□□□□□ -1.22
REC104YHR157W JIP4Q03361 876 aa7.4□□□□□ -1.22
REC104YHR157W DPS1P04802 557 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
REC104YHR157W SRC1Q03707 834 aa7.34□□□□□ -1.23
REC104YHR157W DCW1P36091 449 aa7.3□□□□□ -1.24
REC104YHR157W YEL023CP39992 682 aa7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 53.9 ms