RNA–Protein interactions for RNA: YHL009W-A

YHL009W-A, Transcript of Retrotransposon TYA Gag gene co-transcribed with TYB Pol, yeastyeast

Gene YHL009W-A, Length 1,242 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHL009W-AYHL009W-A MTC1P47018 478 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
YHL009W-AYHL009W-A FAP1P53971 965 aa16.18■□□□□ 0.18
YHL009W-AYHL009W-A PRY3P47033 881 aa15.29■□□□□ 0.04
YHL009W-AYHL009W-A AAD16Q02895 342 aa14.71□□□□□ -0.05
YHL009W-AYHL009W-A PRI1P10363 409 aa14.67□□□□□ -0.06
YHL009W-AYHL009W-A DRS1P32892 752 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
YHL009W-AYHL009W-A YCK3P39962 524 aa14.52□□□□□ -0.09
YHL009W-AYHL009W-A HAA1Q12753 694 aaKnown RBP14.35□□□□□ -0.11
YHL009W-AYHL009W-A ISW2Q08773 1120 aa13.97□□□□□ -0.17
YHL009W-AYHL009W-A RPG1P38249 964 aaKnown RBP13.83□□□□□ -0.2
YHL009W-AYHL009W-A TSR3Q12094 313 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
YHL009W-AYHL009W-A MRPL32P25348 183 aa13.21□□□□□ -0.29
YHL009W-AYHL009W-A YGL015CP33199 130 aa13.04□□□□□ -0.32
YHL009W-AYHL009W-A DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
YHL009W-AYHL009W-A RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
YHL009W-AYHL009W-A BUD31P25337 157 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
YHL009W-AYHL009W-A REB1P21538 810 aa12.49□□□□□ -0.41
YHL009W-AYHL009W-A RPL17AP05740 184 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
YHL009W-AYHL009W-A RPL17BP46990 184 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
YHL009W-AYHL009W-A CDC27P38042 758 aa12.36□□□□□ -0.43
YHL009W-AYHL009W-A AVT3P36062 692 aa12.3□□□□□ -0.44
YHL009W-AYHL009W-A UBP10P53874 792 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
YHL009W-AYHL009W-A MAP2P38174 421 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
YHL009W-AYHL009W-A YKR023WP36119 530 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
YHL009W-AYHL009W-A SPT21P35209 758 aa11.93□□□□□ -0.5
YHL009W-AYHL009W-A BFR2Q06631 534 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
YHL009W-AYHL009W-A TFC8Q12308 588 aa11.79□□□□□ -0.52
YHL009W-AYHL009W-A SIS1P25294 352 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
YHL009W-AYHL009W-A HOP09932 586 aa11.72□□□□□ -0.53
YHL009W-AYHL009W-A DCD1P06773 312 aa11.7□□□□□ -0.54
YHL009W-AYHL009W-A TIF4632P39936 914 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
YHL009W-AYHL009W-A TGL3P40308 642 aa11.68□□□□□ -0.54
YHL009W-AYHL009W-A UBP9P39967 754 aa11.66□□□□□ -0.54
YHL009W-AYHL009W-A SCY1P53009 804 aa11.62□□□□□ -0.55
YHL009W-AYHL009W-A SLX5P32828 619 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
YHL009W-AYHL009W-A BCH2P36122 765 aa11.34□□□□□ -0.59
YHL009W-AYHL009W-A RIM101P33400 625 aa11.21□□□□□ -0.61
YHL009W-AYHL009W-A MST1P07236 462 aa11.1□□□□□ -0.63
YHL009W-AYHL009W-A YBL029C-AQ3E756 94 aa11.02□□□□□ -0.65
YHL009W-AYHL009W-A BDF1P35817 686 aa10.96□□□□□ -0.65
YHL009W-AYHL009W-A EPS1P40557 701 aa10.96□□□□□ -0.65
YHL009W-AYHL009W-A YOR238WQ08634 303 aa10.91□□□□□ -0.66
YHL009W-AYHL009W-A NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data10.89□□□□□ -0.67not detected
YHL009W-AYHL009W-A VNX1P42839 908 aa10.88□□□□□ -0.67
YHL009W-AYHL009W-A OXP1P28273 1286 aa10.79□□□□□ -0.68
YHL009W-AYHL009W-A SPP1Q03012 353 aa10.74□□□□□ -0.69
YHL009W-AYHL009W-A PTP3P40048 928 aa10.72□□□□□ -0.69
YHL009W-AYHL009W-A YIL055CP40523 627 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
YHL009W-AYHL009W-A AIR2Q12476 344 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
YHL009W-AYHL009W-A FKH1P40466 484 aa10.68□□□□□ -0.7
YHL009W-AYHL009W-A YAP5P40574 245 aa10.68□□□□□ -0.7
YHL009W-AYHL009W-A WSC3Q12215 556 aa10.61□□□□□ -0.71
YHL009W-AYHL009W-A TIF11P38912 153 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
YHL009W-AYHL009W-A YJL171CP46992 396 aa10.59□□□□□ -0.71
YHL009W-AYHL009W-A BBC1P47068 1157 aa10.54□□□□□ -0.72
YHL009W-AYHL009W-A RSM7P47150 247 aa10.51□□□□□ -0.73
YHL009W-AYHL009W-A AI2P03876 854 aa10.46□□□□□ -0.73
YHL009W-AYHL009W-A YAH1Q12184 172 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
YHL009W-AYHL009W-A GTT3P39996 337 aa10.43□□□□□ -0.74
YHL009W-AYHL009W-A LDB19Q12502 818 aa10.42□□□□□ -0.74
YHL009W-AYHL009W-A IOC2Q12072 812 aa10.4□□□□□ -0.74
YHL009W-AYHL009W-A BMT6Q12291 365 aa10.39□□□□□ -0.75
YHL009W-AYHL009W-A ULI1P43604 169 aa10.36□□□□□ -0.75
YHL009W-AYHL009W-A TFA1P36100 482 aa10.23□□□□□ -0.77
YHL009W-AYHL009W-A MSB4Q12317 492 aa10.23□□□□□ -0.77
YHL009W-AYHL009W-A YLR271WQ06152 274 aa10.22□□□□□ -0.77
YHL009W-AYHL009W-A EAP1P36041 632 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
YHL009W-AYHL009W-A PIB1Q06651 286 aa10.17□□□□□ -0.78
YHL009W-AYHL009W-A RTG1P32607 177 aa10.12□□□□□ -0.79
YHL009W-AYHL009W-A PSD2P53037 1138 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
YHL009W-AYHL009W-A YOL036WQ08206 761 aa10.07□□□□□ -0.8
YHL009W-AYHL009W-A NCR1Q12200 1170 aa10.07□□□□□ -0.8
YHL009W-AYHL009W-A TRP5P00931 707 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
YHL009W-AYHL009W-A MRM1P25270 412 aa10.06□□□□□ -0.8
YHL009W-AYHL009W-A SEC61P32915 480 aa10.04□□□□□ -0.8
YHL009W-AYHL009W-A YNL035CP53962 389 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
YHL009W-AYHL009W-A SET4P42948 560 aa10.02□□□□□ -0.81
YHL009W-AYHL009W-A ARP8Q12386 881 aaKnown RBP RIP-Chip data10□□□□□ -0.81not detected
YHL009W-AYHL009W-A SSP1P38871 571 aa9.96□□□□□ -0.82
YHL009W-AYHL009W-A BCK2P33306 851 aa9.89□□□□□ -0.83
YHL009W-AYHL009W-A YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data9.89□□□□□ -0.83not detected
YHL009W-AYHL009W-A SAM3Q08986 587 aa9.89□□□□□ -0.83
YHL009W-AYHL009W-A VMA1P17255 1071 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
YHL009W-AYHL009W-A DBP1P24784 617 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
YHL009W-AYHL009W-A VPS29P38759 282 aa9.84□□□□□ -0.83
YHL009W-AYHL009W-A TFG1P41895 735 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
YHL009W-AYHL009W-A DAN4P47179 1161 aa9.83□□□□□ -0.84
YHL009W-AYHL009W-A CST9Q06032 482 aa9.82□□□□□ -0.84
YHL009W-AYHL009W-A RTG3P38165 486 aa9.81□□□□□ -0.84
YHL009W-AYHL009W-A YFR006WP43590 535 aa9.81□□□□□ -0.84
YHL009W-AYHL009W-A CHL1P22516 861 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
YHL009W-AYHL009W-A SAP30P38429 201 aa9.8□□□□□ -0.84
YHL009W-AYHL009W-A MGA2P40578 1113 aa9.79□□□□□ -0.84
YHL009W-AYHL009W-A JIP4Q03361 876 aa9.78□□□□□ -0.84
YHL009W-AYHL009W-A STS1P38637 319 aa9.77□□□□□ -0.85
YHL009W-AYHL009W-A YDL129WQ07555 291 aa9.77□□□□□ -0.85
YHL009W-AYHL009W-A PRE3P38624 215 aa9.74□□□□□ -0.85
YHL009W-AYHL009W-A ABP1P15891 592 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
YHL009W-AYHL009W-A RCR1P38212 213 aa9.64□□□□□ -0.87
YHL009W-AYHL009W-A GYP5Q12344 894 aa9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.7 ms