RNA–Protein interactions for RNA: YGL239C

YGL239C, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YGL239C, Length 315 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YGL239C	YGL239C	FAP1	P53971	965 aa		9.93	□□□□□ -0.82
YGL239C	YGL239C	PRY3	P47033	881 aa		9.5	□□□□□ -0.89
YGL239C	YGL239C	YCK3	P39962	524 aa		9.1	□□□□□ -0.95
YGL239C	YGL239C	HAA1	Q12753	694 aa	Known RBP	8.69	□□□□□ -1.02
YGL239C	YGL239C	AAD16	Q02895	342 aa		8.3	□□□□□ -1.08
YGL239C	YGL239C	MTC1	P47018	478 aa	Known RBP	8.18	□□□□□ -1.1
YGL239C	YGL239C	BUD31	P25337	157 aa	Predicted RBP	8.17	□□□□□ -1.1
YGL239C	YGL239C	PRI1	P10363	409 aa		8.07	□□□□□ -1.12
YGL239C	YGL239C	DRS1	P32892	752 aa	Known RBP	8.03	□□□□□ -1.12
YGL239C	YGL239C	YGL015C	P33199	130 aa		7.55	□□□□□ -1.2
YGL239C	YGL239C	TSR3	Q12094	313 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
YGL239C	YGL239C	SIS1	P25294	352 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
YGL239C	YGL239C	MRPL32	P25348	183 aa		7.11	□□□□□ -1.27
YGL239C	YGL239C	RPG1	P38249	964 aa	Known RBP	7.04	□□□□□ -1.28
YGL239C	YGL239C	ISW2	Q08773	1120 aa		6.94	□□□□□ -1.3
YGL239C	YGL239C	DIP2	Q12220	943 aa	Predicted RBP	6.9	□□□□□ -1.3
YGL239C	YGL239C	BFR2	Q06631	534 aa	Known RBP	6.85	□□□□□ -1.31
YGL239C	YGL239C	UBP9	P39967	754 aa		6.77	□□□□□ -1.33
YGL239C	YGL239C	AVT3	P36062	692 aa		6.73	□□□□□ -1.33
YGL239C	YGL239C	RSE1	Q04693	1361 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
YGL239C	YGL239C	RGA2	Q06407	1009 aa		6.51	□□□□□ -1.37
YGL239C	YGL239C	MAP2	P38174	421 aa	Known RBP	6.5	□□□□□ -1.37
YGL239C	YGL239C	UBP10	P53874	792 aa	Predicted RBP	6.47	□□□□□ -1.37
YGL239C	YGL239C	CDC27	P38042	758 aa		6.44	□□□□□ -1.38
YGL239C	YGL239C	RPL17A	P05740	184 aa	Known RBP	6.36	□□□□□ -1.39
YGL239C	YGL239C	RPL17B	P46990	184 aa	Known RBP	6.36	□□□□□ -1.39
YGL239C	YGL239C	REB1	P21538	810 aa		6.31	□□□□□ -1.4
YGL239C	YGL239C	TFA1	P36100	482 aa		6.24	□□□□□ -1.41
YGL239C	YGL239C	TGL3	P40308	642 aa		6.23	□□□□□ -1.41
YGL239C	YGL239C	TIF4632	P39936	914 aa	Known RBP	6.15	□□□□□ -1.42
YGL239C	YGL239C	SPT21	P35209	758 aa		6.06	□□□□□ -1.44
YGL239C	YGL239C	YBL029C-A	Q3E756	94 aa		6.06	□□□□□ -1.44
YGL239C	YGL239C	AIR2	Q12476	344 aa	Known RBP	6.02	□□□□□ -1.45
YGL239C	YGL239C	YJL171C	P46992	396 aa		5.96	□□□□□ -1.46
YGL239C	YGL239C	YKR023W	P36119	530 aa	Known RBP	5.94	□□□□□ -1.46
YGL239C	YGL239C	RIM101	P33400	625 aa		5.93	□□□□□ -1.46
YGL239C	YGL239C	SLX5	P32828	619 aa	Known RBP	5.9	□□□□□ -1.46
YGL239C	YGL239C	FKH1	P40466	484 aa		5.88	□□□□□ -1.47
YGL239C	YGL239C	SCY1	P53009	804 aa		5.87	□□□□□ -1.47
YGL239C	YGL239C	HO	P09932	586 aa		5.85	□□□□□ -1.47
YGL239C	YGL239C	VNX1	P42839	908 aa		5.85	□□□□□ -1.47
YGL239C	YGL239C	RGA1	P39083	1007 aa		5.83	□□□□□ -1.48
YGL239C	YGL239C	DCD1	P06773	312 aa		5.82	□□□□□ -1.48
YGL239C	YGL239C	TFC8	Q12308	588 aa		5.82	□□□□□ -1.48
YGL239C	YGL239C	OXP1	P28273	1286 aa		5.76	□□□□□ -1.49
YGL239C	YGL239C	SPP1	Q03012	353 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YGL239C	YGL239C	MST1	P07236	462 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YGL239C	YGL239C	YIL055C	P40523	627 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
YGL239C	YGL239C	PTP3	P40048	928 aa		5.69	□□□□□ -1.5
YGL239C	YGL239C	YAH1	Q12184	172 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
YGL239C	YGL239C	BMT6	Q12291	365 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YGL239C	YGL239C	BCH2	P36122	765 aa		5.64	□□□□□ -1.51
YGL239C	YGL239C	RSM7	P47150	247 aa		5.6	□□□□□ -1.51
YGL239C	YGL239C	SSP1	P38871	571 aa		5.58	□□□□□ -1.52
YGL239C	YGL239C	YLR271W	Q06152	274 aa		5.56	□□□□□ -1.52
YGL239C	YGL239C	EPS1	P40557	701 aa		5.53	□□□□□ -1.52
YGL239C	YGL239C	ARP8	Q12386	881 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.53	□□□□□ -1.52	not detected
YGL239C	YGL239C	AI2	P03876	854 aa		5.52	□□□□□ -1.53
YGL239C	YGL239C	WSC3	Q12215	556 aa		5.52	□□□□□ -1.53
YGL239C	YGL239C	BBC1	P47068	1157 aa		5.5	□□□□□ -1.53
YGL239C	YGL239C	BDF1	P35817	686 aa		5.49	□□□□□ -1.53
YGL239C	YGL239C	TIF11	P38912	153 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
YGL239C	YGL239C	YOR238W	Q08634	303 aa		5.47	□□□□□ -1.53
YGL239C	YGL239C	LDB19	Q12502	818 aa		5.46	□□□□□ -1.54
YGL239C	YGL239C	PSD2	P53037	1138 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
YGL239C	YGL239C	MGA2	P40578	1113 aa		5.41	□□□□□ -1.54
YGL239C	YGL239C	CST9	Q06032	482 aa		5.4	□□□□□ -1.54
YGL239C	YGL239C	MRM1	P25270	412 aa		5.35	□□□□□ -1.55
YGL239C	YGL239C	BCK2	P33306	851 aa		5.35	□□□□□ -1.55
YGL239C	YGL239C	IOC2	Q12072	812 aa		5.34	□□□□□ -1.55
YGL239C	YGL239C	RTG3	P38165	486 aa		5.25	□□□□□ -1.57
YGL239C	YGL239C	ULI1	P43604	169 aa		5.25	□□□□□ -1.57
YGL239C	YGL239C	RCR1	P38212	213 aa		5.24	□□□□□ -1.57
YGL239C	YGL239C	YAP5	P40574	245 aa		5.22	□□□□□ -1.57
YGL239C	YGL239C	NSR1	P27476	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.21	□□□□□ -1.58	not detected
YGL239C	YGL239C	VPS29	P38759	282 aa		5.2	□□□□□ -1.58
YGL239C	YGL239C	PIB1	Q06651	286 aa		5.2	□□□□□ -1.58
YGL239C	YGL239C	YMR1	P47147	688 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.18	□□□□□ -1.58	not detected
YGL239C	YGL239C	YFR006W	P43590	535 aa		5.17	□□□□□ -1.58
YGL239C	YGL239C	DBP1	P24784	617 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
YGL239C	YGL239C	GTT3	P39996	337 aa		5.16	□□□□□ -1.58
YGL239C	YGL239C	RAM2	P29703	316 aa		5.15	□□□□□ -1.59
YGL239C	YGL239C	SRC1	Q03707	834 aa		5.15	□□□□□ -1.59
YGL239C	YGL239C	STS1	P38637	319 aa		5.14	□□□□□ -1.59
YGL239C	YGL239C	DMA1	P38823	416 aa		5.1	□□□□□ -1.59
YGL239C	YGL239C	RTG1	P32607	177 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YGL239C	YGL239C	DPS1	P04802	557 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
YGL239C	YGL239C	MAK11	P20484	414 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
YGL239C	YGL239C	NCR1	Q12200	1170 aa		5.07	□□□□□ -1.6
YGL239C	YGL239C	MIF2	P35201	549 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YGL239C	YGL239C	VMA1	P17255	1071 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
YGL239C	YGL239C	RQC2	Q12532	1038 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
YGL239C	YGL239C	XDJ1	P39102	459 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YGL239C	YGL239C	COQ8	P27697	501 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YGL239C	YGL239C	EAP1	P36041	632 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
YGL239C	YGL239C	EDS1	P38073	919 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YGL239C	YGL239C	SET4	P42948	560 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YGL239C	YGL239C	SET1	P38827	1080 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
YGL239C	YGL239C	YOL036W	Q08206	761 aa		5	□□□□□ -1.61
YGL239C	YGL239C	SAM3	Q08986	587 aa		4.99	□□□□□ -1.61

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.3 ms