RNA–Protein interactions for RNA: YBR003W

COQ1, Transcript of Hexaprenyl pyrophosphate synthetase, yeastyeast

Gene COQ1, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
COQ1YBR003W MTC1P47018 478 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
COQ1YBR003W FAP1P53971 965 aa12.39□□□□□ -0.43
COQ1YBR003W DRS1P32892 752 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
COQ1YBR003W SGS1P35187 1447 aa12.02□□□□□ -0.48
COQ1YBR003W INO80P53115 1489 aa11.85□□□□□ -0.51
COQ1YBR003W TCB3Q03640 1545 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
COQ1YBR003W MON2P48563 1636 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
COQ1YBR003W PRY3P47033 881 aa11.68□□□□□ -0.54
COQ1YBR003W TY1B-DR4Q07793 1604 aa11.66□□□□□ -0.54
COQ1YBR003W PRI1P10363 409 aa11.44□□□□□ -0.58
COQ1YBR003W SPA2P23201 1466 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
COQ1YBR003W SWR1Q05471 1514 aa11.44□□□□□ -0.58
COQ1YBR003W SSN2P38931 1420 aa11.42□□□□□ -0.58
COQ1YBR003W AAD16Q02895 342 aa11.41□□□□□ -0.58
COQ1YBR003W HSL1P34244 1518 aa11.4□□□□□ -0.58
COQ1YBR003W SPT6P23615 1451 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
COQ1YBR003W HIR3P47171 1648 aa11.19□□□□□ -0.62
COQ1YBR003W DNA2P38859 1522 aa11.14□□□□□ -0.63
COQ1YBR003W YCK3P39962 524 aa11.1□□□□□ -0.63
COQ1YBR003W KOG1P38873 1557 aa11.1□□□□□ -0.63
COQ1YBR003W ISW2Q08773 1120 aa11.09□□□□□ -0.63
COQ1YBR003W XRN1P22147 1528 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
COQ1YBR003W RPG1P38249 964 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
COQ1YBR003W REV3P14284 1504 aa10.94□□□□□ -0.66
COQ1YBR003W HAA1Q12753 694 aaKnown RBP10.91□□□□□ -0.66
COQ1YBR003W THO2P53552 1597 aaKnown RBP10.86□□□□□ -0.67
COQ1YBR003W SIN3P22579 1536 aa10.85□□□□□ -0.67
COQ1YBR003W BUD4P47136 1447 aa10.82□□□□□ -0.68
COQ1YBR003W TSR3Q12094 313 aaKnown RBP10.81□□□□□ -0.68
COQ1YBR003W SSK2P53599 1579 aa10.79□□□□□ -0.68
COQ1YBR003W ECM5Q03214 1411 aa10.79□□□□□ -0.68
COQ1YBR003W TAF2P23255 1407 aa10.77□□□□□ -0.69
COQ1YBR003W ATG2P53855 1592 aa10.73□□□□□ -0.69
COQ1YBR003W ESP1Q03018 1630 aa10.72□□□□□ -0.69
COQ1YBR003W DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
COQ1YBR003W MDS3P53094 1487 aa10.67□□□□□ -0.7
COQ1YBR003W MYO2P19524 1574 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
COQ1YBR003W PEP1P32319 1579 aa10.64□□□□□ -0.71
COQ1YBR003W SKI3P17883 1432 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
COQ1YBR003W YPK9Q12697 1472 aa10.53□□□□□ -0.72
COQ1YBR003W SCC2Q04002 1493 aa10.45□□□□□ -0.74
COQ1YBR003W RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
COQ1YBR003W POL1P13382 1468 aa10.43□□□□□ -0.74
COQ1YBR003W RPO31P04051 1460 aa10.39□□□□□ -0.75
COQ1YBR003W UFD4P33202 1483 aa10.38□□□□□ -0.75
COQ1YBR003W STU1P38198 1513 aa10.38□□□□□ -0.75
COQ1YBR003W RKR1Q04781 1562 aa10.36□□□□□ -0.75
COQ1YBR003W BPT1P14772 1559 aa10.34□□□□□ -0.75
COQ1YBR003W TY2B-LR1P0C2J3 1770 aa10.33□□□□□ -0.76
COQ1YBR003W TY2B-FP0CX63 1770 aa10.33□□□□□ -0.76
COQ1YBR003W TY2B-GR2P0CX64 1770 aa10.33□□□□□ -0.76
COQ1YBR003W TY2B-CP25384 1770 aa10.33□□□□□ -0.76
COQ1YBR003W TY2B-DR2Q03494 1770 aa10.33□□□□□ -0.76
COQ1YBR003W TY1B-DR1Q03855 1755 aa10.33□□□□□ -0.76
COQ1YBR003W TY2B-DR3Q07791 1770 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
COQ1YBR003W TY2B-OR1Q12113 1770 aa10.33□□□□□ -0.76
COQ1YBR003W TY2B-DR1Q12472 1770 aa10.33□□□□□ -0.76
COQ1YBR003W TY2B-OR2Q12501 1770 aa10.33□□□□□ -0.76
COQ1YBR003W MRPL32P25348 183 aa10.33□□□□□ -0.76
COQ1YBR003W YCF1P39109 1515 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
COQ1YBR003W TOP2P06786 1428 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
COQ1YBR003W YOR1P53049 1477 aa10.29□□□□□ -0.76
COQ1YBR003W TY1B-DR3Q99231 1755 aa10.27□□□□□ -0.77
COQ1YBR003W TY2B-BQ12491 1770 aa10.24□□□□□ -0.77
COQ1YBR003W YTA7P40340 1379 aa10.24□□□□□ -0.77
COQ1YBR003W AVT3P36062 692 aa10.24□□□□□ -0.77
COQ1YBR003W CHD1P32657 1468 aa10.22□□□□□ -0.77
COQ1YBR003W SMC4Q12267 1418 aa10.22□□□□□ -0.77
COQ1YBR003W MMS22Q06164 1454 aa10.2□□□□□ -0.78
COQ1YBR003W TY1B-BRQ12193 1756 aa10.2□□□□□ -0.78
COQ1YBR003W TY1B-GR3Q12316 1755 aa10.2□□□□□ -0.78
COQ1YBR003W TY1B-ORQ92393 1755 aa10.2□□□□□ -0.78
COQ1YBR003W MYO4P32492 1471 aa10.18□□□□□ -0.78
COQ1YBR003W TY1B-HO13535 1793 aa10.17□□□□□ -0.78
COQ1YBR003W TY1B-DR5P0C2I2 1755 aa10.17□□□□□ -0.78
COQ1YBR003W TY1B-DR6P0C2I3 1755 aa10.17□□□□□ -0.78
COQ1YBR003W TY1B-LR2P0C2I5 1755 aa10.17□□□□□ -0.78
COQ1YBR003W TY1B-LR3P0C2I6 1755 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
COQ1YBR003W TY1B-PR1P0C2I9 1755 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
COQ1YBR003W TY1B-PR2P0C2J0 1756 aa10.17□□□□□ -0.78
COQ1YBR003W TY1B-PR3P0C2J1 1755 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
COQ1YBR003W TY1B-JR1P47098 1755 aa10.17□□□□□ -0.78
COQ1YBR003W TY1B-ML2Q03434 1755 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
COQ1YBR003W TY1B-ER1Q03612 1755 aa10.17□□□□□ -0.78
COQ1YBR003W TY1B-ML1Q04711 1755 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
COQ1YBR003W TY1B-GR2Q12269 1755 aa10.17□□□□□ -0.78
COQ1YBR003W TY1B-OLQ12273 1755 aa10.17□□□□□ -0.78
COQ1YBR003W TY1B-PLQ12414 1755 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
COQ1YBR003W CDC25P04821 1589 aa10.15□□□□□ -0.78
COQ1YBR003W RPL17AP05740 184 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.79
COQ1YBR003W RPL17BP46990 184 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.79
COQ1YBR003W REB1P21538 810 aa10.11□□□□□ -0.79
COQ1YBR003W RQC2Q12532 1038 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
COQ1YBR003W ESC1Q03661 1658 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
COQ1YBR003W SPP41P38904 1435 aa10.07□□□□□ -0.8
COQ1YBR003W PAN1P32521 1480 aa10.07□□□□□ -0.8
COQ1YBR003W SAS10Q12136 610 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
COQ1YBR003W SNQ2P32568 1501 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
COQ1YBR003W MLP2P40457 1679 aa10.03□□□□□ -0.8
COQ1YBR003W YGL015CP33199 130 aa10.01□□□□□ -0.81
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