RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622542.1

KDM5DP1-201, Transcript of lysine demethylase 5D pseudogene 1, humanhuman

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Gene KDM5DP1, Length 298 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DP1-201ENST00000622542 NISCHQ9Y2I1 1504 aa21.73■■□□□ 1.07
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KDM5DP1-201ENST00000622542 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP19.22■□□□□ 0.67
KDM5DP1-201ENST00000622542 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa19.22■□□□□ 0.67
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KDM5DP1-201ENST00000622542 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa18.86■□□□□ 0.61
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KDM5DP1-201ENST00000622542 CECR2Q9BXF3 1484 aa18.6■□□□□ 0.57
KDM5DP1-201ENST00000622542 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa18.56■□□□□ 0.56
KDM5DP1-201ENST00000622542 MYO15BQ96JP2 1530 aa18.35■□□□□ 0.53
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KDM5DP1-201ENST00000622542 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa18.29■□□□□ 0.52
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KDM5DP1-201ENST00000622542 CUX2O14529 1486 aa17.99■□□□□ 0.47
KDM5DP1-201ENST00000622542 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
KDM5DP1-201ENST00000622542 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa17.85■□□□□ 0.45
KDM5DP1-201ENST00000622542 ERCC6Q03468 1493 aa17.79■□□□□ 0.44
KDM5DP1-201ENST00000622542 TRIM41Q8WV44 630 aa17.76■□□□□ 0.43
KDM5DP1-201ENST00000622542 NESP48681 1621 aa17.5■□□□□ 0.39
KDM5DP1-201ENST00000622542 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
KDM5DP1-201ENST00000622542 NCAPD3P42695 1498 aa17.45■□□□□ 0.38
KDM5DP1-201ENST00000622542 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa17.31■□□□□ 0.36
KDM5DP1-201ENST00000622542 SMARCA2P51531 1590 aa17.31■□□□□ 0.36
KDM5DP1-201ENST00000622542 HMGXB3Q12766 1538 aa17.26■□□□□ 0.35
KDM5DP1-201ENST00000622542 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa17.26■□□□□ 0.35
KDM5DP1-201ENST00000622542 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa17.19■□□□□ 0.34
KDM5DP1-201ENST00000622542 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
KDM5DP1-201ENST00000622542 SMARCA4P51532 1647 aa17.14■□□□□ 0.33
KDM5DP1-201ENST00000622542 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
KDM5DP1-201ENST00000622542 PDS5BQ9NTI5 1447 aa17.09■□□□□ 0.33
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KDM5DP1-201ENST00000622542 MRC2Q9UBG0 1479 aa17.02■□□□□ 0.32
KDM5DP1-201ENST00000622542 WDR62O43379 1518 aa17.01■□□□□ 0.31
KDM5DP1-201ENST00000622542 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa16.98■□□□□ 0.31
KDM5DP1-201ENST00000622542 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa16.98■□□□□ 0.31
KDM5DP1-201ENST00000622542 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa16.98■□□□□ 0.31
KDM5DP1-201ENST00000622542 PEG3Q9GZU2 1588 aa16.94■□□□□ 0.3
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KDM5DP1-201ENST00000622542 ARHGEF11O15085 1522 aa16.81■□□□□ 0.28
KDM5DP1-201ENST00000622542 CEP164Q9UPV0 1460 aa16.8■□□□□ 0.28
KDM5DP1-201ENST00000622542 TRHP20396 242 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
KDM5DP1-201ENST00000622542 MROH2BQ7Z745 1585 aa16.77■□□□□ 0.28
KDM5DP1-201ENST00000622542 CYB5RLQ6IPT4 315 aa16.73■□□□□ 0.27
KDM5DP1-201ENST00000622542 FANCD2Q9BXW9 1451 aa16.72■□□□□ 0.27
KDM5DP1-201ENST00000622542 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
KDM5DP1-201ENST00000622542 ARAP1Q96P48 1450 aa16.61■□□□□ 0.25
KDM5DP1-201ENST00000622542 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
KDM5DP1-201ENST00000622542 WIZO95785 1651 aa16.56■□□□□ 0.24
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KDM5DP1-201ENST00000622542 CHD1O14646 1710 aa16.5■□□□□ 0.23
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KDM5DP1-201ENST00000622542 IFT140Q96RY7 1462 aa16.48■□□□□ 0.23
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KDM5DP1-201ENST00000622542 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
KDM5DP1-201ENST00000622542 PRDM2Q13029 1718 aa16.36■□□□□ 0.21
KDM5DP1-201ENST00000622542 FBLN2P98095 1184 aa16.35■□□□□ 0.21
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KDM5DP1-201ENST00000622542 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
KDM5DP1-201ENST00000622542 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
KDM5DP1-201ENST00000622542 CLASP1Q7Z460 1538 aa16.25■□□□□ 0.19
KDM5DP1-201ENST00000622542 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
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KDM5DP1-201ENST00000622542 DNMBPQ6XZF7 1577 aa16.2■□□□□ 0.18
KDM5DP1-201ENST00000622542 ABCC8Q09428 1581 aa16.17■□□□□ 0.18
KDM5DP1-201ENST00000622542 SYNJ1O43426 1573 aa16.15■□□□□ 0.18
KDM5DP1-201ENST00000622542 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa16.14■□□□□ 0.17
KDM5DP1-201ENST00000622542 GAPVD1Q14C86 1478 aa16.12■□□□□ 0.17
KDM5DP1-201ENST00000622542 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
KDM5DP1-201ENST00000622542 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
KDM5DP1-201ENST00000622542 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa16.1■□□□□ 0.17
KDM5DP1-201ENST00000622542 CCDC88BA6NC98 1476 aa16.09■□□□□ 0.17
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KDM5DP1-201ENST00000622542 KIF13AQ9H1H9 1805 aa16.03■□□□□ 0.16
KDM5DP1-201ENST00000622542 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
KDM5DP1-201ENST00000622542 SOGA1O94964 1423 aa16.02■□□□□ 0.15
KDM5DP1-201ENST00000622542 ERCC6L2Q5T890 1561 aa16■□□□□ 0.15
KDM5DP1-201ENST00000622542 SYNJ2O15056 1496 aa15.98■□□□□ 0.15
KDM5DP1-201ENST00000622542 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa15.98■□□□□ 0.15
KDM5DP1-201ENST00000622542 WDR97A6NE52 1622 aa15.97■□□□□ 0.15
KDM5DP1-201ENST00000622542 GRIN2BQ13224 1484 aa15.95■□□□□ 0.14
KDM5DP1-201ENST00000622542 FGD5Q6ZNL6 1462 aa15.92■□□□□ 0.14
KDM5DP1-201ENST00000622542 PBRM1Q86U86 1689 aa15.9■□□□□ 0.14
KDM5DP1-201ENST00000622542 CEP170Q5SW79 1584 aa15.85■□□□□ 0.13
KDM5DP1-201ENST00000622542 KDM6BO15054 1643 aa15.8■□□□□ 0.12
KDM5DP1-201ENST00000622542 CUX1P39880 1505 aa15.8■□□□□ 0.12
KDM5DP1-201ENST00000622542 FAM69CQ0P6D2 419 aa15.8■□□□□ 0.12
KDM5DP1-201ENST00000622542 SHROOM2Q13796 1616 aa15.77■□□□□ 0.12
KDM5DP1-201ENST00000622542 ABCC10Q5T3U5 1492 aa15.77■□□□□ 0.11
KDM5DP1-201ENST00000622542 GRIN2AQ12879 1464 aa15.76■□□□□ 0.11
KDM5DP1-201ENST00000622542 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa15.75■□□□□ 0.11
KDM5DP1-201ENST00000622542 DIP2BQ9P265 1576 aa15.74■□□□□ 0.11
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KDM5DP1-201ENST00000622542 TSPOAP1O95153 1857 aa15.72■□□□□ 0.11
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