RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591061.5

POP4-210, Transcript of POP4 homolog, ribonuclease P/MRP subunit, humanhuman

TSL 4

Gene POP4, Length 502 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4-210ENST00000591061 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.95■■■□□ 2.55
POP4-210ENST00000591061 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.78■■■□□ 2.04
POP4-210ENST00000591061 ABCC9O60706 1549 aa27.75■■■□□ 2.03
POP4-210ENST00000591061 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.5■■□□□ 1.83
POP4-210ENST00000591061 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
POP4-210ENST00000591061 NACADO15069 1562 aa26.33■■□□□ 1.81
POP4-210ENST00000591061 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.19■■□□□ 1.78
POP4-210ENST00000591061 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.02■■□□□ 1.76
POP4-210ENST00000591061 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.01■■□□□ 1.75
POP4-210ENST00000591061 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.85■■□□□ 1.73
POP4-210ENST00000591061 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.73■■□□□ 1.71
POP4-210ENST00000591061 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.63■■□□□ 1.69
POP4-210ENST00000591061 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
POP4-210ENST00000591061 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.6■■□□□ 1.69
POP4-210ENST00000591061 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.59■■□□□ 1.69
POP4-210ENST00000591061 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.46■■□□□ 1.67
POP4-210ENST00000591061 SCRIBQ14160 1630 aa25.22■■□□□ 1.63
POP4-210ENST00000591061 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.08■■□□□ 1.6
POP4-210ENST00000591061 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.06■■□□□ 1.6
POP4-210ENST00000591061 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
POP4-210ENST00000591061 NCAPD3P42695 1498 aa24.32■■□□□ 1.48
POP4-210ENST00000591061 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.19■■□□□ 1.46
POP4-210ENST00000591061 SMARCA2P51531 1590 aa24.16■■□□□ 1.46
POP4-210ENST00000591061 SMARCA4P51532 1647 aa24.11■■□□□ 1.45
POP4-210ENST00000591061 HMGXB3Q12766 1538 aa24.1■■□□□ 1.45
POP4-210ENST00000591061 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
POP4-210ENST00000591061 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.06■■□□□ 1.44
POP4-210ENST00000591061 ERCC6Q03468 1493 aa24.05■■□□□ 1.44
POP4-210ENST00000591061 CUX2O14529 1486 aa24.04■■□□□ 1.44
POP4-210ENST00000591061 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
POP4-210ENST00000591061 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.93■■□□□ 1.42
POP4-210ENST00000591061 NESP48681 1621 aa23.79■■□□□ 1.4
POP4-210ENST00000591061 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.78■■□□□ 1.4
POP4-210ENST00000591061 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.75■■□□□ 1.39
POP4-210ENST00000591061 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.67■■□□□ 1.38
POP4-210ENST00000591061 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.58■■□□□ 1.37
POP4-210ENST00000591061 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
POP4-210ENST00000591061 WIZO95785 1651 aa23.47■■□□□ 1.35
POP4-210ENST00000591061 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.47■■□□□ 1.35
POP4-210ENST00000591061 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.39■■□□□ 1.34
POP4-210ENST00000591061 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
POP4-210ENST00000591061 WDR62O43379 1518 aa23.31■■□□□ 1.32
POP4-210ENST00000591061 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.3■■□□□ 1.32
POP4-210ENST00000591061 CFTRP13569 1480 aa23.28■■□□□ 1.32
POP4-210ENST00000591061 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.26■■□□□ 1.31
POP4-210ENST00000591061 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
POP4-210ENST00000591061 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
POP4-210ENST00000591061 OSCARQ8IYS5 282 aa23■■□□□ 1.27
POP4-210ENST00000591061 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.98■■□□□ 1.27
POP4-210ENST00000591061 PRDM2Q13029 1718 aa22.97■■□□□ 1.27
POP4-210ENST00000591061 TRIM41Q8WV44 630 aa22.93■■□□□ 1.26
POP4-210ENST00000591061 ABCC8Q09428 1581 aa22.89■■□□□ 1.26
POP4-210ENST00000591061 IFT140Q96RY7 1462 aa22.86■■□□□ 1.25
POP4-210ENST00000591061 TOPBP1Q92547 1522 aa22.8■■□□□ 1.24
POP4-210ENST00000591061 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.72■■□□□ 1.23
POP4-210ENST00000591061 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
POP4-210ENST00000591061 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
POP4-210ENST00000591061 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
POP4-210ENST00000591061 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
POP4-210ENST00000591061 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.55■■□□□ 1.22e-8■■■■■ 42.3
POP4-210ENST00000591061 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
POP4-210ENST00000591061 SOGA1O94964 1423 aa22.52■■□□□ 1.2
POP4-210ENST00000591061 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.52■■□□□ 1.2
POP4-210ENST00000591061 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.52■■□□□ 1.2
POP4-210ENST00000591061 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.52■■□□□ 1.2
POP4-210ENST00000591061 ARHGEF11O15085 1522 aa22.49■■□□□ 1.19
POP4-210ENST00000591061 FBLN2P98095 1184 aa22.48■■□□□ 1.19
POP4-210ENST00000591061 WDR97A6NE52 1622 aa22.46■■□□□ 1.19
POP4-210ENST00000591061 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.44■■□□□ 1.18
POP4-210ENST00000591061 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
POP4-210ENST00000591061 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
POP4-210ENST00000591061 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.41■■□□□ 1.18
POP4-210ENST00000591061 CHD1O14646 1710 aa22.4■■□□□ 1.18
POP4-210ENST00000591061 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.39■■□□□ 1.17
POP4-210ENST00000591061 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
POP4-210ENST00000591061 CUX1P39880 1505 aa22.36■■□□□ 1.17
POP4-210ENST00000591061 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
POP4-210ENST00000591061 GRIN2BQ13224 1484 aa22.33■■□□□ 1.16
POP4-210ENST00000591061 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.31■■□□□ 1.16
POP4-210ENST00000591061 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
POP4-210ENST00000591061 SYNJ1O43426 1573 aa22.25■■□□□ 1.15
POP4-210ENST00000591061 SYNJ2O15056 1496 aa22.24■■□□□ 1.15
POP4-210ENST00000591061 ARAP1Q96P48 1450 aa22.24■■□□□ 1.15
POP4-210ENST00000591061 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.23■■□□□ 1.15
POP4-210ENST00000591061 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.21■■□□□ 1.15
POP4-210ENST00000591061 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.19■■□□□ 1.14
POP4-210ENST00000591061 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
POP4-210ENST00000591061 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.14
POP4-210ENST00000591061 PBRM1Q86U86 1689 aa22.12■■□□□ 1.13
POP4-210ENST00000591061 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.09■■□□□ 1.13
POP4-210ENST00000591061 TOP2BQ02880 1626 aa22.03■■□□□ 1.12
POP4-210ENST00000591061 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.01■■□□□ 1.11
POP4-210ENST00000591061 GRIN2AQ12879 1464 aa22■■□□□ 1.11
POP4-210ENST00000591061 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.97■■□□□ 1.11
POP4-210ENST00000591061 NUP160Q12769 1436 aa21.94■■□□□ 1.1
POP4-210ENST00000591061 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.94■■□□□ 1.1
POP4-210ENST00000591061 ADAMTS12P58397 1594 aa21.93■■□□□ 1.1
POP4-210ENST00000591061 CEP170Q5SW79 1584 aa21.85■■□□□ 1.09
POP4-210ENST00000591061 SHROOM2Q13796 1616 aa21.8■■□□□ 1.08
POP4-210ENST00000591061 JPH4Q96JJ6 628 aa21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms