Protein–RNA interactions for Protein: Q86YN6

PPARGC1B, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1BQ86YN6 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC53,27■■■■■ 6,12
PPARGC1BQ86YN6 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52,51■■■■■ 6
PPARGC1BQ86YN6 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC51,96■■■■■ 5,91
PPARGC1BQ86YN6 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51,88■■■■■ 5,9
PPARGC1BQ86YN6 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51,56■■■■■ 5,84
PPARGC1BQ86YN6 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51,41■■■■■ 5,82
PPARGC1BQ86YN6 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC51,27■■■■■ 5,8
PPARGC1BQ86YN6 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC50,98■■■■■ 5,75
PPARGC1BQ86YN6 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC50,82■■■■■ 5,73
PPARGC1BQ86YN6 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC50,73■■■■■ 5,71
PPARGC1BQ86YN6 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC50,65■■■■■ 5,7
PPARGC1BQ86YN6 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC50,5■■■■■ 5,68
PPARGC1BQ86YN6 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC50,25■■■■■ 5,64
PPARGC1BQ86YN6 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC49,83■■■■■ 5,57
PPARGC1BQ86YN6 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,72■■■■■ 5,55
PPARGC1BQ86YN6 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49,7■■■■■ 5,55
PPARGC1BQ86YN6 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC49,64■■■■■ 5,54
PPARGC1BQ86YN6 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,39■■■■■ 5,5
PPARGC1BQ86YN6 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC49,31■■■■■ 5,48
PPARGC1BQ86YN6 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49,1■■■■■ 5,45
PPARGC1BQ86YN6 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC48,99■■■■■ 5,43
PPARGC1BQ86YN6 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48,99■■■■■ 5,43
PPARGC1BQ86YN6 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48,9■■■■■ 5,42
PPARGC1BQ86YN6 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48,74■■■■■ 5,39
PPARGC1BQ86YN6 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC48,73■■■■■ 5,39
PPARGC1BQ86YN6 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,7■■■■■ 5,39
PPARGC1BQ86YN6 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC48,51■■■■■ 5,36
PPARGC1BQ86YN6 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC48,46■■■■■ 5,35
PPARGC1BQ86YN6 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC48,43■■■■■ 5,34
PPARGC1BQ86YN6 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48,29■■■■■ 5,32
PPARGC1BQ86YN6 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,23■■■■■ 5,31
PPARGC1BQ86YN6 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48,07■■■■■ 5,29
PPARGC1BQ86YN6 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48,06■■■■■ 5,28
PPARGC1BQ86YN6 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC47,98■■■■■ 5,27
PPARGC1BQ86YN6 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC47,88■■■■■ 5,26
PPARGC1BQ86YN6 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC47,71■■■■■ 5,23
PPARGC1BQ86YN6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC47,65■■■■■ 5,22
PPARGC1BQ86YN6 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,63■■■■■ 5,22
PPARGC1BQ86YN6 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47,59■■■■■ 5,21
PPARGC1BQ86YN6 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,57■■■■■ 5,21
PPARGC1BQ86YN6 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47,56■■■■■ 5,2
PPARGC1BQ86YN6 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,56■■■■■ 5,2
PPARGC1BQ86YN6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,53■■■■■ 5,2
PPARGC1BQ86YN6 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,53■■■■■ 5,2
PPARGC1BQ86YN6 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC47,53■■■■■ 5,2
PPARGC1BQ86YN6 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,48■■■■■ 5,19
PPARGC1BQ86YN6 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC47,46■■■■■ 5,19
PPARGC1BQ86YN6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47,46■■■■■ 5,19
PPARGC1BQ86YN6 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,37■■■■■ 5,17
PPARGC1BQ86YN6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC47,36■■■■■ 5,17
PPARGC1BQ86YN6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC47,22■■■■■ 5,15
PPARGC1BQ86YN6 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC47,14■■■■■ 5,14
PPARGC1BQ86YN6 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46,99■■■■■ 5,11
PPARGC1BQ86YN6 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,95■■■■■ 5,11
PPARGC1BQ86YN6 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46,91■■■■■ 5,1
PPARGC1BQ86YN6 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,87■■■■■ 5,09
PPARGC1BQ86YN6 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,76■■■■■ 5,08
PPARGC1BQ86YN6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC46,64■■■■■ 5,06
PPARGC1BQ86YN6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46,62■■■■■ 5,05
PPARGC1BQ86YN6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,53■■■■■ 5,04
PPARGC1BQ86YN6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,39■■■■■ 5,02
PPARGC1BQ86YN6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC46,36■■■■■ 5,01
PPARGC1BQ86YN6 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,28■■■■■ 5
PPARGC1BQ86YN6 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC46,28■■■■■ 5
PPARGC1BQ86YN6 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46,25■■■■■ 4,99
PPARGC1BQ86YN6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46,19■■■■■ 4,99
PPARGC1BQ86YN6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46,17■■■■■ 4,98
PPARGC1BQ86YN6 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC46,13■■■■■ 4,97
PPARGC1BQ86YN6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,11■■■■■ 4,97
PPARGC1BQ86YN6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC46,08■■■■■ 4,97
PPARGC1BQ86YN6 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,06■■■■■ 4,96
PPARGC1BQ86YN6 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC46,06■■■■■ 4,96
PPARGC1BQ86YN6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC46,04■■■■■ 4,96
PPARGC1BQ86YN6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC46,04■■■■■ 4,96
PPARGC1BQ86YN6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,03■■■■■ 4,96
PPARGC1BQ86YN6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,01■■■■■ 4,96
PPARGC1BQ86YN6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC46■■■■■ 4,95
PPARGC1BQ86YN6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,99■■■■■ 4,95
PPARGC1BQ86YN6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC45,97■■■■■ 4,95
PPARGC1BQ86YN6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45,82■■■■■ 4,93
PPARGC1BQ86YN6 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45,79■■■■■ 4,92
PPARGC1BQ86YN6 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC45,72■■■■■ 4,91
PPARGC1BQ86YN6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,71■■■■■ 4,91
PPARGC1BQ86YN6 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,68■■■■■ 4,9
PPARGC1BQ86YN6 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,68■■■■■ 4,9
PPARGC1BQ86YN6 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45,63■■■■■ 4,9
PPARGC1BQ86YN6 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC45,62■■■■■ 4,89
PPARGC1BQ86YN6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,61■■■■■ 4,89
PPARGC1BQ86YN6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC45,61■■■■■ 4,89
PPARGC1BQ86YN6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC45,56■■■■■ 4,88
PPARGC1BQ86YN6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,52■■■■■ 4,88
PPARGC1BQ86YN6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC45,5■■■■■ 4,87
PPARGC1BQ86YN6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45,47■■■■■ 4,87
PPARGC1BQ86YN6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45,47■■■■■ 4,87
PPARGC1BQ86YN6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC45,45■■■■■ 4,87
PPARGC1BQ86YN6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC45,44■■■■■ 4,86
PPARGC1BQ86YN6 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC45,37■■■■■ 4,85
PPARGC1BQ86YN6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45,33■■■■■ 4,85
PPARGC1BQ86YN6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45,32■■■■■ 4,85
PPARGC1BQ86YN6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC45,31■■■■■ 4,84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16,3 ms