Protein–RNA interactions for Protein: Q86YN6

PPARGC1B, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1BQ86YN6 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC53.27■■■■■ 6.12
PPARGC1BQ86YN6 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.51■■■■■ 6
PPARGC1BQ86YN6 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC51.96■■■■■ 5.91
PPARGC1BQ86YN6 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.88■■■■■ 5.9
PPARGC1BQ86YN6 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.56■■■■■ 5.84
PPARGC1BQ86YN6 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.41■■■■■ 5.82
PPARGC1BQ86YN6 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC51.27■■■■■ 5.8
PPARGC1BQ86YN6 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC50.98■■■■■ 5.75
PPARGC1BQ86YN6 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC50.82■■■■■ 5.73
PPARGC1BQ86YN6 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC50.73■■■■■ 5.71
PPARGC1BQ86YN6 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC50.65■■■■■ 5.7
PPARGC1BQ86YN6 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC50.5■■■■■ 5.68
PPARGC1BQ86YN6 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC50.25■■■■■ 5.64
PPARGC1BQ86YN6 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC49.83■■■■■ 5.57
PPARGC1BQ86YN6 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.72■■■■■ 5.55
PPARGC1BQ86YN6 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.7■■■■■ 5.55
PPARGC1BQ86YN6 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC49.64■■■■■ 5.54
PPARGC1BQ86YN6 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.39■■■■■ 5.5
PPARGC1BQ86YN6 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC49.31■■■■■ 5.48
PPARGC1BQ86YN6 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.1■■■■■ 5.45
PPARGC1BQ86YN6 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC48.99■■■■■ 5.43
PPARGC1BQ86YN6 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.99■■■■■ 5.43
PPARGC1BQ86YN6 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.9■■■■■ 5.42
PPARGC1BQ86YN6 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.74■■■■■ 5.39
PPARGC1BQ86YN6 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC48.73■■■■■ 5.39
PPARGC1BQ86YN6 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.7■■■■■ 5.39
PPARGC1BQ86YN6 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC48.51■■■■■ 5.36
PPARGC1BQ86YN6 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC48.46■■■■■ 5.35
PPARGC1BQ86YN6 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC48.43■■■■■ 5.34
PPARGC1BQ86YN6 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.29■■■■■ 5.32
PPARGC1BQ86YN6 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.23■■■■■ 5.31
PPARGC1BQ86YN6 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.07■■■■■ 5.29
PPARGC1BQ86YN6 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.06■■■■■ 5.28
PPARGC1BQ86YN6 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC47.98■■■■■ 5.27
PPARGC1BQ86YN6 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC47.88■■■■■ 5.26
PPARGC1BQ86YN6 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC47.71■■■■■ 5.23
PPARGC1BQ86YN6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC47.65■■■■■ 5.22
PPARGC1BQ86YN6 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.63■■■■■ 5.22
PPARGC1BQ86YN6 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.59■■■■■ 5.21
PPARGC1BQ86YN6 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.57■■■■■ 5.21
PPARGC1BQ86YN6 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.56■■■■■ 5.2
PPARGC1BQ86YN6 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.56■■■■■ 5.2
PPARGC1BQ86YN6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.53■■■■■ 5.2
PPARGC1BQ86YN6 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.53■■■■■ 5.2
PPARGC1BQ86YN6 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC47.53■■■■■ 5.2
PPARGC1BQ86YN6 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.48■■■■■ 5.19
PPARGC1BQ86YN6 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC47.46■■■■■ 5.19
PPARGC1BQ86YN6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.46■■■■■ 5.19
PPARGC1BQ86YN6 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.37■■■■■ 5.17
PPARGC1BQ86YN6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC47.36■■■■■ 5.17
PPARGC1BQ86YN6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC47.22■■■■■ 5.15
PPARGC1BQ86YN6 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC47.14■■■■■ 5.14
PPARGC1BQ86YN6 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.99■■■■■ 5.11
PPARGC1BQ86YN6 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.95■■■■■ 5.11
PPARGC1BQ86YN6 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.91■■■■■ 5.1
PPARGC1BQ86YN6 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.87■■■■■ 5.09
PPARGC1BQ86YN6 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.76■■■■■ 5.08
PPARGC1BQ86YN6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC46.64■■■■■ 5.06
PPARGC1BQ86YN6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.62■■■■■ 5.05
PPARGC1BQ86YN6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.53■■■■■ 5.04
PPARGC1BQ86YN6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.39■■■■■ 5.02
PPARGC1BQ86YN6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC46.36■■■■■ 5.01
PPARGC1BQ86YN6 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.28■■■■■ 5
PPARGC1BQ86YN6 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC46.28■■■■■ 5
PPARGC1BQ86YN6 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.25■■■■■ 4.99
PPARGC1BQ86YN6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.19■■■■■ 4.99
PPARGC1BQ86YN6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.17■■■■■ 4.98
PPARGC1BQ86YN6 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC46.13■■■■■ 4.97
PPARGC1BQ86YN6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.11■■■■■ 4.97
PPARGC1BQ86YN6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC46.08■■■■■ 4.97
PPARGC1BQ86YN6 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.06■■■■■ 4.96
PPARGC1BQ86YN6 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC46.06■■■■■ 4.96
PPARGC1BQ86YN6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC46.04■■■■■ 4.96
PPARGC1BQ86YN6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC46.04■■■■■ 4.96
PPARGC1BQ86YN6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.03■■■■■ 4.96
PPARGC1BQ86YN6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.01■■■■■ 4.96
PPARGC1BQ86YN6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC46■■■■■ 4.95
PPARGC1BQ86YN6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.99■■■■■ 4.95
PPARGC1BQ86YN6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC45.97■■■■■ 4.95
PPARGC1BQ86YN6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.82■■■■■ 4.93
PPARGC1BQ86YN6 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.79■■■■■ 4.92
PPARGC1BQ86YN6 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC45.72■■■■■ 4.91
PPARGC1BQ86YN6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.71■■■■■ 4.91
PPARGC1BQ86YN6 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
PPARGC1BQ86YN6 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
PPARGC1BQ86YN6 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.63■■■■■ 4.9
PPARGC1BQ86YN6 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC45.62■■■■■ 4.89
PPARGC1BQ86YN6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.61■■■■■ 4.89
PPARGC1BQ86YN6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC45.61■■■■■ 4.89
PPARGC1BQ86YN6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC45.56■■■■■ 4.88
PPARGC1BQ86YN6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
PPARGC1BQ86YN6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC45.5■■■■■ 4.87
PPARGC1BQ86YN6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.47■■■■■ 4.87
PPARGC1BQ86YN6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.47■■■■■ 4.87
PPARGC1BQ86YN6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC45.45■■■■■ 4.87
PPARGC1BQ86YN6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC45.44■■■■■ 4.86
PPARGC1BQ86YN6 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC45.37■■■■■ 4.85
PPARGC1BQ86YN6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.33■■■■■ 4.85
PPARGC1BQ86YN6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.32■■■■■ 4.85
PPARGC1BQ86YN6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms