Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRY4

ARHGAP35, Rho GTPase-activating protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP35Q9NRY4 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC55.42■■■■■ 6.46
ARHGAP35Q9NRY4 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC54.2■■■■■ 6.27
ARHGAP35Q9NRY4 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.91■■■■■ 6.22
ARHGAP35Q9NRY4 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.69■■■■■ 6.19
ARHGAP35Q9NRY4 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.61■■■■■ 6.17
ARHGAP35Q9NRY4 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC53.52■■■■■ 6.16
ARHGAP35Q9NRY4 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC53.3■■■■■ 6.12
ARHGAP35Q9NRY4 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC53.29■■■■■ 6.12
ARHGAP35Q9NRY4 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC51.99■■■■■ 5.91
ARHGAP35Q9NRY4 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC51.92■■■■■ 5.9
ARHGAP35Q9NRY4 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.91■■■■■ 5.9
ARHGAP35Q9NRY4 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC51.89■■■■■ 5.9
ARHGAP35Q9NRY4 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC51.79■■■■■ 5.88
ARHGAP35Q9NRY4 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC51.71■■■■■ 5.87
ARHGAP35Q9NRY4 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC51.62■■■■■ 5.85
ARHGAP35Q9NRY4 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC51.48■■■■■ 5.83
ARHGAP35Q9NRY4 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC51.34■■■■■ 5.81
ARHGAP35Q9NRY4 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.12■■■■■ 5.77
ARHGAP35Q9NRY4 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC51.05■■■■■ 5.76
ARHGAP35Q9NRY4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.01■■■■■ 5.76
ARHGAP35Q9NRY4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC50.93■■■■■ 5.74
ARHGAP35Q9NRY4 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.87■■■■■ 5.73
ARHGAP35Q9NRY4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.77■■■■■ 5.72
ARHGAP35Q9NRY4 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.27■■■■■ 5.64
ARHGAP35Q9NRY4 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC50.27■■■■■ 5.64
ARHGAP35Q9NRY4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.2■■■■■ 5.63
ARHGAP35Q9NRY4 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.14■■■■■ 5.62
ARHGAP35Q9NRY4 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC50.07■■■■■ 5.61
ARHGAP35Q9NRY4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC50.01■■■■■ 5.6
ARHGAP35Q9NRY4 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.92■■■■■ 5.58
ARHGAP35Q9NRY4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC49.91■■■■■ 5.58
ARHGAP35Q9NRY4 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.63■■■■■ 5.54
ARHGAP35Q9NRY4 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC49.61■■■■■ 5.53
ARHGAP35Q9NRY4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.56■■■■■ 5.52
ARHGAP35Q9NRY4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.44■■■■■ 5.51
ARHGAP35Q9NRY4 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC49.44■■■■■ 5.51
ARHGAP35Q9NRY4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.31■■■■■ 5.48
ARHGAP35Q9NRY4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC49.23■■■■■ 5.47
ARHGAP35Q9NRY4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC49.22■■■■■ 5.47
ARHGAP35Q9NRY4 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.22■■■■■ 5.47
ARHGAP35Q9NRY4 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.1■■■■■ 5.45
ARHGAP35Q9NRY4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC49.05■■■■■ 5.44
ARHGAP35Q9NRY4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49■■■■■ 5.43
ARHGAP35Q9NRY4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC48.96■■■■■ 5.43
ARHGAP35Q9NRY4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC48.92■■■■■ 5.42
ARHGAP35Q9NRY4 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.61■■■■■ 5.37
ARHGAP35Q9NRY4 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC48.48■■■■■ 5.35
ARHGAP35Q9NRY4 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC48.43■■■■■ 5.34
ARHGAP35Q9NRY4 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.42■■■■■ 5.34
ARHGAP35Q9NRY4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC48.4■■■■■ 5.34
ARHGAP35Q9NRY4 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC48.35■■■■■ 5.33
ARHGAP35Q9NRY4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.31■■■■■ 5.32
ARHGAP35Q9NRY4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC48.31■■■■■ 5.32
ARHGAP35Q9NRY4 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC48.29■■■■■ 5.32
ARHGAP35Q9NRY4 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.11■■■■■ 5.29
ARHGAP35Q9NRY4 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC48.11■■■■■ 5.29
ARHGAP35Q9NRY4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC48.09■■■■■ 5.29
ARHGAP35Q9NRY4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.96■■■■■ 5.27
ARHGAP35Q9NRY4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.95■■■■■ 5.27
ARHGAP35Q9NRY4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC47.88■■■■■ 5.26
ARHGAP35Q9NRY4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC47.88■■■■■ 5.26
ARHGAP35Q9NRY4 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.86■■■■■ 5.25
ARHGAP35Q9NRY4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC47.84■■■■■ 5.25
ARHGAP35Q9NRY4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.84■■■■■ 5.25
ARHGAP35Q9NRY4 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC47.8■■■■■ 5.24
ARHGAP35Q9NRY4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC47.8■■■■■ 5.24
ARHGAP35Q9NRY4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC47.75■■■■■ 5.23
ARHGAP35Q9NRY4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC47.65■■■■■ 5.22
ARHGAP35Q9NRY4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC47.65■■■■■ 5.22
ARHGAP35Q9NRY4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.55■■■■■ 5.2
ARHGAP35Q9NRY4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC47.53■■■■■ 5.2
ARHGAP35Q9NRY4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.5■■■■■ 5.19
ARHGAP35Q9NRY4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.47■■■■■ 5.19
ARHGAP35Q9NRY4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC47.41■■■■■ 5.18
ARHGAP35Q9NRY4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC47.4■■■■■ 5.18
ARHGAP35Q9NRY4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC47.37■■■■■ 5.17
ARHGAP35Q9NRY4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC47.36■■■■■ 5.17
ARHGAP35Q9NRY4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.36■■■■■ 5.17
ARHGAP35Q9NRY4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC47.34■■■■■ 5.17
ARHGAP35Q9NRY4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC47.21■■■■■ 5.15
ARHGAP35Q9NRY4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC47.2■■■■■ 5.15
ARHGAP35Q9NRY4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC47.2■■■■■ 5.15
ARHGAP35Q9NRY4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.2■■■■■ 5.15
ARHGAP35Q9NRY4 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.14■■■■■ 5.14
ARHGAP35Q9NRY4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.11■■■■■ 5.13
ARHGAP35Q9NRY4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC47.1■■■■■ 5.13
ARHGAP35Q9NRY4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.09■■■■■ 5.13
ARHGAP35Q9NRY4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC47.09■■■■■ 5.13
ARHGAP35Q9NRY4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.05■■■■■ 5.12
ARHGAP35Q9NRY4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.03■■■■■ 5.12
ARHGAP35Q9NRY4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.03■■■■■ 5.12
ARHGAP35Q9NRY4 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47■■■■■ 5.11
ARHGAP35Q9NRY4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.99■■■■■ 5.11
ARHGAP35Q9NRY4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.99■■■■■ 5.11
ARHGAP35Q9NRY4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC46.97■■■■■ 5.11
ARHGAP35Q9NRY4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.89■■■■■ 5.1
ARHGAP35Q9NRY4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.87■■■■■ 5.09
ARHGAP35Q9NRY4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.86■■■■■ 5.09
ARHGAP35Q9NRY4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.85■■■■■ 5.09
ARHGAP35Q9NRY4 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC46.83■■■■■ 5.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms