RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554302.1

RCCD1-202, Transcript of RCC1 domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene RCCD1, Length 986 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCCD1-202ENST00000554302 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.8■■■■■ 6.36
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RCCD1-202ENST00000554302 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.64■■■■■ 5.06
RCCD1-202ENST00000554302 NACADO15069 1562 aa46.39■■■■■ 5.02
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RCCD1-202ENST00000554302 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.88■■■■■ 4.94
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RCCD1-202ENST00000554302 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.59■■■■■ 4.89
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RCCD1-202ENST00000554302 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.47■■■■■ 4.87
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RCCD1-202ENST00000554302 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.33■■■■■ 4.85
RCCD1-202ENST00000554302 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.77■■■■■ 4.76
RCCD1-202ENST00000554302 SCRIBQ14160 1630 aa44.68■■■■■ 4.74
RCCD1-202ENST00000554302 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.2■■■■■ 4.67
RCCD1-202ENST00000554302 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.17■■■■■ 4.66
RCCD1-202ENST00000554302 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.03■■■■■ 4.64
RCCD1-202ENST00000554302 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP44.02■■■■■ 4.64
RCCD1-202ENST00000554302 CHIC1Q5VXU3 224 aa43.65■■■■■ 4.58
RCCD1-202ENST00000554302 NCAPD3P42695 1498 aa42.86■■■■■ 4.45
RCCD1-202ENST00000554302 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.71■■■■■ 4.43
RCCD1-202ENST00000554302 SMARCA4P51532 1647 aa42.7■■■■■ 4.43
RCCD1-202ENST00000554302 SMARCA2P51531 1590 aa42.59■■■■■ 4.41
RCCD1-202ENST00000554302 HMGXB3Q12766 1538 aa42.53■■■■■ 4.4
RCCD1-202ENST00000554302 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.51■■■■■ 4.4
RCCD1-202ENST00000554302 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.35■■■■■ 4.37
RCCD1-202ENST00000554302 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.26■■■■■ 4.36
RCCD1-202ENST00000554302 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.21■■■■■ 4.35
RCCD1-202ENST00000554302 ERCC6Q03468 1493 aa42.16■■■■■ 4.34
RCCD1-202ENST00000554302 CUX2O14529 1486 aa42.12■■■■■ 4.33
RCCD1-202ENST00000554302 NESP48681 1621 aa42.06■■■■■ 4.32
RCCD1-202ENST00000554302 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.9■■■■■ 4.3
RCCD1-202ENST00000554302 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.83■■■■■ 4.29
RCCD1-202ENST00000554302 WIZO95785 1651 aa41.68■■■■■ 4.26
RCCD1-202ENST00000554302 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.63■■■■■ 4.26
RCCD1-202ENST00000554302 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.56■■■■■ 4.24
RCCD1-202ENST00000554302 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.52■■■■■ 4.24
RCCD1-202ENST00000554302 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.52■■■■■ 4.24
RCCD1-202ENST00000554302 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.41■■■■■ 4.22
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RCCD1-202ENST00000554302 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.19■■■■■ 4.18
RCCD1-202ENST00000554302 WDR62O43379 1518 aa41.12■■■■■ 4.17
RCCD1-202ENST00000554302 CFTRP13569 1480 aa41.11■■■■■ 4.17
RCCD1-202ENST00000554302 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.04■■■■■ 4.16
RCCD1-202ENST00000554302 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.02■■■■■ 4.16
RCCD1-202ENST00000554302 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.73■■■■■ 4.11
RCCD1-202ENST00000554302 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.7■■■■■ 4.11
RCCD1-202ENST00000554302 PRDM2Q13029 1718 aa40.67■■■■■ 4.1
RCCD1-202ENST00000554302 TOPBP1Q92547 1522 aa40.27■■■■■ 4.04
RCCD1-202ENST00000554302 IFT140Q96RY7 1462 aa40.25■■■■■ 4.03
RCCD1-202ENST00000554302 ABCC8Q09428 1581 aa40.23■■■■■ 4.03
RCCD1-202ENST00000554302 OSCARQ8IYS5 282 aa40.18■■■■■ 4.02
RCCD1-202ENST00000554302 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.15■■■■■ 4.02
RCCD1-202ENST00000554302 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.15■■■■■ 4.02
RCCD1-202ENST00000554302 TRIM41Q8WV44 630 aa40■■■■□ 3.99
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RCCD1-202ENST00000554302 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.65■■■■□ 3.94
RCCD1-202ENST00000554302 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.65■■■■□ 3.94
RCCD1-202ENST00000554302 CUX1P39880 1505 aa39.65■■■■□ 3.94
RCCD1-202ENST00000554302 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.63■■■■□ 3.94
RCCD1-202ENST00000554302 CHD1O14646 1710 aa39.58■■■■□ 3.93
RCCD1-202ENST00000554302 WDR97A6NE52 1622 aa39.57■■■■□ 3.92
RCCD1-202ENST00000554302 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.57■■■■□ 3.92
RCCD1-202ENST00000554302 ARHGEF11O15085 1522 aa39.55■■■■□ 3.92
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RCCD1-202ENST00000554302 GRIN2BQ13224 1484 aa39.33■■■■□ 3.89
RCCD1-202ENST00000554302 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.33■■■■□ 3.89
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RCCD1-202ENST00000554302 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.2■■■■□ 3.87
RCCD1-202ENST00000554302 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.2■■■■□ 3.87
RCCD1-202ENST00000554302 SYNJ2O15056 1496 aa39.19■■■■□ 3.86
RCCD1-202ENST00000554302 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.19■■■■□ 3.86
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RCCD1-202ENST00000554302 PBRM1Q86U86 1689 aa39.16■■■■□ 3.86
RCCD1-202ENST00000554302 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.16■■■■□ 3.86
RCCD1-202ENST00000554302 SYNJ1O43426 1573 aa39.14■■■■□ 3.86
RCCD1-202ENST00000554302 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.07■■■■□ 3.85
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RCCD1-202ENST00000554302 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.06■■■■□ 3.84
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RCCD1-202ENST00000554302 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.73■■■■□ 3.79
RCCD1-202ENST00000554302 NUP160Q12769 1436 aa38.73■■■■□ 3.79
RCCD1-202ENST00000554302 CEP170Q5SW79 1584 aa38.69■■■■□ 3.78
RCCD1-202ENST00000554302 TRHP20396 242 aaPredicted RBP38.65■■■■□ 3.78
RCCD1-202ENST00000554302 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.57■■■■□ 3.76
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RCCD1-202ENST00000554302 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP38.41■■■■□ 3.74
RCCD1-202ENST00000554302 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.29■■■■□ 3.72
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