RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534376.1

NHSL1-209, Transcript of NHS like 1, humanhuman

TSL 3

Gene NHSL1, Length 609 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1-209ENST00000534376 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.67■■■□□ 2.5
NHSL1-209ENST00000534376 ABCC9O60706 1549 aa27.58■■■□□ 2.01
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NHSL1-209ENST00000534376 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
NHSL1-209ENST00000534376 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.2■■□□□ 1.78
NHSL1-209ENST00000534376 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.02■■□□□ 1.76
NHSL1-209ENST00000534376 NACADO15069 1562 aa26■■□□□ 1.75
NHSL1-209ENST00000534376 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.87■■□□□ 1.73
NHSL1-209ENST00000534376 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.72■■□□□ 1.71
NHSL1-209ENST00000534376 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.6■■□□□ 1.69
NHSL1-209ENST00000534376 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.57■■□□□ 1.68
NHSL1-209ENST00000534376 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.42■■□□□ 1.66
NHSL1-209ENST00000534376 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
NHSL1-209ENST00000534376 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.28■■□□□ 1.64
NHSL1-209ENST00000534376 SCRIBQ14160 1630 aa25.12■■□□□ 1.61
NHSL1-209ENST00000534376 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.07■■□□□ 1.6
NHSL1-209ENST00000534376 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.04■■□□□ 1.6
NHSL1-209ENST00000534376 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.87■■□□□ 1.57
NHSL1-209ENST00000534376 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.83■■□□□ 1.56
NHSL1-209ENST00000534376 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
NHSL1-209ENST00000534376 NCAPD3P42695 1498 aa24■■□□□ 1.43
NHSL1-209ENST00000534376 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.95■■□□□ 1.42
NHSL1-209ENST00000534376 SMARCA4P51532 1647 aa23.92■■□□□ 1.42
NHSL1-209ENST00000534376 SMARCA2P51531 1590 aa23.88■■□□□ 1.41
NHSL1-209ENST00000534376 ERCC6Q03468 1493 aa23.82■■□□□ 1.4
NHSL1-209ENST00000534376 HMGXB3Q12766 1538 aa23.82■■□□□ 1.4
NHSL1-209ENST00000534376 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
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NHSL1-209ENST00000534376 CUX2O14529 1486 aa23.72■■□□□ 1.39
NHSL1-209ENST00000534376 NESP48681 1621 aa23.69■■□□□ 1.38
NHSL1-209ENST00000534376 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.65■■□□□ 1.38
NHSL1-209ENST00000534376 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.65■■□□□ 1.38
NHSL1-209ENST00000534376 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.47■■□□□ 1.35
NHSL1-209ENST00000534376 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
NHSL1-209ENST00000534376 WIZO95785 1651 aa23.38■■□□□ 1.33
NHSL1-209ENST00000534376 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.36■■□□□ 1.33
NHSL1-209ENST00000534376 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.35■■□□□ 1.33
NHSL1-209ENST00000534376 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.3■■□□□ 1.32
NHSL1-209ENST00000534376 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.16■■□□□ 1.3
NHSL1-209ENST00000534376 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
NHSL1-209ENST00000534376 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.08■■□□□ 1.29
NHSL1-209ENST00000534376 WDR62O43379 1518 aa23.08■■□□□ 1.28
NHSL1-209ENST00000534376 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
NHSL1-209ENST00000534376 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.05■■□□□ 1.28
NHSL1-209ENST00000534376 CFTRP13569 1480 aa23.02■■□□□ 1.28
NHSL1-209ENST00000534376 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
NHSL1-209ENST00000534376 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.82■■□□□ 1.24
NHSL1-209ENST00000534376 TRIM41Q8WV44 630 aa22.78■■□□□ 1.24
NHSL1-209ENST00000534376 PRDM2Q13029 1718 aa22.76■■□□□ 1.23
NHSL1-209ENST00000534376 OSCARQ8IYS5 282 aa22.68■■□□□ 1.22
NHSL1-209ENST00000534376 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
NHSL1-209ENST00000534376 TOPBP1Q92547 1522 aa22.61■■□□□ 1.21
NHSL1-209ENST00000534376 IFT140Q96RY7 1462 aa22.6■■□□□ 1.21
NHSL1-209ENST00000534376 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
NHSL1-209ENST00000534376 ABCC8Q09428 1581 aa22.54■■□□□ 1.2
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NHSL1-209ENST00000534376 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
NHSL1-209ENST00000534376 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.4■■□□□ 1.18
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NHSL1-209ENST00000534376 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
NHSL1-209ENST00000534376 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.36■■□□□ 1.17
NHSL1-209ENST00000534376 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.36■■□□□ 1.17
NHSL1-209ENST00000534376 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.36■■□□□ 1.17
NHSL1-209ENST00000534376 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
NHSL1-209ENST00000534376 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.33■■□□□ 1.16
NHSL1-209ENST00000534376 FBLN2P98095 1184 aa22.31■■□□□ 1.16
NHSL1-209ENST00000534376 SOGA1O94964 1423 aa22.31■■□□□ 1.16
NHSL1-209ENST00000534376 ARHGEF11O15085 1522 aa22.29■■□□□ 1.16
NHSL1-209ENST00000534376 CHD1O14646 1710 aa22.28■■□□□ 1.16
NHSL1-209ENST00000534376 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
NHSL1-209ENST00000534376 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.25■■□□□ 1.15
NHSL1-209ENST00000534376 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
NHSL1-209ENST00000534376 CUX1P39880 1505 aa22.22■■□□□ 1.15
NHSL1-209ENST00000534376 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.19■■□□□ 1.14
NHSL1-209ENST00000534376 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.16■■□□□ 1.14
NHSL1-209ENST00000534376 WDR97A6NE52 1622 aa22.13■■□□□ 1.13
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NHSL1-209ENST00000534376 GRIN2BQ13224 1484 aa22.09■■□□□ 1.13
NHSL1-209ENST00000534376 ARAP1Q96P48 1450 aa22.08■■□□□ 1.12
NHSL1-209ENST00000534376 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
NHSL1-209ENST00000534376 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.02■■□□□ 1.12
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NHSL1-209ENST00000534376 SYNJ2O15056 1496 aa22.01■■□□□ 1.11
NHSL1-209ENST00000534376 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.01■■□□□ 1.11
NHSL1-209ENST00000534376 PBRM1Q86U86 1689 aa21.98■■□□□ 1.11
NHSL1-209ENST00000534376 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.97■■□□□ 1.11
NHSL1-209ENST00000534376 TRHP20396 242 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
NHSL1-209ENST00000534376 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.94■■□□□ 1.1
NHSL1-209ENST00000534376 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.9■■□□□ 1.1
NHSL1-209ENST00000534376 TOP2BQ02880 1626 aa21.84■■□□□ 1.09
NHSL1-209ENST00000534376 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.84■■□□□ 1.09
NHSL1-209ENST00000534376 GRIN2AQ12879 1464 aa21.8■■□□□ 1.08
NHSL1-209ENST00000534376 ADAMTS12P58397 1594 aa21.78■■□□□ 1.08
NHSL1-209ENST00000534376 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.73■■□□□ 1.07
NHSL1-209ENST00000534376 CEP170Q5SW79 1584 aa21.72■■□□□ 1.07
NHSL1-209ENST00000534376 NUP160Q12769 1436 aa21.71■■□□□ 1.07
NHSL1-209ENST00000534376 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.7■■□□□ 1.06
NHSL1-209ENST00000534376 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.69■■□□□ 1.06
NHSL1-209ENST00000534376 SHROOM2Q13796 1616 aa21.59■■□□□ 1.05
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