RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523364.1

HOXA-AS2-209, HOXA cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HOXA-AS2, Length 989 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA-AS2-209ENST00000523364 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.5■■■□□ 2.15
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HOXA-AS2-209ENST00000523364 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.85■■□□□ 1.73
HOXA-AS2-209ENST00000523364 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.14■■□□□ 1.61
HOXA-AS2-209ENST00000523364 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.07■■□□□ 1.6
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HOXA-AS2-209ENST00000523364 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.68■■□□□ 1.54
HOXA-AS2-209ENST00000523364 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.64■■□□□ 1.54
HOXA-AS2-209ENST00000523364 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.55■■□□□ 1.52
HOXA-AS2-209ENST00000523364 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.51■■□□□ 1.51
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HOXA-AS2-209ENST00000523364 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.38■■□□□ 1.49
HOXA-AS2-209ENST00000523364 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.27■■□□□ 1.48
HOXA-AS2-209ENST00000523364 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.01■■□□□ 1.43
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HOXA-AS2-209ENST00000523364 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXA-AS2-209ENST00000523364 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.77■■□□□ 1.4
HOXA-AS2-209ENST00000523364 SCRIBQ14160 1630 aa23.68■■□□□ 1.38
HOXA-AS2-209ENST00000523364 CUX2O14529 1486 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXA-AS2-209ENST00000523364 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
HOXA-AS2-209ENST00000523364 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXA-AS2-209ENST00000523364 ERCC6Q03468 1493 aa23.33■■□□□ 1.33
HOXA-AS2-209ENST00000523364 TRIM41Q8WV44 630 aa23.32■■□□□ 1.32
HOXA-AS2-209ENST00000523364 NESP48681 1621 aa22.94■■□□□ 1.26
HOXA-AS2-209ENST00000523364 NCAPD3P42695 1498 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXA-AS2-209ENST00000523364 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
HOXA-AS2-209ENST00000523364 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.73■■□□□ 1.23
HOXA-AS2-209ENST00000523364 SMARCA2P51531 1590 aa22.66■■□□□ 1.22
HOXA-AS2-209ENST00000523364 HMGXB3Q12766 1538 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXA-AS2-209ENST00000523364 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.5■■□□□ 1.19
HOXA-AS2-209ENST00000523364 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.46■■□□□ 1.19
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HOXA-AS2-209ENST00000523364 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.42■■□□□ 1.18
HOXA-AS2-209ENST00000523364 SMARCA4P51532 1647 aa22.42■■□□□ 1.18
HOXA-AS2-209ENST00000523364 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
HOXA-AS2-209ENST00000523364 OSCARQ8IYS5 282 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXA-AS2-209ENST00000523364 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXA-AS2-209ENST00000523364 WDR62O43379 1518 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXA-AS2-209ENST00000523364 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXA-AS2-209ENST00000523364 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXA-AS2-209ENST00000523364 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXA-AS2-209ENST00000523364 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXA-AS2-209ENST00000523364 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXA-AS2-209ENST00000523364 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
HOXA-AS2-209ENST00000523364 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.03■■□□□ 1.12
HOXA-AS2-209ENST00000523364 ARHGEF11O15085 1522 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXA-AS2-209ENST00000523364 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXA-AS2-209ENST00000523364 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.99■■□□□ 1.11
HOXA-AS2-209ENST00000523364 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.94■■□□□ 1.1
HOXA-AS2-209ENST00000523364 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
HOXA-AS2-209ENST00000523364 ARAP1Q96P48 1450 aa21.77■■□□□ 1.07
HOXA-AS2-209ENST00000523364 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
HOXA-AS2-209ENST00000523364 CFTRP13569 1480 aa21.71■■□□□ 1.07
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HOXA-AS2-209ENST00000523364 IFT140Q96RY7 1462 aa21.6■■□□□ 1.05
HOXA-AS2-209ENST00000523364 FBLN2P98095 1184 aa21.53■■□□□ 1.04
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HOXA-AS2-209ENST00000523364 CHD1O14646 1710 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXA-AS2-209ENST00000523364 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
HOXA-AS2-209ENST00000523364 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.45■■□□□ 1.03
HOXA-AS2-209ENST00000523364 TOPBP1Q92547 1522 aa21.41■■□□□ 1.02
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HOXA-AS2-209ENST00000523364 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
HOXA-AS2-209ENST00000523364 PRDM2Q13029 1718 aa21.26■□□□□ 0.99
HOXA-AS2-209ENST00000523364 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
HOXA-AS2-209ENST00000523364 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.25■□□□□ 0.99
HOXA-AS2-209ENST00000523364 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.2■□□□□ 0.98
HOXA-AS2-209ENST00000523364 ABCC8Q09428 1581 aa21.19■□□□□ 0.98
HOXA-AS2-209ENST00000523364 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
HOXA-AS2-209ENST00000523364 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.17■□□□□ 0.98
HOXA-AS2-209ENST00000523364 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
HOXA-AS2-209ENST00000523364 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.15■□□□□ 0.98
HOXA-AS2-209ENST00000523364 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.98
HOXA-AS2-209ENST00000523364 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.13■□□□□ 0.97
HOXA-AS2-209ENST00000523364 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.13■□□□□ 0.97
HOXA-AS2-209ENST00000523364 SYNJ1O43426 1573 aa21.12■□□□□ 0.97
HOXA-AS2-209ENST00000523364 SOGA1O94964 1423 aa21.04■□□□□ 0.96
HOXA-AS2-209ENST00000523364 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
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HOXA-AS2-209ENST00000523364 SYNJ2O15056 1496 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXA-AS2-209ENST00000523364 ERCC6L2Q5T890 1561 aa20.96■□□□□ 0.95
HOXA-AS2-209ENST00000523364 GRIN2BQ13224 1484 aa20.93■□□□□ 0.94
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HOXA-AS2-209ENST00000523364 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
HOXA-AS2-209ENST00000523364 FAM69CQ0P6D2 419 aa20.77■□□□□ 0.92
HOXA-AS2-209ENST00000523364 CEP170Q5SW79 1584 aa20.75■□□□□ 0.91
HOXA-AS2-209ENST00000523364 PBRM1Q86U86 1689 aa20.73■□□□□ 0.91
HOXA-AS2-209ENST00000523364 CUX1P39880 1505 aa20.73■□□□□ 0.91
HOXA-AS2-209ENST00000523364 GRIN2AQ12879 1464 aa20.67■□□□□ 0.9
HOXA-AS2-209ENST00000523364 ABCC10Q5T3U5 1492 aa20.67■□□□□ 0.9
HOXA-AS2-209ENST00000523364 KDM6BO15054 1643 aa20.64■□□□□ 0.9
HOXA-AS2-209ENST00000523364 NUP160Q12769 1436 aa20.63■□□□□ 0.89
HOXA-AS2-209ENST00000523364 SHROOM2Q13796 1616 aa20.59■□□□□ 0.89
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HOXA-AS2-209ENST00000523364 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
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