RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511028.1

SPATA18-209, Transcript of spermatogenesis associated 18, humanhuman

TSL 2

Gene SPATA18, Length 1,919 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA18-209ENST00000511028 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.49■■■■■ 5.83
SPATA18-209ENST00000511028 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.78■■■■■ 4.76
SPATA18-209ENST00000511028 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.31■■■■■ 4.52
SPATA18-209ENST00000511028 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.56■■■■■ 4.4
SPATA18-209ENST00000511028 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.55■■■■■ 4.4
SPATA18-209ENST00000511028 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.26■■■■■ 4.36
SPATA18-209ENST00000511028 ABCC9O60706 1549 aa42.17■■■■■ 4.34
SPATA18-209ENST00000511028 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.94■■■■■ 4.3
SPATA18-209ENST00000511028 NACADO15069 1562 aa41.65■■■■■ 4.26
SPATA18-209ENST00000511028 SCRIBQ14160 1630 aa41.27■■■■■ 4.2
SPATA18-209ENST00000511028 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.25■■■■■ 4.19
SPATA18-209ENST00000511028 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.79■■■■■ 4.12
SPATA18-209ENST00000511028 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.44■■■■■ 4.06
SPATA18-209ENST00000511028 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.05■■■■■ 4
SPATA18-209ENST00000511028 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.01■■■■■ 4
SPATA18-209ENST00000511028 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.98■■■■□ 3.99
SPATA18-209ENST00000511028 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.83■■■■□ 3.97
SPATA18-209ENST00000511028 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.81■■■■□ 3.96
SPATA18-209ENST00000511028 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.76■■■■□ 3.96
SPATA18-209ENST00000511028 SMARCA4P51532 1647 aa39.55■■■■□ 3.92
SPATA18-209ENST00000511028 WIZO95785 1651 aa39.52■■■■□ 3.92
SPATA18-209ENST00000511028 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.13■■■■□ 3.85
SPATA18-209ENST00000511028 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.09■■■■□ 3.85
SPATA18-209ENST00000511028 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.02■■■■□ 3.84
SPATA18-209ENST00000511028 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.82■■■■□ 3.81
SPATA18-209ENST00000511028 SMARCA2P51531 1590 aa38.82■■■■□ 3.8
SPATA18-209ENST00000511028 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.78■■■■□ 3.8
SPATA18-209ENST00000511028 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.7■■■■□ 3.79
SPATA18-209ENST00000511028 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.65■■■■□ 3.78
SPATA18-209ENST00000511028 NCAPD3P42695 1498 aa38.43■■■■□ 3.74
SPATA18-209ENST00000511028 HMGXB3Q12766 1538 aa38.41■■■■□ 3.74
SPATA18-209ENST00000511028 TRIM41Q8WV44 630 aa38.34■■■■□ 3.73
SPATA18-209ENST00000511028 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.15■■■■□ 3.7
SPATA18-209ENST00000511028 ABCC8Q09428 1581 aa38■■■■□ 3.67
SPATA18-209ENST00000511028 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.71■■■■□ 3.63
SPATA18-209ENST00000511028 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa37.67■■■■□ 3.62
SPATA18-209ENST00000511028 CFTRP13569 1480 aa37.66■■■■□ 3.62
SPATA18-209ENST00000511028 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.65■■■■□ 3.62
SPATA18-209ENST00000511028 SYNJ1O43426 1573 aa37.54■■■■□ 3.6
SPATA18-209ENST00000511028 PRDM2Q13029 1718 aa37.5■■■■□ 3.59
SPATA18-209ENST00000511028 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.48■■■■□ 3.59
SPATA18-209ENST00000511028 TOP2BQ02880 1626 aa37.37■■■■□ 3.57
SPATA18-209ENST00000511028 SOGA1O94964 1423 aa37.33■■■■□ 3.57
SPATA18-209ENST00000511028 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.32■■■■□ 3.56
SPATA18-209ENST00000511028 EEA1Q15075 1411 aa37.29■■■■□ 3.56
SPATA18-209ENST00000511028 CUX1P39880 1505 aa37.2■■■■□ 3.55
SPATA18-209ENST00000511028 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.17■■■■□ 3.54
SPATA18-209ENST00000511028 EHMT2Q96KQ7 1210 aa37.14■■■■□ 3.54
SPATA18-209ENST00000511028 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.11■■■■□ 3.53
SPATA18-209ENST00000511028 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.1■■■■□ 3.53
SPATA18-209ENST00000511028 NESP48681 1621 aa37.09■■■■□ 3.53
SPATA18-209ENST00000511028 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.09■■■■□ 3.53
SPATA18-209ENST00000511028 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.08■■■■□ 3.53
SPATA18-209ENST00000511028 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.84■■■■□ 3.49
SPATA18-209ENST00000511028 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.83■■■■□ 3.49
SPATA18-209ENST00000511028 GOLGA3Q08378 1498 aa36.81■■■■□ 3.48
SPATA18-209ENST00000511028 KIF21BO75037 1637 aa36.8■■■■□ 3.48
SPATA18-209ENST00000511028 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.8■■■■□ 3.48
SPATA18-209ENST00000511028 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.77■■■■□ 3.48
SPATA18-209ENST00000511028 KIF27Q86VH2 1401 aa36.74■■■■□ 3.47
SPATA18-209ENST00000511028 TNIKQ9UKE5 1360 aa36.72■■■■□ 3.47
SPATA18-209ENST00000511028 TOPBP1Q92547 1522 aa36.71■■■■□ 3.47
SPATA18-209ENST00000511028 UBTFP17480 764 aaKnown RBP36.67■■■■□ 3.46
SPATA18-209ENST00000511028 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.66■■■■□ 3.46
SPATA18-209ENST00000511028 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.6■■■■□ 3.45
SPATA18-209ENST00000511028 CUX2O14529 1486 aa36.59■■■■□ 3.45
SPATA18-209ENST00000511028 CEP162Q5TB80 1403 aa36.57■■■■□ 3.44
SPATA18-209ENST00000511028 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa36.56■■■■□ 3.44
SPATA18-209ENST00000511028 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.55■■■■□ 3.44
SPATA18-209ENST00000511028 PRXQ9BXM0 1461 aa36.53■■■■□ 3.44
SPATA18-209ENST00000511028 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.5■■■■□ 3.43
SPATA18-209ENST00000511028 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.45■■■■□ 3.43
SPATA18-209ENST00000511028 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.43■■■■□ 3.42
SPATA18-209ENST00000511028 IGF1RP08069 1367 aa36.36■■■■□ 3.41
SPATA18-209ENST00000511028 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.33■■■■□ 3.41
SPATA18-209ENST00000511028 WDR97A6NE52 1622 aa36.29■■■■□ 3.4
SPATA18-209ENST00000511028 PCGF6Q9BYE7 350 aa36.24■■■■□ 3.39
SPATA18-209ENST00000511028 CLIP1P30622 1438 aa36.23■■■■□ 3.39
SPATA18-209ENST00000511028 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.21■■■■□ 3.39
SPATA18-209ENST00000511028 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP36.16■■■■□ 3.38
SPATA18-209ENST00000511028 ERCC6Q03468 1493 aa36.15■■■■□ 3.38
SPATA18-209ENST00000511028 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.13■■■■□ 3.37
SPATA18-209ENST00000511028 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.12■■■■□ 3.37
SPATA18-209ENST00000511028 WDR62O43379 1518 aa36.12■■■■□ 3.37
SPATA18-209ENST00000511028 CUL7Q14999 1698 aa36.08■■■■□ 3.37
SPATA18-209ENST00000511028 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.08■■■■□ 3.37
SPATA18-209ENST00000511028 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.05■■■■□ 3.36
SPATA18-209ENST00000511028 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP36.04■■■■□ 3.36
SPATA18-209ENST00000511028 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.96■■■■□ 3.35
SPATA18-209ENST00000511028 VPS8Q8N3P4 1428 aa35.94■■■■□ 3.34
SPATA18-209ENST00000511028 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP35.93■■■■□ 3.34
SPATA18-209ENST00000511028 IFT140Q96RY7 1462 aa35.92■■■■□ 3.34
SPATA18-209ENST00000511028 PBRM1Q86U86 1689 aa35.84■■■■□ 3.33
SPATA18-209ENST00000511028 ARAP1Q96P48 1450 aa35.82■■■■□ 3.33
SPATA18-209ENST00000511028 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.8■■■■□ 3.32
SPATA18-209ENST00000511028 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa35.78■■■■□ 3.32
SPATA18-209ENST00000511028 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa35.74■■■■□ 3.31
SPATA18-209ENST00000511028 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.73■■■■□ 3.31
SPATA18-209ENST00000511028 GRIN2BQ13224 1484 aa35.72■■■■□ 3.31
SPATA18-209ENST00000511028 APLP2Q06481 763 aa35.65■■■■□ 3.3
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