RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510831.5

ARFIP1-208, Transcript of ADP ribosylation factor interacting protein 1, human

TSL 3

Gene ARFIP1, Length 514 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARFIP1-208	ENST00000510831	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		38.38	■■■■□ 3.74
ARFIP1-208	ENST00000510831	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		34.37	■■■■□ 3.09
ARFIP1-208	ENST00000510831	ABCC9	O60706	1549 aa		34.25	■■■■□ 3.07
ARFIP1-208	ENST00000510831	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		32.62	■■■□□ 2.81
ARFIP1-208	ENST00000510831	NACAD	O15069	1562 aa		32.41	■■■□□ 2.78
ARFIP1-208	ENST00000510831	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		32.37	■■■□□ 2.77
ARFIP1-208	ENST00000510831	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		31.98	■■■□□ 2.71
ARFIP1-208	ENST00000510831	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		31.97	■■■□□ 2.71
ARFIP1-208	ENST00000510831	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		31.93	■■■□□ 2.7
ARFIP1-208	ENST00000510831	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	31.92	■■■□□ 2.7
ARFIP1-208	ENST00000510831	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	31.92	■■■□□ 2.7
ARFIP1-208	ENST00000510831	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	31.86	■■■□□ 2.69
ARFIP1-208	ENST00000510831	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		31.69	■■■□□ 2.66
ARFIP1-208	ENST00000510831	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		31.65	■■■□□ 2.66
ARFIP1-208	ENST00000510831	SCRIB	Q14160	1630 aa		31.42	■■■□□ 2.62
ARFIP1-208	ENST00000510831	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		31.19	■■■□□ 2.58
ARFIP1-208	ENST00000510831	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		30.94	■■■□□ 2.54
ARFIP1-208	ENST00000510831	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	30.9	■■■□□ 2.54
ARFIP1-208	ENST00000510831	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		30.8	■■■□□ 2.52
ARFIP1-208	ENST00000510831	SMARCA4	P51532	1647 aa		29.94	■■■□□ 2.38
ARFIP1-208	ENST00000510831	NCAPD3	P42695	1498 aa		29.9	■■■□□ 2.38
ARFIP1-208	ENST00000510831	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		29.88	■■■□□ 2.37
ARFIP1-208	ENST00000510831	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		29.85	■■■□□ 2.37
ARFIP1-208	ENST00000510831	SMARCA2	P51531	1590 aa		29.8	■■■□□ 2.36
ARFIP1-208	ENST00000510831	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	29.77	■■■□□ 2.36
ARFIP1-208	ENST00000510831	HMGXB3	Q12766	1538 aa		29.73	■■■□□ 2.35
ARFIP1-208	ENST00000510831	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	29.62	■■■□□ 2.33
ARFIP1-208	ENST00000510831	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		29.62	■■■□□ 2.33
ARFIP1-208	ENST00000510831	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		29.58	■■■□□ 2.33
ARFIP1-208	ENST00000510831	ERCC6	Q03468	1493 aa		29.55	■■■□□ 2.32
ARFIP1-208	ENST00000510831	NES	P48681	1621 aa		29.49	■■■□□ 2.31
ARFIP1-208	ENST00000510831	CUX2	O14529	1486 aa		29.36	■■■□□ 2.29
ARFIP1-208	ENST00000510831	WIZ	O95785	1651 aa		29.31	■■■□□ 2.28
ARFIP1-208	ENST00000510831	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		29.23	■■■□□ 2.27
ARFIP1-208	ENST00000510831	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		29.14	■■■□□ 2.26
ARFIP1-208	ENST00000510831	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	29.13	■■■□□ 2.25
ARFIP1-208	ENST00000510831	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		29.11	■■■□□ 2.25
ARFIP1-208	ENST00000510831	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	29.04	■■■□□ 2.24
ARFIP1-208	ENST00000510831	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		29.03	■■■□□ 2.24
ARFIP1-208	ENST00000510831	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		29.02	■■■□□ 2.24
ARFIP1-208	ENST00000510831	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	28.9	■■■□□ 2.22
ARFIP1-208	ENST00000510831	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		28.82	■■■□□ 2.2
ARFIP1-208	ENST00000510831	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		28.75	■■■□□ 2.19
ARFIP1-208	ENST00000510831	WDR62	O43379	1518 aa		28.74	■■■□□ 2.19
ARFIP1-208	ENST00000510831	CFTR	P13569	1480 aa		28.73	■■■□□ 2.19
ARFIP1-208	ENST00000510831	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		28.73	■■■□□ 2.19
ARFIP1-208	ENST00000510831	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		28.57	■■■□□ 2.16
ARFIP1-208	ENST00000510831	PRDM2	Q13029	1718 aa		28.55	■■■□□ 2.16
ARFIP1-208	ENST00000510831	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	28.51	■■■□□ 2.15
ARFIP1-208	ENST00000510831	TOPBP1	Q92547	1522 aa		28.22	■■■□□ 2.11
ARFIP1-208	ENST00000510831	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	28.15	■■■□□ 2.1
ARFIP1-208	ENST00000510831	IFT140	Q96RY7	1462 aa		28.15	■■■□□ 2.1
ARFIP1-208	ENST00000510831	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		28.13	■■■□□ 2.09
ARFIP1-208	ENST00000510831	ABCC8	Q09428	1581 aa		28.09	■■■□□ 2.09
ARFIP1-208	ENST00000510831	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		28.04	■■■□□ 2.08
ARFIP1-208	ENST00000510831	TRIM41	Q8WV44	630 aa		28.03	■■■□□ 2.08
ARFIP1-208	ENST00000510831	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	28.01	■■■□□ 2.07
ARFIP1-208	ENST00000510831	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	27.96	■■■□□ 2.07
ARFIP1-208	ENST00000510831	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	27.96	■■■□□ 2.07
ARFIP1-208	ENST00000510831	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	27.95	■■■□□ 2.06
ARFIP1-208	ENST00000510831	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	27.89	■■■□□ 2.06
ARFIP1-208	ENST00000510831	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		27.87	■■■□□ 2.05
ARFIP1-208	ENST00000510831	CUX1	P39880	1505 aa		27.82	■■■□□ 2.04
ARFIP1-208	ENST00000510831	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		27.81	■■■□□ 2.04
ARFIP1-208	ENST00000510831	CHD1	O14646	1710 aa		27.79	■■■□□ 2.04
ARFIP1-208	ENST00000510831	SOGA1	O94964	1423 aa		27.79	■■■□□ 2.04
ARFIP1-208	ENST00000510831	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	27.75	■■■□□ 2.03
ARFIP1-208	ENST00000510831	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		27.75	■■■□□ 2.03
ARFIP1-208	ENST00000510831	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		27.75	■■■□□ 2.03
ARFIP1-208	ENST00000510831	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		27.75	■■■□□ 2.03
ARFIP1-208	ENST00000510831	FBLN2	P98095	1184 aa		27.69	■■■□□ 2.02
ARFIP1-208	ENST00000510831	ARHGEF11	O15085	1522 aa		27.66	■■■□□ 2.02
ARFIP1-208	ENST00000510831	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		27.64	■■■□□ 2.01
ARFIP1-208	ENST00000510831	WDR97	A6NE52	1622 aa		27.62	■■■□□ 2.01
ARFIP1-208	ENST00000510831	GRIN2B	Q13224	1484 aa		27.53	■■■□□ 2
ARFIP1-208	ENST00000510831	PBRM1	Q86U86	1689 aa		27.52	■■■□□ 2
ARFIP1-208	ENST00000510831	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	27.51	■■□□□ 1.99
ARFIP1-208	ENST00000510831	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		27.47	■■□□□ 1.99
ARFIP1-208	ENST00000510831	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		27.46	■■□□□ 1.99
ARFIP1-208	ENST00000510831	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	27.46	■■□□□ 1.99
ARFIP1-208	ENST00000510831	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		27.45	■■□□□ 1.98
ARFIP1-208	ENST00000510831	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		27.43	■■□□□ 1.98
ARFIP1-208	ENST00000510831	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	27.43	■■□□□ 1.98
ARFIP1-208	ENST00000510831	SYNJ1	O43426	1573 aa		27.43	■■□□□ 1.98
ARFIP1-208	ENST00000510831	SYNJ2	O15056	1496 aa		27.42	■■□□□ 1.98
ARFIP1-208	ENST00000510831	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		27.41	■■□□□ 1.98
ARFIP1-208	ENST00000510831	ARAP1	Q96P48	1450 aa		27.41	■■□□□ 1.98
ARFIP1-208	ENST00000510831	TOP2B	Q02880	1626 aa		27.41	■■□□□ 1.98
ARFIP1-208	ENST00000510831	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		27.41	■■□□□ 1.98
ARFIP1-208	ENST00000510831	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	27.4	■■□□□ 1.98
ARFIP1-208	ENST00000510831	ADAMTS12	P58397	1594 aa		27.24	■■□□□ 1.95
ARFIP1-208	ENST00000510831	GRIN2A	Q12879	1464 aa		27.19	■■□□□ 1.94
ARFIP1-208	ENST00000510831	CEP170	Q5SW79	1584 aa		27.13	■■□□□ 1.93
ARFIP1-208	ENST00000510831	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		27.11	■■□□□ 1.93
ARFIP1-208	ENST00000510831	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		27.11	■■□□□ 1.93
ARFIP1-208	ENST00000510831	NUP160	Q12769	1436 aa		27.07	■■□□□ 1.92
ARFIP1-208	ENST00000510831	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	27.07	■■□□□ 1.92
ARFIP1-208	ENST00000510831	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		27.06	■■□□□ 1.92
ARFIP1-208	ENST00000510831	SHROOM2	Q13796	1616 aa		26.96	■■□□□ 1.91
ARFIP1-208	ENST00000510831	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	26.91	■■□□□ 1.9

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