RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492440.1

TTLL3-229, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, humanhuman

TSL 2

Gene TTLL3, Length 1,549 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3-229ENST00000492440 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.6■■■■□ 3.29
TTLL3-229ENST00000492440 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.92■■■□□ 2.54
TTLL3-229ENST00000492440 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
TTLL3-229ENST00000492440 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.53■■■□□ 2.32
TTLL3-229ENST00000492440 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.09■■■□□ 2.25
TTLL3-229ENST00000492440 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.09■■■□□ 2.25
TTLL3-229ENST00000492440 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.09■■■□□ 2.25
TTLL3-229ENST00000492440 ABCC9O60706 1549 aa29.02■■■□□ 2.24
TTLL3-229ENST00000492440 NACADO15069 1562 aa28.74■■■□□ 2.19
TTLL3-229ENST00000492440 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.38■■■□□ 2.13
TTLL3-229ENST00000492440 SCRIBQ14160 1630 aa28.37■■■□□ 2.13
TTLL3-229ENST00000492440 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
TTLL3-229ENST00000492440 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
TTLL3-229ENST00000492440 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.71■■■□□ 2.03
TTLL3-229ENST00000492440 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.58■■■□□ 2.01
TTLL3-229ENST00000492440 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.51■■□□□ 1.99
TTLL3-229ENST00000492440 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.48■■□□□ 1.99
TTLL3-229ENST00000492440 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.47■■□□□ 1.99
TTLL3-229ENST00000492440 SMARCA4P51532 1647 aa27.28■■□□□ 1.96
TTLL3-229ENST00000492440 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.22■■□□□ 1.958e-6■□□□□ 8.9
TTLL3-229ENST00000492440 WIZO95785 1651 aa27.22■■□□□ 1.95
TTLL3-229ENST00000492440 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.21■■□□□ 1.95
TTLL3-229ENST00000492440 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
TTLL3-229ENST00000492440 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.01■■□□□ 1.91
TTLL3-229ENST00000492440 SMARCA2P51531 1590 aa26.8■■□□□ 1.88
TTLL3-229ENST00000492440 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.78■■□□□ 1.88
TTLL3-229ENST00000492440 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.73■■□□□ 1.87
TTLL3-229ENST00000492440 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
TTLL3-229ENST00000492440 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
TTLL3-229ENST00000492440 HMGXB3Q12766 1538 aa26.53■■□□□ 1.84
TTLL3-229ENST00000492440 NCAPD3P42695 1498 aa26.52■■□□□ 1.84
TTLL3-229ENST00000492440 TRIM41Q8WV44 630 aa26.51■■□□□ 1.83
TTLL3-229ENST00000492440 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.42■■□□□ 1.82
TTLL3-229ENST00000492440 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.3■■□□□ 1.8
TTLL3-229ENST00000492440 ABCC8Q09428 1581 aa26.21■■□□□ 1.79
TTLL3-229ENST00000492440 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.09■■□□□ 1.77
TTLL3-229ENST00000492440 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.08■■□□□ 1.77
TTLL3-229ENST00000492440 CFTRP13569 1480 aa26.01■■□□□ 1.75
TTLL3-229ENST00000492440 EEA1Q15075 1411 aa25.96■■□□□ 1.75
TTLL3-229ENST00000492440 SYNJ1O43426 1573 aa25.94■■□□□ 1.74
TTLL3-229ENST00000492440 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
TTLL3-229ENST00000492440 TOP2BQ02880 1626 aa25.85■■□□□ 1.73
TTLL3-229ENST00000492440 PRDM2Q13029 1718 aa25.84■■□□□ 1.73
TTLL3-229ENST00000492440 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.83■■□□□ 1.73
TTLL3-229ENST00000492440 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.82■■□□□ 1.72
TTLL3-229ENST00000492440 SOGA1O94964 1423 aa25.81■■□□□ 1.72
TTLL3-229ENST00000492440 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.68■■□□□ 1.7
TTLL3-229ENST00000492440 CUX1P39880 1505 aa25.68■■□□□ 1.7
TTLL3-229ENST00000492440 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.67■■□□□ 1.7
TTLL3-229ENST00000492440 KIF21BO75037 1637 aa25.56■■□□□ 1.68
TTLL3-229ENST00000492440 GOLGA3Q08378 1498 aa25.55■■□□□ 1.68
TTLL3-229ENST00000492440 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.55■■□□□ 1.68
TTLL3-229ENST00000492440 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.54■■□□□ 1.68
TTLL3-229ENST00000492440 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.53■■□□□ 1.68
TTLL3-229ENST00000492440 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.53■■□□□ 1.68
TTLL3-229ENST00000492440 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.47■■□□□ 1.67
TTLL3-229ENST00000492440 KIF27Q86VH2 1401 aa25.42■■□□□ 1.66
TTLL3-229ENST00000492440 NESP48681 1621 aa25.41■■□□□ 1.66
TTLL3-229ENST00000492440 CEP162Q5TB80 1403 aa25.39■■□□□ 1.65
TTLL3-229ENST00000492440 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.39■■□□□ 1.65
TTLL3-229ENST00000492440 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.35■■□□□ 1.65
TTLL3-229ENST00000492440 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.35■■□□□ 1.65
TTLL3-229ENST00000492440 PRXQ9BXM0 1461 aa25.35■■□□□ 1.65
TTLL3-229ENST00000492440 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.34■■□□□ 1.65
TTLL3-229ENST00000492440 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
TTLL3-229ENST00000492440 TOPBP1Q92547 1522 aa25.3■■□□□ 1.64
TTLL3-229ENST00000492440 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.29■■□□□ 1.64
TTLL3-229ENST00000492440 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
TTLL3-229ENST00000492440 CUX2O14529 1486 aa25.24■■□□□ 1.63
TTLL3-229ENST00000492440 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.22■■□□□ 1.63
TTLL3-229ENST00000492440 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
TTLL3-229ENST00000492440 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
TTLL3-229ENST00000492440 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.19■■□□□ 1.62
TTLL3-229ENST00000492440 IGF1RP08069 1367 aa25.13■■□□□ 1.61
TTLL3-229ENST00000492440 CLIP1P30622 1438 aa25.13■■□□□ 1.61
TTLL3-229ENST00000492440 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.11■■□□□ 1.61
TTLL3-229ENST00000492440 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.06■■□□□ 1.6
TTLL3-229ENST00000492440 WDR97A6NE52 1622 aa25.04■■□□□ 1.6
TTLL3-229ENST00000492440 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.01■■□□□ 1.59
TTLL3-229ENST00000492440 MRC2Q9UBG0 1479 aa25■■□□□ 1.59
TTLL3-229ENST00000492440 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.99■■□□□ 1.59
TTLL3-229ENST00000492440 ERCC6Q03468 1493 aa24.97■■□□□ 1.59
TTLL3-229ENST00000492440 CUL7Q14999 1698 aa24.94■■□□□ 1.58
TTLL3-229ENST00000492440 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.93■■□□□ 1.58
TTLL3-229ENST00000492440 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
TTLL3-229ENST00000492440 WDR62O43379 1518 aa24.86■■□□□ 1.57
TTLL3-229ENST00000492440 HRCP23327 699 aa24.85■■□□□ 1.57
TTLL3-229ENST00000492440 ARAP1Q96P48 1450 aa24.85■■□□□ 1.57
TTLL3-229ENST00000492440 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.84■■□□□ 1.57
TTLL3-229ENST00000492440 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
TTLL3-229ENST00000492440 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
TTLL3-229ENST00000492440 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.78■■□□□ 1.56
TTLL3-229ENST00000492440 IFT140Q96RY7 1462 aa24.76■■□□□ 1.55
TTLL3-229ENST00000492440 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
TTLL3-229ENST00000492440 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
TTLL3-229ENST00000492440 APLP2Q06481 763 aa24.66■■□□□ 1.54
TTLL3-229ENST00000492440 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.65■■□□□ 1.54
TTLL3-229ENST00000492440 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.65■■□□□ 1.54
TTLL3-229ENST00000492440 PBRM1Q86U86 1689 aa24.64■■□□□ 1.53
TTLL3-229ENST00000492440 GRIN2BQ13224 1484 aa24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13 ms