RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483174.1

NTM-216, Transcript of neurotrimin, humanhuman

TSL 3

Gene NTM, Length 684 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTM-216ENST00000483174 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.01■■■■□ 3.36
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NTM-216ENST00000483174 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.79■■■□□ 2.68
NTM-216ENST00000483174 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.97■■■□□ 2.55
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NTM-216ENST00000483174 NACADO15069 1562 aa30.71■■■□□ 2.51
NTM-216ENST00000483174 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.33■■■□□ 2.45
NTM-216ENST00000483174 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.29■■■□□ 2.44
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NTM-216ENST00000483174 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.22■■■□□ 2.43
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NTM-216ENST00000483174 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.7■■■□□ 2.35
NTM-216ENST00000483174 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.48■■■□□ 2.31
NTM-216ENST00000483174 SCRIBQ14160 1630 aa29.47■■■□□ 2.31
NTM-216ENST00000483174 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.4■■■□□ 2.3
NTM-216ENST00000483174 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
NTM-216ENST00000483174 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.46■■■□□ 2.15
NTM-216ENST00000483174 NCAPD3P42695 1498 aa28.32■■■□□ 2.12
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NTM-216ENST00000483174 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.18■■■□□ 2.1
NTM-216ENST00000483174 ERCC6Q03468 1493 aa28.16■■■□□ 2.1
NTM-216ENST00000483174 HMGXB3Q12766 1538 aa28.13■■■□□ 2.09
NTM-216ENST00000483174 SMARCA2P51531 1590 aa28.12■■■□□ 2.09
NTM-216ENST00000483174 SMARCA4P51532 1647 aa28.12■■■□□ 2.09
NTM-216ENST00000483174 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.06
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NTM-216ENST00000483174 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
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NTM-216ENST00000483174 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
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NTM-216ENST00000483174 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.64■■■□□ 2.02
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NTM-216ENST00000483174 WIZO95785 1651 aa27.35■■□□□ 1.97
NTM-216ENST00000483174 WDR62O43379 1518 aa27.33■■□□□ 1.97
NTM-216ENST00000483174 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.18■■□□□ 1.94
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NTM-216ENST00000483174 TRIM41Q8WV44 630 aa27.05■■□□□ 1.92
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NTM-216ENST00000483174 WDR97A6NE52 1622 aa26.17■■□□□ 1.78
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NTM-216ENST00000483174 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.81■■□□□ 1.72
NTM-216ENST00000483174 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.79■■□□□ 1.72
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NTM-216ENST00000483174 GRIN2AQ12879 1464 aa25.65■■□□□ 1.7
NTM-216ENST00000483174 ADAMTS12P58397 1594 aa25.63■■□□□ 1.69
NTM-216ENST00000483174 CEP170Q5SW79 1584 aa25.58■■□□□ 1.69
NTM-216ENST00000483174 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.58■■□□□ 1.69
NTM-216ENST00000483174 NUP160Q12769 1436 aa25.58■■□□□ 1.69
NTM-216ENST00000483174 SHROOM2Q13796 1616 aa25.54■■□□□ 1.68
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