RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478988.2

PDZRN3-AS1-201, PDZRN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PDZRN3-AS1, Length 961 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CHIC1Q5VXU3 224 aa13.79□□□□□ -0.2
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NISCHQ9Y2I1 1504 aa13.5□□□□□ -0.25
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa12.26□□□□□ -0.45
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 POTEDQ86YR6 584 aa12□□□□□ -0.49
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ABCC9O60706 1549 aa11.96□□□□□ -0.49
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa11.54□□□□□ -0.56
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 FOXD1Q16676 465 aa11.51□□□□□ -0.57
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NACADO15069 1562 aa11.47□□□□□ -0.57
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 UNC13AQ9UPW8 1703 aa11.45□□□□□ -0.58
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 MYO15BQ96JP2 1530 aa11.37□□□□□ -0.59
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa11.24□□□□□ -0.61
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 BICRAQ9NZM4 1560 aa11.21□□□□□ -0.61
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 DNAJC5BQ9UF47 199 aa11.11□□□□□ -0.63
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa11.11□□□□□ -0.63
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 DCAF8L2P0C7V8 631 aa11.1□□□□□ -0.63
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP11.03□□□□□ -0.64
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SCRIBQ14160 1630 aa11.02□□□□□ -0.64
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PLPPR3Q6T4P5 718 aa11.02□□□□□ -0.65
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa10.92□□□□□ -0.66
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP10.91□□□□□ -0.66
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PPP6R1Q9UPN7 881 aa10.83□□□□□ -0.68
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CECR2Q9BXF3 1484 aa10.8□□□□□ -0.68
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ADRA2BP18089 450 aa10.78□□□□□ -0.68
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 MSH5O43196 834 aa10.69□□□□□ -0.7
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SMARCA4P51532 1647 aa10.58□□□□□ -0.72
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 HMGXB3Q12766 1538 aa10.54□□□□□ -0.72
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NCAPD3P42695 1498 aa10.53□□□□□ -0.72
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SMARCA2P51531 1590 aa10.52□□□□□ -0.72
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PEG3Q9GZU2 1588 aa10.52□□□□□ -0.73
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa10.49□□□□□ -0.73
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CUX2O14529 1486 aa10.38□□□□□ -0.75
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 MROH2BQ7Z745 1585 aa10.38□□□□□ -0.75
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa10.36□□□□□ -0.75
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa10.34□□□□□ -0.75
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ERCC6Q03468 1493 aa10.33□□□□□ -0.76
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NESP48681 1621 aa10.32□□□□□ -0.76
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 WIZO95785 1651 aa10.31□□□□□ -0.76
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PRDM2Q13029 1718 aa10.27□□□□□ -0.77
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa10.19□□□□□ -0.78
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PDS5BQ9NTI5 1447 aa10.18□□□□□ -0.78
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 WDR62O43379 1518 aa10.17□□□□□ -0.78
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CADPSQ9ULU8 1353 aa10.15□□□□□ -0.78
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.79
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 MRC2Q9UBG0 1479 aa10.14□□□□□ -0.79
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CFTRP13569 1480 aa10.1□□□□□ -0.79
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CEP164Q9UPV0 1460 aa10.1□□□□□ -0.79
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 FANCD2Q9BXW9 1451 aa10.07□□□□□ -0.8
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CCDC88BA6NC98 1476 aa9.98□□□□□ -0.81
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 DNMBPQ6XZF7 1577 aa9.93□□□□□ -0.82
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ABCC8Q09428 1581 aa9.91□□□□□ -0.82
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TOPBP1Q92547 1522 aa9.91□□□□□ -0.82
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 IFT140Q96RY7 1462 aa9.89□□□□□ -0.83
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CHD1O14646 1710 aa9.87□□□□□ -0.83
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 WDR97A6NE52 1622 aa9.85□□□□□ -0.83
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa9.81□□□□□ -0.84
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa9.81□□□□□ -0.84
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa9.81□□□□□ -0.84
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PBRM1Q86U86 1689 aa9.79□□□□□ -0.84
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 DMRT2Q9Y5R5 561 aa9.78□□□□□ -0.84
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 OSCARQ8IYS5 282 aa9.76□□□□□ -0.85
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CUX1P39880 1505 aa9.76□□□□□ -0.85
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 FGD5Q6ZNL6 1462 aa9.74□□□□□ -0.85
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ARHGEF11O15085 1522 aa9.74□□□□□ -0.85
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa9.73□□□□□ -0.85
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP9.72□□□□□ -0.85
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa9.72□□□□□ -0.85
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa9.72□□□□□ -0.85
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CLASP1Q7Z460 1538 aa9.7□□□□□ -0.86
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SOGA1O94964 1423 aa9.69□□□□□ -0.86
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa9.69□□□□□ -0.86
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TOP2BQ02880 1626 aa9.68□□□□□ -0.86
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SYNJ1O43426 1573 aa9.67□□□□□ -0.86
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa9.67□□□□□ -0.86
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TRIM41Q8WV44 630 aa9.67□□□□□ -0.86
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa9.66□□□□□ -0.86
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 GRIN2BQ13224 1484 aa9.66□□□□□ -0.86
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SYNJ2O15056 1496 aa9.65□□□□□ -0.87
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ARAP1Q96P48 1450 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ADAMTS12P58397 1594 aa9.63□□□□□ -0.87
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 GAPVD1Q14C86 1478 aa9.62□□□□□ -0.87
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SHROOM2Q13796 1616 aa9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.5 ms