RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470504.1

PTPRZ1-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Z1, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRZ1, Length 549 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1-204ENST00000470504 NISCHQ9Y2I1 1504 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRZ1-204ENST00000470504 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
PTPRZ1-204ENST00000470504 ABCC9O60706 1549 aa18.27■□□□□ 0.51
PTPRZ1-204ENST00000470504 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRZ1-204ENST00000470504 CHIC1Q5VXU3 224 aa17.58■□□□□ 0.4
PTPRZ1-204ENST00000470504 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa17.38■□□□□ 0.37
PTPRZ1-204ENST00000470504 NACADO15069 1562 aa17.22■□□□□ 0.35
PTPRZ1-204ENST00000470504 DNAJC5BQ9UF47 199 aa17.19■□□□□ 0.34
PTPRZ1-204ENST00000470504 UNC13AQ9UPW8 1703 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRZ1-204ENST00000470504 DCAF8L2P0C7V8 631 aa17■□□□□ 0.31
PTPRZ1-204ENST00000470504 MYO15BQ96JP2 1530 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRZ1-204ENST00000470504 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP16.93■□□□□ 0.3
PTPRZ1-204ENST00000470504 BICRAQ9NZM4 1560 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRZ1-204ENST00000470504 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
PTPRZ1-204ENST00000470504 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa16.66■□□□□ 0.26
PTPRZ1-204ENST00000470504 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa16.66■□□□□ 0.26
PTPRZ1-204ENST00000470504 SCRIBQ14160 1630 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRZ1-204ENST00000470504 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRZ1-204ENST00000470504 CECR2Q9BXF3 1484 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRZ1-204ENST00000470504 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
PTPRZ1-204ENST00000470504 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa15.93■□□□□ 0.14
PTPRZ1-204ENST00000470504 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
PTPRZ1-204ENST00000470504 NCAPD3P42695 1498 aa15.86■□□□□ 0.13
PTPRZ1-204ENST00000470504 CUX2O14529 1486 aa15.84■□□□□ 0.13
PTPRZ1-204ENST00000470504 ERCC6Q03468 1493 aa15.81■□□□□ 0.12
PTPRZ1-204ENST00000470504 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRZ1-204ENST00000470504 SMARCA2P51531 1590 aa15.79■□□□□ 0.12
PTPRZ1-204ENST00000470504 SMARCA4P51532 1647 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRZ1-204ENST00000470504 HMGXB3Q12766 1538 aa15.78■□□□□ 0.12
PTPRZ1-204ENST00000470504 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
PTPRZ1-204ENST00000470504 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
PTPRZ1-204ENST00000470504 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
PTPRZ1-204ENST00000470504 NESP48681 1621 aa15.65■□□□□ 0.1
PTPRZ1-204ENST00000470504 PEG3Q9GZU2 1588 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRZ1-204ENST00000470504 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
PTPRZ1-204ENST00000470504 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa15.58■□□□□ 0.08
PTPRZ1-204ENST00000470504 MROH2BQ7Z745 1585 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRZ1-204ENST00000470504 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRZ1-204ENST00000470504 PDS5BQ9NTI5 1447 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRZ1-204ENST00000470504 CADPSQ9ULU8 1353 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRZ1-204ENST00000470504 MRC2Q9UBG0 1479 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRZ1-204ENST00000470504 WIZO95785 1651 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRZ1-204ENST00000470504 WDR62O43379 1518 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRZ1-204ENST00000470504 CEP164Q9UPV0 1460 aa15.27■□□□□ 0.03
PTPRZ1-204ENST00000470504 FANCD2Q9BXW9 1451 aa15.2■□□□□ 0.02
PTPRZ1-204ENST00000470504 CFTRP13569 1480 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRZ1-204ENST00000470504 TRIM41Q8WV44 630 aa15.17■□□□□ 0.02
PTPRZ1-204ENST00000470504 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
PTPRZ1-204ENST00000470504 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
PTPRZ1-204ENST00000470504 PRDM2Q13029 1718 aa15.11■□□□□ 0.01
PTPRZ1-204ENST00000470504 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0.01
PTPRZ1-204ENST00000470504 OSCARQ8IYS5 282 aa15.04■□□□□ -0
PTPRZ1-204ENST00000470504 IFT140Q96RY7 1462 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRZ1-204ENST00000470504 CCDC88BA6NC98 1476 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRZ1-204ENST00000470504 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRZ1-204ENST00000470504 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRZ1-204ENST00000470504 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRZ1-204ENST00000470504 TOPBP1Q92547 1522 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRZ1-204ENST00000470504 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
PTPRZ1-204ENST00000470504 ABCC8Q09428 1581 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRZ1-204ENST00000470504 FOXD1Q16676 465 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRZ1-204ENST00000470504 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
PTPRZ1-204ENST00000470504 DNMBPQ6XZF7 1577 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRZ1-204ENST00000470504 ARHGEF11O15085 1522 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRZ1-204ENST00000470504 CHD1O14646 1710 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRZ1-204ENST00000470504 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
PTPRZ1-204ENST00000470504 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP14.75□□□□□ -0.05
PTPRZ1-204ENST00000470504 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PTPRZ1-204ENST00000470504 WDR97A6NE52 1622 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRZ1-204ENST00000470504 ARAP1Q96P48 1450 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRZ1-204ENST00000470504 CYB5RLQ6IPT4 315 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRZ1-204ENST00000470504 FBLN2P98095 1184 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRZ1-204ENST00000470504 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRZ1-204ENST00000470504 SOGA1O94964 1423 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRZ1-204ENST00000470504 FGD5Q6ZNL6 1462 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRZ1-204ENST00000470504 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa14.63□□□□□ -0.07
PTPRZ1-204ENST00000470504 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PTPRZ1-204ENST00000470504 CLASP1Q7Z460 1538 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRZ1-204ENST00000470504 SYNJ1O43426 1573 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRZ1-204ENST00000470504 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PTPRZ1-204ENST00000470504 CUX1P39880 1505 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRZ1-204ENST00000470504 TRHP20396 242 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
PTPRZ1-204ENST00000470504 GRIN2BQ13224 1484 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRZ1-204ENST00000470504 PBRM1Q86U86 1689 aa14.55□□□□□ -0.08
PTPRZ1-204ENST00000470504 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
PTPRZ1-204ENST00000470504 SYNJ2O15056 1496 aa14.54□□□□□ -0.08
PTPRZ1-204ENST00000470504 GAPVD1Q14C86 1478 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRZ1-204ENST00000470504 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRZ1-204ENST00000470504 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa14.46□□□□□ -0.09
PTPRZ1-204ENST00000470504 ADAMTS12P58397 1594 aa14.39□□□□□ -0.11
PTPRZ1-204ENST00000470504 GRIN2AQ12879 1464 aa14.38□□□□□ -0.11
PTPRZ1-204ENST00000470504 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa14.37□□□□□ -0.11
PTPRZ1-204ENST00000470504 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP14.36□□□□□ -0.11
PTPRZ1-204ENST00000470504 CEP170Q5SW79 1584 aa14.34□□□□□ -0.11
PTPRZ1-204ENST00000470504 TOP2BQ02880 1626 aa14.34□□□□□ -0.11
PTPRZ1-204ENST00000470504 ERCC6L2Q5T890 1561 aa14.34□□□□□ -0.11
PTPRZ1-204ENST00000470504 NUP160Q12769 1436 aa14.33□□□□□ -0.11
PTPRZ1-204ENST00000470504 SHROOM2Q13796 1616 aa14.32□□□□□ -0.12
PTPRZ1-204ENST00000470504 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
PTPRZ1-204ENST00000470504 FHAD1B1AJZ9 1412 aa14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.5 ms