RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000432008.1

HTATSF1P1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1 pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene HTATSF1P1, Length 984 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1P1-201ENST00000432008 NISCHQ9Y2I1 1504 aa27.78■■■□□ 2.04
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HTATSF1P1-201ENST00000432008 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.74■■□□□ 1.55
HTATSF1P1-201ENST00000432008 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.41■■□□□ 1.5
HTATSF1P1-201ENST00000432008 NACADO15069 1562 aa24.06■■□□□ 1.44
HTATSF1P1-201ENST00000432008 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.87■■□□□ 1.41
HTATSF1P1-201ENST00000432008 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.84■■□□□ 1.41
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HTATSF1P1-201ENST00000432008 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.53■■□□□ 1.36
HTATSF1P1-201ENST00000432008 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.42■■□□□ 1.34
HTATSF1P1-201ENST00000432008 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.41■■□□□ 1.34
HTATSF1P1-201ENST00000432008 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.38■■□□□ 1.33
HTATSF1P1-201ENST00000432008 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.28■■□□□ 1.32
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HTATSF1P1-201ENST00000432008 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.52■■□□□ 1.2
HTATSF1P1-201ENST00000432008 ERCC6Q03468 1493 aa22.43■■□□□ 1.18
HTATSF1P1-201ENST00000432008 NCAPD3P42695 1498 aa22.17■■□□□ 1.14
HTATSF1P1-201ENST00000432008 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
HTATSF1P1-201ENST00000432008 HMGXB3Q12766 1538 aa22.03■■□□□ 1.12
HTATSF1P1-201ENST00000432008 NESP48681 1621 aa22.02■■□□□ 1.12
HTATSF1P1-201ENST00000432008 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.01■■□□□ 1.11
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HTATSF1P1-201ENST00000432008 TRIM41Q8WV44 630 aa21.97■■□□□ 1.11
HTATSF1P1-201ENST00000432008 SMARCA4P51532 1647 aa21.87■■□□□ 1.09
HTATSF1P1-201ENST00000432008 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.85■■□□□ 1.09
HTATSF1P1-201ENST00000432008 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.79■■□□□ 1.08
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HTATSF1P1-201ENST00000432008 PEG3Q9GZU2 1588 aa21.68■■□□□ 1.06
HTATSF1P1-201ENST00000432008 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
HTATSF1P1-201ENST00000432008 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.58■■□□□ 1.05
HTATSF1P1-201ENST00000432008 WDR62O43379 1518 aa21.58■■□□□ 1.04
HTATSF1P1-201ENST00000432008 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.44■■□□□ 1.02
HTATSF1P1-201ENST00000432008 MROH2BQ7Z745 1585 aa21.38■■□□□ 1.01
HTATSF1P1-201ENST00000432008 OSCARQ8IYS5 282 aa21.36■■□□□ 1.01
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HTATSF1P1-201ENST00000432008 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.29■■□□□ 1
HTATSF1P1-201ENST00000432008 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.24■□□□□ 0.99
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HTATSF1P1-201ENST00000432008 CHD1O14646 1710 aa20.84■□□□□ 0.93
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HTATSF1P1-201ENST00000432008 TOPBP1Q92547 1522 aa20.77■□□□□ 0.92
HTATSF1P1-201ENST00000432008 ABCC8Q09428 1581 aa20.68■□□□□ 0.9
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HTATSF1P1-201ENST00000432008 CLASP1Q7Z460 1538 aa20.58■□□□□ 0.89
HTATSF1P1-201ENST00000432008 FBLN2P98095 1184 aa20.57■□□□□ 0.88
HTATSF1P1-201ENST00000432008 CCDC88BA6NC98 1476 aa20.52■□□□□ 0.88
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HTATSF1P1-201ENST00000432008 WDR97A6NE52 1622 aa20.48■□□□□ 0.87
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HTATSF1P1-201ENST00000432008 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
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HTATSF1P1-201ENST00000432008 SOGA1O94964 1423 aa20.34■□□□□ 0.85
HTATSF1P1-201ENST00000432008 SYNJ2O15056 1496 aa20.33■□□□□ 0.85
HTATSF1P1-201ENST00000432008 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
HTATSF1P1-201ENST00000432008 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
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HTATSF1P1-201ENST00000432008 KIF13AQ9H1H9 1805 aa20.14■□□□□ 0.81
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HTATSF1P1-201ENST00000432008 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.1■□□□□ 0.81
HTATSF1P1-201ENST00000432008 CEP170Q5SW79 1584 aa20.09■□□□□ 0.81
HTATSF1P1-201ENST00000432008 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
HTATSF1P1-201ENST00000432008 GRIN2AQ12879 1464 aa20.06■□□□□ 0.8
HTATSF1P1-201ENST00000432008 SHROOM2Q13796 1616 aa20.04■□□□□ 0.8
HTATSF1P1-201ENST00000432008 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.02■□□□□ 0.8
HTATSF1P1-201ENST00000432008 ADAMTS12P58397 1594 aa20.02■□□□□ 0.8
HTATSF1P1-201ENST00000432008 NUP160Q12769 1436 aa20.02■□□□□ 0.79
HTATSF1P1-201ENST00000432008 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
HTATSF1P1-201ENST00000432008 ABCC10Q5T3U5 1492 aa19.92■□□□□ 0.78
HTATSF1P1-201ENST00000432008 DIP2BQ9P265 1576 aa19.91■□□□□ 0.78
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HTATSF1P1-201ENST00000432008 MAPKBP1O60336 1514 aa19.9■□□□□ 0.78
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