RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372418.2

PRPS1-201, Transcript of phosphoribosyl pyrophosphate synthetase 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene PRPS1, Length 942 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPS1-201ENST00000372418 NISCHQ9Y2I1 1504 aa27.28■■□□□ 1.96
PRPS1-201ENST00000372418 ABCC9O60706 1549 aa24.99■■□□□ 1.59
PRPS1-201ENST00000372418 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa24.53■■□□□ 1.52
PRPS1-201ENST00000372418 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
PRPS1-201ENST00000372418 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.86■■□□□ 1.41
PRPS1-201ENST00000372418 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.48■■□□□ 1.35
PRPS1-201ENST00000372418 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.25■■□□□ 1.31
PRPS1-201ENST00000372418 NACADO15069 1562 aa23.23■■□□□ 1.31
PRPS1-201ENST00000372418 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.16■■□□□ 1.3
PRPS1-201ENST00000372418 DCAF8L2P0C7V8 631 aa23.13■■□□□ 1.29
PRPS1-201ENST00000372418 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.04■■□□□ 1.28
PRPS1-201ENST00000372418 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.02■■□□□ 1.28
PRPS1-201ENST00000372418 MYO15BQ96JP2 1530 aa22.77■■□□□ 1.24
PRPS1-201ENST00000372418 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
PRPS1-201ENST00000372418 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.53■■□□□ 1.2
PRPS1-201ENST00000372418 SCRIBQ14160 1630 aa22.49■■□□□ 1.19
PRPS1-201ENST00000372418 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.47■■□□□ 1.19
PRPS1-201ENST00000372418 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa22.41■■□□□ 1.18
PRPS1-201ENST00000372418 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
PRPS1-201ENST00000372418 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa22.36■■□□□ 1.17
PRPS1-201ENST00000372418 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.91■■□□□ 1.1
PRPS1-201ENST00000372418 NCAPD3P42695 1498 aa21.51■■□□□ 1.03
PRPS1-201ENST00000372418 CUX2O14529 1486 aa21.49■■□□□ 1.03
PRPS1-201ENST00000372418 ERCC6Q03468 1493 aa21.45■■□□□ 1.03
PRPS1-201ENST00000372418 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa21.45■■□□□ 1.03
PRPS1-201ENST00000372418 NESP48681 1621 aa21.45■■□□□ 1.02
PRPS1-201ENST00000372418 SMARCA4P51532 1647 aa21.37■■□□□ 1.01
PRPS1-201ENST00000372418 HMGXB3Q12766 1538 aa21.3■■□□□ 1
PRPS1-201ENST00000372418 SMARCA2P51531 1590 aa21.26■□□□□ 0.99
PRPS1-201ENST00000372418 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
PRPS1-201ENST00000372418 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
PRPS1-201ENST00000372418 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.12■□□□□ 0.97
PRPS1-201ENST00000372418 MROH2BQ7Z745 1585 aa21.11■□□□□ 0.97
PRPS1-201ENST00000372418 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
PRPS1-201ENST00000372418 PEG3Q9GZU2 1588 aa21.1■□□□□ 0.97
PRPS1-201ENST00000372418 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.03■□□□□ 0.96
PRPS1-201ENST00000372418 PDS5BQ9NTI5 1447 aa20.87■□□□□ 0.93
PRPS1-201ENST00000372418 TRIM41Q8WV44 630 aa20.87■□□□□ 0.93
PRPS1-201ENST00000372418 WIZO95785 1651 aa20.85■□□□□ 0.93
PRPS1-201ENST00000372418 CADPSQ9ULU8 1353 aa20.84■□□□□ 0.93
PRPS1-201ENST00000372418 MRC2Q9UBG0 1479 aa20.81■□□□□ 0.92
PRPS1-201ENST00000372418 WDR62O43379 1518 aa20.8■□□□□ 0.92
PRPS1-201ENST00000372418 FANCD2Q9BXW9 1451 aa20.63■□□□□ 0.89
PRPS1-201ENST00000372418 CEP164Q9UPV0 1460 aa20.63■□□□□ 0.89
PRPS1-201ENST00000372418 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
PRPS1-201ENST00000372418 CFTRP13569 1480 aa20.56■□□□□ 0.88
PRPS1-201ENST00000372418 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.87
PRPS1-201ENST00000372418 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
PRPS1-201ENST00000372418 OSCARQ8IYS5 282 aa20.44■□□□□ 0.86
PRPS1-201ENST00000372418 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
PRPS1-201ENST00000372418 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa20.38■□□□□ 0.85
PRPS1-201ENST00000372418 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.38■□□□□ 0.85
PRPS1-201ENST00000372418 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.38■□□□□ 0.85
PRPS1-201ENST00000372418 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
PRPS1-201ENST00000372418 PRDM2Q13029 1718 aa20.3■□□□□ 0.84
PRPS1-201ENST00000372418 CCDC88BA6NC98 1476 aa20.29■□□□□ 0.84
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PRPS1-201ENST00000372418 ARHGEF11O15085 1522 aa20.25■□□□□ 0.83
PRPS1-201ENST00000372418 TOPBP1Q92547 1522 aa20.23■□□□□ 0.83
PRPS1-201ENST00000372418 IFT140Q96RY7 1462 aa20.22■□□□□ 0.83
PRPS1-201ENST00000372418 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
PRPS1-201ENST00000372418 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.14■□□□□ 0.81
PRPS1-201ENST00000372418 CHD1O14646 1710 aa20.13■□□□□ 0.81
PRPS1-201ENST00000372418 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
PRPS1-201ENST00000372418 DNMBPQ6XZF7 1577 aa20.09■□□□□ 0.81
PRPS1-201ENST00000372418 CYB5RLQ6IPT4 315 aa20.09■□□□□ 0.81
PRPS1-201ENST00000372418 ARAP1Q96P48 1450 aa20.08■□□□□ 0.81
PRPS1-201ENST00000372418 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.03■□□□□ 0.8
PRPS1-201ENST00000372418 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
PRPS1-201ENST00000372418 ABCC8Q09428 1581 aa19.96■□□□□ 0.79
PRPS1-201ENST00000372418 FBLN2P98095 1184 aa19.96■□□□□ 0.79
PRPS1-201ENST00000372418 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
PRPS1-201ENST00000372418 TRHP20396 242 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
PRPS1-201ENST00000372418 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa19.89■□□□□ 0.77
PRPS1-201ENST00000372418 CLASP1Q7Z460 1538 aa19.88■□□□□ 0.77
PRPS1-201ENST00000372418 FGD5Q6ZNL6 1462 aa19.86■□□□□ 0.77
PRPS1-201ENST00000372418 SOGA1O94964 1423 aa19.85■□□□□ 0.77
PRPS1-201ENST00000372418 CUX1P39880 1505 aa19.84■□□□□ 0.77
PRPS1-201ENST00000372418 WDR97A6NE52 1622 aa19.76■□□□□ 0.75
PRPS1-201ENST00000372418 SYNJ1O43426 1573 aa19.7■□□□□ 0.74
PRPS1-201ENST00000372418 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP19.7■□□□□ 0.74
PRPS1-201ENST00000372418 GRIN2BQ13224 1484 aa19.7■□□□□ 0.74
PRPS1-201ENST00000372418 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP19.7■□□□□ 0.74
PRPS1-201ENST00000372418 ERCC6L2Q5T890 1561 aa19.69■□□□□ 0.74
PRPS1-201ENST00000372418 PBRM1Q86U86 1689 aa19.68■□□□□ 0.74
PRPS1-201ENST00000372418 SYNJ2O15056 1496 aa19.68■□□□□ 0.74
PRPS1-201ENST00000372418 GAPVD1Q14C86 1478 aa19.63■□□□□ 0.73
PRPS1-201ENST00000372418 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa19.61■□□□□ 0.73
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PRPS1-201ENST00000372418 CEP170Q5SW79 1584 aa19.53■□□□□ 0.72
PRPS1-201ENST00000372418 GRIN2AQ12879 1464 aa19.49■□□□□ 0.71
PRPS1-201ENST00000372418 ADAMTS12P58397 1594 aa19.49■□□□□ 0.71
PRPS1-201ENST00000372418 NUP160Q12769 1436 aa19.45■□□□□ 0.7
PRPS1-201ENST00000372418 SHROOM2Q13796 1616 aa19.42■□□□□ 0.7
PRPS1-201ENST00000372418 KIF13AQ9H1H9 1805 aa19.38■□□□□ 0.69
PRPS1-201ENST00000372418 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa19.36■□□□□ 0.69
PRPS1-201ENST00000372418 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP19.36■□□□□ 0.69
PRPS1-201ENST00000372418 TOP2BQ02880 1626 aa19.36■□□□□ 0.69
PRPS1-201ENST00000372418 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP19.35■□□□□ 0.69
PRPS1-201ENST00000372418 FHAD1B1AJZ9 1412 aa19.32■□□□□ 0.68
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