RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342835.8

SPTB-201, Transcript of spectrin beta, erythrocytic, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SPTB, Length 1,723 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTB-201ENST00000342835 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.68■■■■■ 5.38
SPTB-201ENST00000342835 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.34■■■■■ 4.37
SPTB-201ENST00000342835 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.99■■■■■ 4.15
SPTB-201ENST00000342835 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.35■■■■■ 4.05
SPTB-201ENST00000342835 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39.94■■■■□ 3.98
SPTB-201ENST00000342835 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.88■■■■□ 3.97
SPTB-201ENST00000342835 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.73■■■■□ 3.95
SPTB-201ENST00000342835 ABCC9O60706 1549 aa39.46■■■■□ 3.91
SPTB-201ENST00000342835 NACADO15069 1562 aa39.31■■■■□ 3.88
SPTB-201ENST00000342835 SCRIBQ14160 1630 aa38.87■■■■□ 3.81
SPTB-201ENST00000342835 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.86■■■■□ 3.81
SPTB-201ENST00000342835 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.63■■■■□ 3.78
SPTB-201ENST00000342835 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.98■■■■□ 3.67
SPTB-201ENST00000342835 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.89■■■■□ 3.66
SPTB-201ENST00000342835 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.68■■■■□ 3.62
SPTB-201ENST00000342835 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.61■■■■□ 3.61
SPTB-201ENST00000342835 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.56■■■■□ 3.6
SPTB-201ENST00000342835 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.56■■■■□ 3.6
SPTB-201ENST00000342835 SMARCA4P51532 1647 aa37.33■■■■□ 3.57
SPTB-201ENST00000342835 WIZO95785 1651 aa37.28■■■■□ 3.56
SPTB-201ENST00000342835 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.24■■■■□ 3.55
SPTB-201ENST00000342835 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP37.24■■■■□ 3.55
SPTB-201ENST00000342835 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37■■■■□ 3.51
SPTB-201ENST00000342835 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.89■■■■□ 3.5
SPTB-201ENST00000342835 SMARCA2P51531 1590 aa36.67■■■■□ 3.46
SPTB-201ENST00000342835 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.58■■■■□ 3.45
SPTB-201ENST00000342835 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.56■■■■□ 3.44
SPTB-201ENST00000342835 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.49■■■■□ 3.43
SPTB-201ENST00000342835 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.45■■■■□ 3.43
SPTB-201ENST00000342835 TRIM41Q8WV44 630 aa36.38■■■■□ 3.41
SPTB-201ENST00000342835 HMGXB3Q12766 1538 aa36.27■■■■□ 3.4
SPTB-201ENST00000342835 NCAPD3P42695 1498 aa36.23■■■■□ 3.39
SPTB-201ENST00000342835 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.08■■■■□ 3.37
SPTB-201ENST00000342835 ABCC8Q09428 1581 aa35.89■■■■□ 3.34
SPTB-201ENST00000342835 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.76■■■■□ 3.32
SPTB-201ENST00000342835 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa35.74■■■■□ 3.31
SPTB-201ENST00000342835 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.71■■■■□ 3.31
SPTB-201ENST00000342835 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP35.6■■■■□ 3.29
SPTB-201ENST00000342835 EEA1Q15075 1411 aa35.56■■■■□ 3.28
SPTB-201ENST00000342835 CFTRP13569 1480 aa35.54■■■■□ 3.28
SPTB-201ENST00000342835 SYNJ1O43426 1573 aa35.48■■■■□ 3.27
SPTB-201ENST00000342835 PRDM2Q13029 1718 aa35.46■■■■□ 3.27
SPTB-201ENST00000342835 TOP2BQ02880 1626 aa35.38■■■■□ 3.25
SPTB-201ENST00000342835 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.35■■■■□ 3.25
SPTB-201ENST00000342835 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.32■■■■□ 3.25
SPTB-201ENST00000342835 SOGA1O94964 1423 aa35.31■■■■□ 3.24
SPTB-201ENST00000342835 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.18■■■■□ 3.22
SPTB-201ENST00000342835 CUX1P39880 1505 aa35.11■■■■□ 3.21
SPTB-201ENST00000342835 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.09■■■■□ 3.21
SPTB-201ENST00000342835 EHMT2Q96KQ7 1210 aa35.01■■■■□ 3.2
SPTB-201ENST00000342835 GOLGA3Q08378 1498 aa35.01■■■■□ 3.2
SPTB-201ENST00000342835 KIF21BO75037 1637 aa35■■■■□ 3.19
SPTB-201ENST00000342835 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.98■■■■□ 3.19
SPTB-201ENST00000342835 TNIKQ9UKE5 1360 aa34.97■■■■□ 3.19
SPTB-201ENST00000342835 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.97■■■■□ 3.19
SPTB-201ENST00000342835 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.94■■■■□ 3.18
SPTB-201ENST00000342835 KIF27Q86VH2 1401 aa34.81■■■■□ 3.16
SPTB-201ENST00000342835 CEP162Q5TB80 1403 aa34.78■■■■□ 3.16
SPTB-201ENST00000342835 UBTFP17480 764 aaKnown RBP34.76■■■■□ 3.16
SPTB-201ENST00000342835 NESP48681 1621 aa34.75■■■■□ 3.15
SPTB-201ENST00000342835 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.75■■■■□ 3.15
SPTB-201ENST00000342835 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.7■■■■□ 3.15
SPTB-201ENST00000342835 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.69■■■■□ 3.14
SPTB-201ENST00000342835 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.68■■■■□ 3.14
SPTB-201ENST00000342835 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP34.66■■■■□ 3.14
SPTB-201ENST00000342835 PCGF6Q9BYE7 350 aa34.65■■■■□ 3.14
SPTB-201ENST00000342835 PRXQ9BXM0 1461 aa34.64■■■■□ 3.14
SPTB-201ENST00000342835 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa34.6■■■■□ 3.13
SPTB-201ENST00000342835 TOPBP1Q92547 1522 aa34.6■■■■□ 3.13
SPTB-201ENST00000342835 CUX2O14529 1486 aa34.55■■■■□ 3.12
SPTB-201ENST00000342835 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.44■■■■□ 3.1
SPTB-201ENST00000342835 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.44■■■■□ 3.1
SPTB-201ENST00000342835 CLIP1P30622 1438 aa34.43■■■■□ 3.1
SPTB-201ENST00000342835 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.42■■■■□ 3.1
SPTB-201ENST00000342835 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.4■■■■□ 3.1
SPTB-201ENST00000342835 IGF1RP08069 1367 aa34.36■■■■□ 3.09
SPTB-201ENST00000342835 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.28■■■■□ 3.08
SPTB-201ENST00000342835 WDR97A6NE52 1622 aa34.26■■■■□ 3.08
SPTB-201ENST00000342835 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.23■■■■□ 3.07
SPTB-201ENST00000342835 VPS8Q8N3P4 1428 aa34.21■■■■□ 3.07
SPTB-201ENST00000342835 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.19■■■■□ 3.06
SPTB-201ENST00000342835 CUL7Q14999 1698 aa34.18■■■■□ 3.06
SPTB-201ENST00000342835 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.1■■■■□ 3.05
SPTB-201ENST00000342835 HRCP23327 699 aa34.1■■■■□ 3.05
SPTB-201ENST00000342835 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.03■■■■□ 3.04
SPTB-201ENST00000342835 GAPVD1Q14C86 1478 aa34■■■■□ 3.03
SPTB-201ENST00000342835 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP33.99■■■■□ 3.03
SPTB-201ENST00000342835 ARAP1Q96P48 1450 aa33.98■■■■□ 3.03
SPTB-201ENST00000342835 WDR62O43379 1518 aa33.98■■■■□ 3.03
SPTB-201ENST00000342835 APLP2Q06481 763 aa33.95■■■■□ 3.03
SPTB-201ENST00000342835 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP33.93■■■■□ 3.02
SPTB-201ENST00000342835 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.91■■■■□ 3.02
SPTB-201ENST00000342835 ERCC6Q03468 1493 aa33.89■■■■□ 3.02
SPTB-201ENST00000342835 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa33.89■■■■□ 3.02
SPTB-201ENST00000342835 IFT140Q96RY7 1462 aa33.87■■■■□ 3.01
SPTB-201ENST00000342835 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa33.83■■■■□ 3.01
SPTB-201ENST00000342835 PBRM1Q86U86 1689 aa33.79■■■■□ 3
SPTB-201ENST00000342835 EFCAB5A4FU69 1503 aa33.76■■■□□ 2.99
SPTB-201ENST00000342835 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.74■■■□□ 2.99
SPTB-201ENST00000342835 GRIN2BQ13224 1484 aa33.7■■■□□ 2.99
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