RNA–Protein interactions for RNA: YJL095W

BCK1, Transcript of MAPKKK acting in the protein kinase C signaling pathway, yeast

Gene BCK1, Length 4,437 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BCK1	YJL095W	LSB1	P53281	241 aa		2.99	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	FUS2	Q05670	677 aa		2.99	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	COG4	Q06096	861 aa		2.99	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	YCG1	Q06680	1035 aa		2.99	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	MAL33	P38157	468 aa		2.99	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	NPR3	P38742	1146 aa		2.99	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	NUP82	P40368	713 aa		2.99	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	MSN5	P52918	1224 aa		2.99	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	CIR2	Q08822	631 aa		2.99	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	STE11	P23561	717 aa		2.99	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	VTC2	P43585	828 aa		2.99	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	HXT17	P53631	564 aa		2.99	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	RPL22B	P56628	122 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	HIR1	P32479	840 aa		2.99	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	GLC3	P32775	704 aa		2.99	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	CST26	P38226	397 aa		2.99	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	CTF18	P49956	741 aa		2.99	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	VID30	P53076	958 aa		2.99	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	TIM50	Q02776	476 aa		2.99	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	MFM1	Q02783	413 aa		2.99	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	CSM3	Q04659	317 aa		2.99	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	KIN1	P13185	1064 aa		2.98	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	SEC8	P32855	1065 aa		2.98	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	MRPL10	P36520	322 aa		2.98	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	SGM1	P47166	707 aa		2.98	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	IRC4	Q03036	179 aa		2.98	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	PMD1	P32634	1753 aa		2.98	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	COQ1	P18900	473 aa		2.98	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	YKU70	P32807	602 aa		2.98	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	NFU1	P32860	256 aa		2.98	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	YML020W	Q03722	664 aa		2.98	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	INM2	Q05533	292 aa		2.98	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	SRM1	P21827	482 aa		2.98	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	MSM1	P22438	575 aa		2.98	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	VPS45	P38932	577 aa		2.98	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	SDS3	P40505	327 aa		2.98	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	CEP3	P40969	608 aa		2.98	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	CWH41	P53008	833 aa		2.98	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	DPL1	Q05567	589 aa		2.98	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	TFC6	Q06339	672 aa		2.98	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	YOR296W	Q08748	1289 aa		2.98	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	PRE8	P23639	250 aa		2.97	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	VPS35	P34110	944 aa		2.97	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	GRX7	P38068	203 aa		2.97	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	PUS6	P53294	404 aa		2.97	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	MDM1	Q01846	1127 aa		2.97	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	OPY2	Q06810	360 aa		2.97	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	SUB2	Q07478	446 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	BUD2	P33314	1104 aa		2.97	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	SPL2	P38839	148 aa		2.97	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	FOL1	P53848	824 aa		2.97	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	DIP2	Q12220	943 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	PCK1	P10963	549 aa		2.97	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	PXA1	P41909	870 aa		2.97	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	FIG4	P42837	879 aa		2.97	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	RSC1	P53236	928 aa		2.97	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	FCP1	Q03254	732 aa		2.97	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	RLP24	Q07915	199 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	DSE3	Q08729	430 aa		2.97	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	NUC1	P08466	329 aa		2.96	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	TCP1	P12612	559 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	RFC5	P38251	354 aa		2.96	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	NOP58	Q12499	511 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.93
BCK1	YJL095W	CIT1	P00890	479 aa		2.96	□□□□□ -1.94
BCK1	YJL095W	SEC23	P15303	768 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
BCK1	YJL095W	ATE1	P16639	503 aa		2.96	□□□□□ -1.94
BCK1	YJL095W	PHO13	P19881	312 aa		2.96	□□□□□ -1.94
BCK1	YJL095W	SPO11	P23179	398 aa		2.96	□□□□□ -1.94
BCK1	YJL095W	RDS1	P25611	832 aa		2.96	□□□□□ -1.94
BCK1	YJL095W	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
BCK1	YJL095W	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
BCK1	YJL095W	MDL2	P33311	773 aa		2.96	□□□□□ -1.94
BCK1	YJL095W	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
BCK1	YJL095W	ISW1	P38144	1129 aa		2.96	□□□□□ -1.94

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