Protein–RNA interactions for Protein: P40093

YER156C, UPF0160 protein YER156C, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YER156CP40093 YML009W-BYML009W-B 477 nt25.15■■□□□ 1.62
YER156CP40093 NOP1YDL014W 984 nt24.77■■□□□ 1.56
YER156CP40093 NSR1YGR159C 1245 nt24.3■■□□□ 1.48
YER156CP40093 YKL036CYKL036C 393 nt23.58■■□□□ 1.37
YER156CP40093 YJL027CYJL027C 417 nt22.16■■□□□ 1.14
YER156CP40093 Q0297Q0297 156 nt21.93■■□□□ 1.1
YER156CP40093 SCS3YGL126W 1143 nt21.85■■□□□ 1.09
YER156CP40093 SRX1YKL086W 384 nt21.64■■□□□ 1.05
YER156CP40093 MDJ1YFL016C 1536 nt20.83■□□□□ 0.93
YER156CP40093 YCR051WYCR051W 669 nt20.59■□□□□ 0.89
YER156CP40093 YOL085CYOL085C 342 nt20.39■□□□□ 0.85
YER156CP40093 SCJ1YMR214W 1134 nt20.35■□□□□ 0.85
YER156CP40093 PKP1YIL042C 1185 nt19.98■□□□□ 0.79
YER156CP40093 ATS1YAL020C 1002 nt19.75■□□□□ 0.75
YER156CP40093 RPP1BYDL130W 321 nt19.68■□□□□ 0.74
YER156CP40093 TRN1tP(UGG)A 72 nt19.11■□□□□ 0.65
YER156CP40093 SUF9tP(UGG)F 72 nt19.11■□□□□ 0.65
YER156CP40093 SUF8tP(UGG)H 72 nt19.11■□□□□ 0.65
YER156CP40093 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt19.11■□□□□ 0.65
YER156CP40093 SUF7tP(UGG)M 72 nt19.11■□□□□ 0.65
YER156CP40093 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt19.11■□□□□ 0.65
YER156CP40093 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt19.11■□□□□ 0.65
YER156CP40093 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt19.11■□□□□ 0.65
YER156CP40093 SUF11tP(UGG)O2 72 nt19.11■□□□□ 0.65
YER156CP40093 CCC1YLR220W 969 nt18.91■□□□□ 0.62
YER156CP40093 SCR1SCR1 522 nt18.74■□□□□ 0.59
YER156CP40093 DBP2YNL112W 1641 nt18.74■□□□□ 0.59
YER156CP40093 PET122YER153C 765 nt18.71■□□□□ 0.59
YER156CP40093 RTC3YHR087W 336 nt18.48■□□□□ 0.55
YER156CP40093 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt18.32■□□□□ 0.52
YER156CP40093 RRN5YLR141W 1092 nt18.24■□□□□ 0.51
YER156CP40093 PST2YDR032C 597 nt18.16■□□□□ 0.5
YER156CP40093 RSB1YOR049C 1065 nt18.12■□□□□ 0.49
YER156CP40093 YER088W-BYER088W-B 147 nt17.89■□□□□ 0.45
YER156CP40093 YKL097CYKL097C 411 nt17.88■□□□□ 0.45
YER156CP40093 RVS167YDR388W 1449 nt17.84■□□□□ 0.45
YER156CP40093 YDJ1YNL064C 1230 nt17.73■□□□□ 0.43
YER156CP40093 YBR190WYBR190W 312 nt17.57■□□□□ 0.4
YER156CP40093 SHR5YOL110W 714 nt17.4■□□□□ 0.38
YER156CP40093 SHU1YHL006C 453 nt17.24■□□□□ 0.35
YER156CP40093 GAR1YHR089C 618 nt17.21■□□□□ 0.35
YER156CP40093 YOR139CYOR139C 393 nt16.99■□□□□ 0.31
YER156CP40093 NPL3YDR432W 1245 nt16.71■□□□□ 0.27
YER156CP40093 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt16.71■□□□□ 0.27
YER156CP40093 DEP1YAL013W 1218 nt16.62■□□□□ 0.25
YER156CP40093 TIR1YER011W 765 nt16.59■□□□□ 0.25
YER156CP40093 YNL208WYNL208W 600 nt16.46■□□□□ 0.23
YER156CP40093 URN1YPR152C 1398 nt16.41■□□□□ 0.22
YER156CP40093 RPN10YHR200W 807 nt16.38■□□□□ 0.21
YER156CP40093 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt16.27■□□□□ 0.2
YER156CP40093 IMT4tM(CAU)E 72 nt16.27■□□□□ 0.2
YER156CP40093 IMT3tM(CAU)J3 72 nt16.27■□□□□ 0.2
YER156CP40093 IMT1tM(CAU)O1 72 nt16.27■□□□□ 0.2
YER156CP40093 IMT2tM(CAU)P 72 nt16.27■□□□□ 0.2
YER156CP40093 YOL037CYOL037C 354 nt16.24■□□□□ 0.19
YER156CP40093 SSA1YAL005C 1929 nt16.21■□□□□ 0.19
YER156CP40093 MNP1YGL068W 585 nt16.17■□□□□ 0.18
YER156CP40093 YGR021WYGR021W 873 nt16.17■□□□□ 0.18
YER156CP40093 HOM6YJR139C 1080 nt16.14■□□□□ 0.17
YER156CP40093 SRB2YHR041C 633 nt16.09■□□□□ 0.17
YER156CP40093 OPI9YLR338W 858 nt16.02■□□□□ 0.16
YER156CP40093 BSC6YOL137W 1494 nt15.99■□□□□ 0.15
YER156CP40093 WWM1YFL010C 636 nt15.99■□□□□ 0.15
YER156CP40093 MOT3YMR070W 1473 nt15.97■□□□□ 0.15
YER156CP40093 RKM5YLR137W 1104 nt15.9■□□□□ 0.14
YER156CP40093 PUS2YGL063W 1113 nt15.87■□□□□ 0.13
YER156CP40093 YLR281CYLR281C 468 nt15.77■□□□□ 0.12
YER156CP40093 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt15.74■□□□□ 0.11
YER156CP40093 YJR018WYJR018W 363 nt15.71■□□□□ 0.11
YER156CP40093 SAH1YER043C 1350 nt15.7■□□□□ 0.1
YER156CP40093 MRPL8YJL063C 717 nt15.64■□□□□ 0.09
YER156CP40093 RPP2BYDR382W 333 nt15.63■□□□□ 0.09
YER156CP40093 YJR120WYJR120W 351 nt15.62■□□□□ 0.09
YER156CP40093 WHI5YOR083W 888 nt15.6■□□□□ 0.09
YER156CP40093 PUN1YLR414C 792 nt15.58■□□□□ 0.08
YER156CP40093 SSA3YBL075C 1950 nt15.49■□□□□ 0.07
YER156CP40093 FMP45YDL222C 930 nt15.49■□□□□ 0.07
YER156CP40093 BDH2YAL061W 1254 nt15.43■□□□□ 0.06
YER156CP40093 YCH1YGR203W 447 nt15.38■□□□□ 0.05
YER156CP40093 LSM3YLR438C-A 270 nt15.38■□□□□ 0.05
YER156CP40093 DSK2YMR276W 1122 nt15.38■□□□□ 0.05
YER156CP40093 UBX6YJL048C 1191 nt15.36■□□□□ 0.05
YER156CP40093 YPR011CYPR011C 981 nt15.36■□□□□ 0.05
YER156CP40093 ADO1YJR105W 1023 nt15.35■□□□□ 0.05
YER156CP40093 PUT4YOR348C 1884 nt15.32■□□□□ 0.04
YER156CP40093 ARE1YCR048W 1833 nt15.29■□□□□ 0.04
YER156CP40093 YLR236CYLR236C 324 nt15.29■□□□□ 0.04
YER156CP40093 IMP2'YIL154C 1041 nt15.28■□□□□ 0.04
YER156CP40093 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt15.23■□□□□ 0.03
YER156CP40093 YEL076CYEL076C 651 nt15.23■□□□□ 0.03
YER156CP40093 YLR464WYLR464W 651 nt15.23■□□□□ 0.03
YER156CP40093 PTC2YER089C 1395 nt15.23■□□□□ 0.03
YER156CP40093 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.12■□□□□ 0.01
YER156CP40093 INM2YDR287W 879 nt15.05■□□□□ -0
YER156CP40093 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt15.05■□□□□ -0
YER156CP40093 YBL100CYBL100C 315 nt15.04■□□□□ -0
YER156CP40093 RTG1YOL067C 534 nt15.04■□□□□ -0
YER156CP40093 SIS1YNL007C 1059 nt15.01□□□□□ -0.01
YER156CP40093 TRM9YML014W 840 nt15□□□□□ -0.01
YER156CP40093 SPP1YPL138C 1062 nt14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.2 ms