RNA–Protein interactions for RNA: YHR130C

YHR130C, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YHR130C, Length 336 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YHR130C	YHR130C	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
YHR130C	YHR130C	UGA4	P32837	571 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YHR130C	YHR130C	GPT2	P36148	743 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YHR130C	YHR130C	TOS1	P38288	455 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YHR130C	YHR130C	INP52	P50942	1183 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YHR130C	YHR130C	YAF9	P53930	226 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YHR130C	YHR130C	TOS4	Q06266	489 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YHR130C	YHR130C	YOR223W	Q12015	292 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YHR130C	YHR130C	SAM37	P50110	327 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YHR130C	YHR130C	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YHR130C	YHR130C	PMT7	Q06644	662 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YHR130C	YHR130C	MED7	Q08278	222 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YHR130C	YHR130C	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
YHR130C	YHR130C	PPX1	P38698	397 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YHR130C	YHR130C	IPL1	P38991	367 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YHR130C	YHR130C	THI12	P42883	340 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YHR130C	YHR130C	THI5	P43534	340 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YHR130C	YHR130C	THI11	P47183	340 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YHR130C	YHR130C	GCV1	P48015	400 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YHR130C	YHR130C	UTP22	P53254	1237 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
YHR130C	YHR130C	THI13	Q07748	340 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YHR130C	YHR130C	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
YHR130C	YHR130C	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
YHR130C	YHR130C	CTH1	P47976	325 aa		5	□□□□□ -1.61
YHR130C	YHR130C	GIC2	Q06648	383 aa		5	□□□□□ -1.61
YHR130C	YHR130C	CYC7	P00045	113 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YHR130C	YHR130C	LIP5	P32875	414 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YHR130C	YHR130C	SEA4	P38164	1038 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YHR130C	YHR130C	REI1	P38344	393 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YHR130C	YHR130C	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YHR130C	YHR130C	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
YHR130C	YHR130C	DAK2	P43550	591 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YHR130C	YHR130C	MEC3	Q02574	474 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YHR130C	YHR130C	DAL4	Q04895	635 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YHR130C	YHR130C	YCS4	Q06156	1176 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YHR130C	YHR130C	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YHR130C	YHR130C	PRP40	P33203	583 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YHR130C	YHR130C	EXO5	P38289	585 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YHR130C	YHR130C	SPO74	P45819	413 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YHR130C	YHR130C	SDH1	Q00711	640 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YHR130C	YHR130C	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
YHR130C	YHR130C	NEM1	P38757	446 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YHR130C	YHR130C	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YHR130C	YHR130C	SLS1	P42900	643 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YHR130C	YHR130C	EAR1	Q03212	550 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YHR130C	YHR130C	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YHR130C	YHR130C	FAA3	P39002	694 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YHR130C	YHR130C	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YHR130C	YHR130C	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YHR130C	YHR130C	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YHR130C	YHR130C	BRE4	Q07660	1125 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YHR130C	YHR130C	YLL054C	Q12244	843 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YHR130C	YHR130C	GCD6	P32501	712 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YHR130C	YHR130C	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.95	□□□□□ -1.62	RIP-Chip
YHR130C	YHR130C	VPS35	P34110	944 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YHR130C	YHR130C	MMM1	P41800	426 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YHR130C	YHR130C	YGR045C	P53229	120 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YHR130C	YHR130C	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YHR130C	YHR130C	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YHR130C	YHR130C	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YHR130C	YHR130C	YKL077W	P36081	392 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YHR130C	YHR130C	PEX13	P80667	386 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YHR130C	YHR130C	ULP1	Q02724	621 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YHR130C	YHR130C	MSH3	P25336	1018 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YHR130C	YHR130C	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YHR130C	YHR130C	RSM26	P47141	266 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YHR130C	YHR130C	YML020W	Q03722	664 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YHR130C	YHR130C	NFS1	P25374	497 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YHR130C	YHR130C	SEC20	P28791	383 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YHR130C	YHR130C	CIT3	P43635	486 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YHR130C	YHR130C	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YHR130C	YHR130C	AVO1	Q08236	1176 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YHR130C	YHR130C	SQT1	P35184	431 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YHR130C	YHR130C	ALT1	P52893	592 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YHR130C	YHR130C	RCM1	P53972	490 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YHR130C	YHR130C	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YHR130C	YHR130C	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YHR130C	YHR130C	PEX28	P38848	579 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YHR130C	YHR130C	SHU2	P38957	223 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YHR130C	YHR130C	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YHR130C	YHR130C	XKS1	P42826	600 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YHR130C	YHR130C	YPL109C	Q02981	657 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YHR130C	YHR130C	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YHR130C	YHR130C	OXR1	Q08952	273 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YHR130C	YHR130C	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YHR130C	YHR130C	KAR2	P16474	682 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YHR130C	YHR130C	ARL1	P38116	183 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YHR130C	YHR130C	YAR028W	P39548	234 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YHR130C	YHR130C	MTR4	P47047	1073 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YHR130C	YHR130C	AVT1	P47082	602 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YHR130C	YHR130C	YNR063W	P53749	607 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YHR130C	YHR130C	MCM2	P29469	868 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YHR130C	YHR130C	LRG1	P35688	1017 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YHR130C	YHR130C	PIC2	P40035	300 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YHR130C	YHR130C	YVC1	Q12324	675 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YHR130C	YHR130C	ATE1	P16639	503 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YHR130C	YHR130C	YGL140C	P53120	1219 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YHR130C	YHR130C	ADI1	Q03677	179 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YHR130C	YHR130C	TPP1	Q03796	238 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YHR130C	YHR130C	SCP160	P06105	1222 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected

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