Protein–RNA interactions for Protein: P39743

RVS167, Reduced viability upon starvation protein 167, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RVS167P39743 NSR1YGR159C 1245 nt22.88■■□□□ 1.25
RVS167P39743 YML009W-BYML009W-B 477 nt22.68■■□□□ 1.22
RVS167P39743 NOP1YDL014W 984 nt21.76■■□□□ 1.07
RVS167P39743 MDJ1YFL016C 1536 nt20.88■□□□□ 0.93
RVS167P39743 YKL036CYKL036C 393 nt19.69■□□□□ 0.74
RVS167P39743 YJL027CYJL027C 417 nt19.14■□□□□ 0.65
RVS167P39743 SRX1YKL086W 384 nt19.06■□□□□ 0.64
RVS167P39743 Q0297Q0297 156 nt18.95■□□□□ 0.62
RVS167P39743 DBP2YNL112W 1641 nt18.3■□□□□ 0.52
RVS167P39743 YCR051WYCR051W 669 nt18.06■□□□□ 0.48
RVS167P39743 YBR190WYBR190W 312 nt17.84■□□□□ 0.45
RVS167P39743 SCS3YGL126W 1143 nt17.74■□□□□ 0.43
RVS167P39743 TRN1tP(UGG)A 72 nt17.56■□□□□ 0.4
RVS167P39743 SUF9tP(UGG)F 72 nt17.56■□□□□ 0.4
RVS167P39743 SUF8tP(UGG)H 72 nt17.56■□□□□ 0.4
RVS167P39743 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt17.56■□□□□ 0.4
RVS167P39743 SUF7tP(UGG)M 72 nt17.56■□□□□ 0.4
RVS167P39743 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt17.56■□□□□ 0.4
RVS167P39743 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt17.56■□□□□ 0.4
RVS167P39743 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt17.56■□□□□ 0.4
RVS167P39743 SUF11tP(UGG)O2 72 nt17.56■□□□□ 0.4
RVS167P39743 RTC3YHR087W 336 nt17.43■□□□□ 0.38
RVS167P39743 CCC1YLR220W 969 nt17.37■□□□□ 0.37
RVS167P39743 YOL085CYOL085C 342 nt17.1■□□□□ 0.33
RVS167P39743 RPP1BYDL130W 321 nt17■□□□□ 0.31
RVS167P39743 RVS167YDR388W 1449 nt16.96■□□□□ 0.3
RVS167P39743 PKP1YIL042C 1185 nt16.95■□□□□ 0.3
RVS167P39743 SCJ1YMR214W 1134 nt16.94■□□□□ 0.3
RVS167P39743 SSA3YBL075C 1950 nt16.68■□□□□ 0.26
RVS167P39743 PUT4YOR348C 1884 nt16.63■□□□□ 0.25
RVS167P39743 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt16.44■□□□□ 0.22
RVS167P39743 PET122YER153C 765 nt16.36■□□□□ 0.21
RVS167P39743 SHR5YOL110W 714 nt16.31■□□□□ 0.2
RVS167P39743 ARE1YCR048W 1833 nt16.19■□□□□ 0.18
RVS167P39743 URN1YPR152C 1398 nt16.16■□□□□ 0.18
RVS167P39743 SAH1YER043C 1350 nt16.08■□□□□ 0.16
RVS167P39743 DEP1YAL013W 1218 nt16.06■□□□□ 0.16
RVS167P39743 POA1YBR022W 534 nt16.06■□□□□ 0.16
RVS167P39743 OPI9YLR338W 858 nt16.01■□□□□ 0.15
RVS167P39743 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.98■□□□□ 0.15
RVS167P39743 SCR1SCR1 522 nt15.94■□□□□ 0.14
RVS167P39743 YDJ1YNL064C 1230 nt15.88■□□□□ 0.13
RVS167P39743 BSC6YOL137W 1494 nt15.82■□□□□ 0.12
RVS167P39743 RRN5YLR141W 1092 nt15.81■□□□□ 0.12
RVS167P39743 RPN10YHR200W 807 nt15.73■□□□□ 0.11
RVS167P39743 ATS1YAL020C 1002 nt15.7■□□□□ 0.1
RVS167P39743 YNL208WYNL208W 600 nt15.68■□□□□ 0.1
RVS167P39743 GAR1YHR089C 618 nt15.64■□□□□ 0.09
RVS167P39743 BUD23YCR047C 828 nt15.55■□□□□ 0.08
RVS167P39743 PUN1YLR414C 792 nt15.51■□□□□ 0.07
RVS167P39743 YER088W-BYER088W-B 147 nt15.5■□□□□ 0.07
RVS167P39743 SPT5YML010W 3192 nt15.47■□□□□ 0.07
RVS167P39743 PTC2YER089C 1395 nt15.46■□□□□ 0.07
RVS167P39743 YJR018WYJR018W 363 nt15.37■□□□□ 0.05
RVS167P39743 RSB1YOR049C 1065 nt15.33■□□□□ 0.04
RVS167P39743 NAB2YGL122C 1578 nt15.28■□□□□ 0.04
RVS167P39743 YJR120WYJR120W 351 nt15.16■□□□□ 0.02
RVS167P39743 TIR1YER011W 765 nt15.12■□□□□ 0.01
RVS167P39743 FIS1YIL065C 468 nt15.12■□□□□ 0.01
RVS167P39743 SSA4YER103W 1929 nt15.11■□□□□ 0.01
RVS167P39743 SSA1YAL005C 1929 nt15.09■□□□□ 0.01
RVS167P39743 DAL1YIR027C 1383 nt15□□□□□ -0.01
RVS167P39743 FPR4YLR449W 1179 nt14.97□□□□□ -0.01
RVS167P39743 PHO4YFR034C 939 nt14.9□□□□□ -0.02
RVS167P39743 MEP2YNL142W 1500 nt14.87□□□□□ -0.03
RVS167P39743 RPP2BYDR382W 333 nt14.87□□□□□ -0.03
RVS167P39743 SRB2YHR041C 633 nt14.85□□□□□ -0.03
RVS167P39743 INM2YDR287W 879 nt14.83□□□□□ -0.04
RVS167P39743 YPS1YLR120C 1710 nt14.77□□□□□ -0.05
RVS167P39743 DCW1YKL046C 1350 nt14.7□□□□□ -0.06
RVS167P39743 YBL100CYBL100C 315 nt14.68□□□□□ -0.06
RVS167P39743 PST2YDR032C 597 nt14.63□□□□□ -0.07
RVS167P39743 YDR095CYDR095C 411 nt14.61□□□□□ -0.07
RVS167P39743 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt14.61□□□□□ -0.07
RVS167P39743 BDF1YLR399C 2061 nt14.58□□□□□ -0.08
RVS167P39743 BDH2YAL061W 1254 nt14.55□□□□□ -0.08
RVS167P39743 FUN26YAL022C 1554 nt14.49□□□□□ -0.09
RVS167P39743 EMI2YDR516C 1503 nt14.44□□□□□ -0.1
RVS167P39743 WWM1YFL010C 636 nt14.42□□□□□ -0.1
RVS167P39743 TAT1YBR069C 1860 nt14.38□□□□□ -0.11
RVS167P39743 PTP1YDL230W 1008 nt14.37□□□□□ -0.11
RVS167P39743 CAC2YML102W 1407 nt14.35□□□□□ -0.11
RVS167P39743 YBR220CYBR220C 1683 nt14.34□□□□□ -0.11
RVS167P39743 ALF1YNL148C 765 nt14.33□□□□□ -0.12
RVS167P39743 TRM9YML014W 840 nt14.32□□□□□ -0.12
RVS167P39743 YDL221WYDL221W 552 nt14.3□□□□□ -0.12
RVS167P39743 RPP2AYOL039W 321 nt14.3□□□□□ -0.12
RVS167P39743 YMR090WYMR090W 684 nt14.26□□□□□ -0.13
RVS167P39743 CCT6YDR188W 1641 nt14.24□□□□□ -0.13
RVS167P39743 LSM3YLR438C-A 270 nt14.24□□□□□ -0.13
RVS167P39743 SDH1YKL148C 1923 nt14.21□□□□□ -0.14
RVS167P39743 SHU1YHL006C 453 nt14.18□□□□□ -0.14
RVS167P39743 SIS1YNL007C 1059 nt14.17□□□□□ -0.14
RVS167P39743 Q0182Q0182 405 nt14.15□□□□□ -0.14
RVS167P39743 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.13□□□□□ -0.15
RVS167P39743 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt14.13□□□□□ -0.15
RVS167P39743 IRC15YPL017C 1500 nt14.13□□□□□ -0.15
RVS167P39743 YGR021WYGR021W 873 nt14.1□□□□□ -0.15
RVS167P39743 HOM6YJR139C 1080 nt14.1□□□□□ -0.15
RVS167P39743 SUF2tP(AGG)C 72 nt14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 50.6 ms