Protein–RNA interactions for Protein: Q12324

YVC1, Calcium channel YVC1, yeastyeast

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YVC1Q12324 NSR1YGR159C 1245 nt19.59■□□□□ 0.73
YVC1Q12324 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.41■□□□□ 0.7
YVC1Q12324 NOP1YDL014W 984 nt18.67■□□□□ 0.58
YVC1Q12324 MDJ1YFL016C 1536 nt17.76■□□□□ 0.43
YVC1Q12324 YKL036CYKL036C 393 nt17.1■□□□□ 0.33
YVC1Q12324 SRX1YKL086W 384 nt16.41■□□□□ 0.22
YVC1Q12324 Q0297Q0297 156 nt16.35■□□□□ 0.21
YVC1Q12324 YJL027CYJL027C 417 nt16.26■□□□□ 0.19
YVC1Q12324 SSA3YBL075C 1950 nt16.17■□□□□ 0.18
YVC1Q12324 DBP2YNL112W 1641 nt15.68■□□□□ 0.1
YVC1Q12324 YCR051WYCR051W 669 nt15.48■□□□□ 0.07
YVC1Q12324 SCS3YGL126W 1143 nt15.43■□□□□ 0.06
YVC1Q12324 YBR190WYBR190W 312 nt15.17■□□□□ 0.02
YVC1Q12324 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.06■□□□□ 0
YVC1Q12324 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.06■□□□□ 0
YVC1Q12324 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.06■□□□□ 0
YVC1Q12324 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.06■□□□□ 0
YVC1Q12324 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.06■□□□□ 0
YVC1Q12324 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.06■□□□□ 0
YVC1Q12324 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.06■□□□□ 0
YVC1Q12324 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.06■□□□□ 0
YVC1Q12324 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.06■□□□□ 0
YVC1Q12324 CCC1YLR220W 969 nt14.84□□□□□ -0.03
YVC1Q12324 YOL085CYOL085C 342 nt14.8□□□□□ -0.04
YVC1Q12324 RTC3YHR087W 336 nt14.74□□□□□ -0.05
YVC1Q12324 RPP1BYDL130W 321 nt14.65□□□□□ -0.06
YVC1Q12324 PKP1YIL042C 1185 nt14.6□□□□□ -0.07
YVC1Q12324 SCJ1YMR214W 1134 nt14.5□□□□□ -0.09
YVC1Q12324 RVS167YDR388W 1449 nt14.42□□□□□ -0.1
YVC1Q12324 PUT4YOR348C 1884 nt14.14□□□□□ -0.15
YVC1Q12324 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.13□□□□□ -0.15
YVC1Q12324 PET122YER153C 765 nt14.08□□□□□ -0.16
YVC1Q12324 SHR5YOL110W 714 nt13.94□□□□□ -0.18
YVC1Q12324 SCR1SCR1 522 nt13.87□□□□□ -0.19
YVC1Q12324 ATS1YAL020C 1002 nt13.81□□□□□ -0.2
YVC1Q12324 ARE1YCR048W 1833 nt13.78□□□□□ -0.2
YVC1Q12324 PAC11YDR488C 1602 nt13.78□□□□□ -0.2
YVC1Q12324 URN1YPR152C 1398 nt13.76□□□□□ -0.21
YVC1Q12324 SSA4YER103W 1929 nt13.69□□□□□ -0.22
YVC1Q12324 DEP1YAL013W 1218 nt13.68□□□□□ -0.22
YVC1Q12324 SAH1YER043C 1350 nt13.66□□□□□ -0.22
YVC1Q12324 YDJ1YNL064C 1230 nt13.65□□□□□ -0.22
YVC1Q12324 OPI9YLR338W 858 nt13.64□□□□□ -0.23
YVC1Q12324 RRN5YLR141W 1092 nt13.62□□□□□ -0.23
YVC1Q12324 POA1YBR022W 534 nt13.59□□□□□ -0.23
YVC1Q12324 NVJ2YPR091C 2313 nt13.59□□□□□ -0.23
YVC1Q12324 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.52□□□□□ -0.25
YVC1Q12324 GAR1YHR089C 618 nt13.39□□□□□ -0.27
YVC1Q12324 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.38□□□□□ -0.27
YVC1Q12324 YNL208WYNL208W 600 nt13.38□□□□□ -0.27
YVC1Q12324 SPT5YML010W 3192 nt13.38□□□□□ -0.27
YVC1Q12324 BSC6YOL137W 1494 nt13.37□□□□□ -0.27
YVC1Q12324 RPN10YHR200W 807 nt13.35□□□□□ -0.27
YVC1Q12324 BDF1YLR399C 2061 nt13.3□□□□□ -0.28
YVC1Q12324 FPS1YLL043W 2010 nt13.3□□□□□ -0.28
YVC1Q12324 RSB1YOR049C 1065 nt13.26□□□□□ -0.29
YVC1Q12324 PUN1YLR414C 792 nt13.17□□□□□ -0.3
YVC1Q12324 PTC2YER089C 1395 nt13.12□□□□□ -0.31
YVC1Q12324 BUD23YCR047C 828 nt13.12□□□□□ -0.31
YVC1Q12324 TAT1YBR069C 1860 nt13.1□□□□□ -0.31
YVC1Q12324 YJR018WYJR018W 363 nt13.08□□□□□ -0.32
YVC1Q12324 YJR120WYJR120W 351 nt13□□□□□ -0.33
YVC1Q12324 TIR1YER011W 765 nt12.97□□□□□ -0.33
YVC1Q12324 NAB2YGL122C 1578 nt12.97□□□□□ -0.33
YVC1Q12324 SSA1YAL005C 1929 nt12.96□□□□□ -0.34
YVC1Q12324 FIS1YIL065C 468 nt12.86□□□□□ -0.35
YVC1Q12324 SRB2YHR041C 633 nt12.8□□□□□ -0.36
YVC1Q12324 PST2YDR032C 597 nt12.75□□□□□ -0.37
YVC1Q12324 DAL1YIR027C 1383 nt12.75□□□□□ -0.37
YVC1Q12324 PHO4YFR034C 939 nt12.65□□□□□ -0.38
YVC1Q12324 FPR4YLR449W 1179 nt12.65□□□□□ -0.38
YVC1Q12324 RPP2BYDR382W 333 nt12.63□□□□□ -0.39
YVC1Q12324 INM2YDR287W 879 nt12.61□□□□□ -0.39
YVC1Q12324 MEP2YNL142W 1500 nt12.6□□□□□ -0.39
YVC1Q12324 YPS1YLR120C 1710 nt12.55□□□□□ -0.4
YVC1Q12324 UME6YDR207C 2511 nt12.5□□□□□ -0.41
YVC1Q12324 YBL100CYBL100C 315 nt12.48□□□□□ -0.41
YVC1Q12324 DCW1YKL046C 1350 nt12.44□□□□□ -0.42
YVC1Q12324 BDH2YAL061W 1254 nt12.43□□□□□ -0.42
YVC1Q12324 YDR095CYDR095C 411 nt12.42□□□□□ -0.42
YVC1Q12324 Q0182Q0182 405 nt12.39□□□□□ -0.43
YVC1Q12324 WWM1YFL010C 636 nt12.38□□□□□ -0.43
YVC1Q12324 FUN26YAL022C 1554 nt12.35□□□□□ -0.43
YVC1Q12324 YKL097CYKL097C 411 nt12.34□□□□□ -0.43
YVC1Q12324 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.33□□□□□ -0.44
YVC1Q12324 SHU1YHL006C 453 nt12.3□□□□□ -0.44
YVC1Q12324 PTP1YDL230W 1008 nt12.26□□□□□ -0.45
YVC1Q12324 MOT3YMR070W 1473 nt12.24□□□□□ -0.45
YVC1Q12324 EMI2YDR516C 1503 nt12.21□□□□□ -0.45
YVC1Q12324 CAC2YML102W 1407 nt12.21□□□□□ -0.45
YVC1Q12324 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.21□□□□□ -0.45
YVC1Q12324 TRM9YML014W 840 nt12.2□□□□□ -0.46
YVC1Q12324 LSM3YLR438C-A 270 nt12.19□□□□□ -0.46
YVC1Q12324 CCT6YDR188W 1641 nt12.18□□□□□ -0.46
YVC1Q12324 HOM6YJR139C 1080 nt12.16□□□□□ -0.46
YVC1Q12324 YBR220CYBR220C 1683 nt12.15□□□□□ -0.46
YVC1Q12324 RPP2AYOL039W 321 nt12.14□□□□□ -0.47
YVC1Q12324 PCH2YBR186W 1695 nt12.13□□□□□ -0.47
YVC1Q12324 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.12□□□□□ -0.47
YVC1Q12324 YGR021WYGR021W 873 nt12.12□□□□□ -0.47
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