Protein–RNA interactions for Protein: Q12015

YOR223W, Transmembrane protein YOR223W, yeastyeast

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YOR223WQ12015 NSR1YGR159C 1245 nt20.68■□□□□ 0.9
YOR223WQ12015 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.32■□□□□ 0.84
YOR223WQ12015 NOP1YDL014W 984 nt19.41■□□□□ 0.7
YOR223WQ12015 MDJ1YFL016C 1536 nt19.05■□□□□ 0.64
YOR223WQ12015 YJL027CYJL027C 417 nt17.43■□□□□ 0.38
YOR223WQ12015 YKL036CYKL036C 393 nt17.38■□□□□ 0.37
YOR223WQ12015 SRX1YKL086W 384 nt17.01■□□□□ 0.31
YOR223WQ12015 Q0297Q0297 156 nt16.85■□□□□ 0.29
YOR223WQ12015 DBP2YNL112W 1641 nt16.64■□□□□ 0.25
YOR223WQ12015 YBR190WYBR190W 312 nt16.32■□□□□ 0.2
YOR223WQ12015 YCR051WYCR051W 669 nt16.1■□□□□ 0.17
YOR223WQ12015 RTC3YHR087W 336 nt15.93■□□□□ 0.14
YOR223WQ12015 SSA3YBL075C 1950 nt15.91■□□□□ 0.14
YOR223WQ12015 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.78■□□□□ 0.12
YOR223WQ12015 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.78■□□□□ 0.12
YOR223WQ12015 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.78■□□□□ 0.12
YOR223WQ12015 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.78■□□□□ 0.12
YOR223WQ12015 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.78■□□□□ 0.12
YOR223WQ12015 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.78■□□□□ 0.12
YOR223WQ12015 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.78■□□□□ 0.12
YOR223WQ12015 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.78■□□□□ 0.12
YOR223WQ12015 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.78■□□□□ 0.12
YOR223WQ12015 SCS3YGL126W 1143 nt15.73■□□□□ 0.11
YOR223WQ12015 CCC1YLR220W 969 nt15.64■□□□□ 0.09
YOR223WQ12015 PUT4YOR348C 1884 nt15.38■□□□□ 0.05
YOR223WQ12015 RVS167YDR388W 1449 nt15.34■□□□□ 0.05
YOR223WQ12015 SCJ1YMR214W 1134 nt15.3■□□□□ 0.04
YOR223WQ12015 YOL085CYOL085C 342 nt15.13■□□□□ 0.01
YOR223WQ12015 RPP1BYDL130W 321 nt15.12■□□□□ 0.01
YOR223WQ12015 PKP1YIL042C 1185 nt15.02■□□□□ -0
YOR223WQ12015 ARE1YCR048W 1833 nt14.92□□□□□ -0.02
YOR223WQ12015 POA1YBR022W 534 nt14.84□□□□□ -0.03
YOR223WQ12015 SAH1YER043C 1350 nt14.73□□□□□ -0.05
YOR223WQ12015 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.72□□□□□ -0.05
YOR223WQ12015 URN1YPR152C 1398 nt14.72□□□□□ -0.05
YOR223WQ12015 SHR5YOL110W 714 nt14.71□□□□□ -0.05
YOR223WQ12015 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.7□□□□□ -0.06
YOR223WQ12015 BSC6YOL137W 1494 nt14.63□□□□□ -0.07
YOR223WQ12015 OPI9YLR338W 858 nt14.61□□□□□ -0.07
YOR223WQ12015 PET122YER153C 765 nt14.58□□□□□ -0.08
YOR223WQ12015 DEP1YAL013W 1218 nt14.58□□□□□ -0.08
YOR223WQ12015 SPT5YML010W 3192 nt14.51□□□□□ -0.09
YOR223WQ12015 BUD23YCR047C 828 nt14.29□□□□□ -0.12
YOR223WQ12015 RPN10YHR200W 807 nt14.24□□□□□ -0.13
YOR223WQ12015 SSA4YER103W 1929 nt14.23□□□□□ -0.13
YOR223WQ12015 YDJ1YNL064C 1230 nt14.21□□□□□ -0.13
YOR223WQ12015 YNL208WYNL208W 600 nt14.19□□□□□ -0.14
YOR223WQ12015 PTC2YER089C 1395 nt14.14□□□□□ -0.15
YOR223WQ12015 PUN1YLR414C 792 nt14.13□□□□□ -0.15
YOR223WQ12015 SCR1SCR1 522 nt14.13□□□□□ -0.15
YOR223WQ12015 RRN5YLR141W 1092 nt14.08□□□□□ -0.16
YOR223WQ12015 GAR1YHR089C 618 nt14.04□□□□□ -0.16
YOR223WQ12015 ATS1YAL020C 1002 nt14.04□□□□□ -0.16
YOR223WQ12015 NAB2YGL122C 1578 nt14□□□□□ -0.17
YOR223WQ12015 YJR018WYJR018W 363 nt13.98□□□□□ -0.17
YOR223WQ12015 FIS1YIL065C 468 nt13.81□□□□□ -0.2
YOR223WQ12015 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.8□□□□□ -0.2
YOR223WQ12015 MEP2YNL142W 1500 nt13.79□□□□□ -0.2
YOR223WQ12015 BDF1YLR399C 2061 nt13.78□□□□□ -0.2
YOR223WQ12015 YJR120WYJR120W 351 nt13.76□□□□□ -0.21
YOR223WQ12015 DAL1YIR027C 1383 nt13.71□□□□□ -0.22
YOR223WQ12015 FPR4YLR449W 1179 nt13.68□□□□□ -0.22
YOR223WQ12015 DCW1YKL046C 1350 nt13.62□□□□□ -0.23
YOR223WQ12015 SSA1YAL005C 1929 nt13.61□□□□□ -0.23
YOR223WQ12015 PHO4YFR034C 939 nt13.61□□□□□ -0.23
YOR223WQ12015 TIR1YER011W 765 nt13.58□□□□□ -0.24
YOR223WQ12015 YPS1YLR120C 1710 nt13.57□□□□□ -0.24
YOR223WQ12015 RSB1YOR049C 1065 nt13.57□□□□□ -0.24
YOR223WQ12015 TAT1YBR069C 1860 nt13.56□□□□□ -0.24
YOR223WQ12015 INM2YDR287W 879 nt13.51□□□□□ -0.25
YOR223WQ12015 RPP2BYDR382W 333 nt13.46□□□□□ -0.25
YOR223WQ12015 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.43□□□□□ -0.26
YOR223WQ12015 YDR095CYDR095C 411 nt13.37□□□□□ -0.27
YOR223WQ12015 SRB2YHR041C 633 nt13.37□□□□□ -0.27
YOR223WQ12015 EMI2YDR516C 1503 nt13.36□□□□□ -0.27
YOR223WQ12015 YBR220CYBR220C 1683 nt13.36□□□□□ -0.27
YOR223WQ12015 YBL100CYBL100C 315 nt13.33□□□□□ -0.28
YOR223WQ12015 CAC2YML102W 1407 nt13.22□□□□□ -0.29
YOR223WQ12015 YDL221WYDL221W 552 nt13.21□□□□□ -0.29
YOR223WQ12015 PTP1YDL230W 1008 nt13.21□□□□□ -0.29
YOR223WQ12015 YMR090WYMR090W 684 nt13.2□□□□□ -0.3
YOR223WQ12015 SDH1YKL148C 1923 nt13.17□□□□□ -0.3
YOR223WQ12015 FUN26YAL022C 1554 nt13.17□□□□□ -0.3
YOR223WQ12015 BDH2YAL061W 1254 nt13.14□□□□□ -0.31
YOR223WQ12015 RPP2AYOL039W 321 nt13.1□□□□□ -0.31
YOR223WQ12015 ALF1YNL148C 765 nt13.05□□□□□ -0.32
YOR223WQ12015 PAC11YDR488C 1602 nt13.05□□□□□ -0.32
YOR223WQ12015 PST2YDR032C 597 nt13.04□□□□□ -0.32
YOR223WQ12015 IRC15YPL017C 1500 nt13.02□□□□□ -0.33
YOR223WQ12015 SCC4YER147C 1875 nt12.99□□□□□ -0.33
YOR223WQ12015 TRM9YML014W 840 nt12.98□□□□□ -0.33
YOR223WQ12015 PCH2YBR186W 1695 nt12.96□□□□□ -0.33
YOR223WQ12015 GIS3YLR094C 1509 nt12.94□□□□□ -0.34
YOR223WQ12015 GUT2YIL155C 1950 nt12.94□□□□□ -0.34
YOR223WQ12015 WWM1YFL010C 636 nt12.93□□□□□ -0.34
YOR223WQ12015 SIS1YNL007C 1059 nt12.93□□□□□ -0.34
YOR223WQ12015 CCT6YDR188W 1641 nt12.91□□□□□ -0.34
YOR223WQ12015 SEC11YIR022W 504 nt12.85□□□□□ -0.35
YOR223WQ12015 GFD2YCL036W 1701 nt12.84□□□□□ -0.35
YOR223WQ12015 Q0182Q0182 405 nt12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.6 ms