Protein–RNA interactions for Protein: Q07660

BRE4, Protein BRE4, yeastyeast

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Length 1,125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BRE4Q07660 NSR1YGR159C 1245 nt18.02■□□□□ 0.48
BRE4Q07660 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.76■□□□□ 0.43
BRE4Q07660 NOP1YDL014W 984 nt17.23■□□□□ 0.35
BRE4Q07660 MDJ1YFL016C 1536 nt16.59■□□□□ 0.25
BRE4Q07660 YKL036CYKL036C 393 nt15.76■□□□□ 0.11
BRE4Q07660 YJL027CYJL027C 417 nt15.18■□□□□ 0.02
BRE4Q07660 SRX1YKL086W 384 nt15.05■□□□□ -0
BRE4Q07660 Q0297Q0297 156 nt15.04■□□□□ -0
BRE4Q07660 SSA3YBL075C 1950 nt14.6□□□□□ -0.07
BRE4Q07660 DBP2YNL112W 1641 nt14.49□□□□□ -0.09
BRE4Q07660 YBR190WYBR190W 312 nt14.28□□□□□ -0.12
BRE4Q07660 YCR051WYCR051W 669 nt14.26□□□□□ -0.13
BRE4Q07660 SCS3YGL126W 1143 nt14.26□□□□□ -0.13
BRE4Q07660 RTC3YHR087W 336 nt13.96□□□□□ -0.17
BRE4Q07660 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.76□□□□□ -0.21
BRE4Q07660 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.76□□□□□ -0.21
BRE4Q07660 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.76□□□□□ -0.21
BRE4Q07660 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.76□□□□□ -0.21
BRE4Q07660 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.76□□□□□ -0.21
BRE4Q07660 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.76□□□□□ -0.21
BRE4Q07660 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.76□□□□□ -0.21
BRE4Q07660 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.76□□□□□ -0.21
BRE4Q07660 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.76□□□□□ -0.21
BRE4Q07660 YOL085CYOL085C 342 nt13.66□□□□□ -0.22
BRE4Q07660 PUT4YOR348C 1884 nt13.59□□□□□ -0.23
BRE4Q07660 CCC1YLR220W 969 nt13.54□□□□□ -0.24
BRE4Q07660 RPP1BYDL130W 321 nt13.49□□□□□ -0.25
BRE4Q07660 PKP1YIL042C 1185 nt13.45□□□□□ -0.26
BRE4Q07660 Q0182Q0182 405 nt13.35□□□□□ -0.27
BRE4Q07660 SCJ1YMR214W 1134 nt13.31□□□□□ -0.28
BRE4Q07660 RVS167YDR388W 1449 nt13.3□□□□□ -0.28
BRE4Q07660 POA1YBR022W 534 nt13.12□□□□□ -0.31
BRE4Q07660 ARE1YCR048W 1833 nt13.11□□□□□ -0.31
BRE4Q07660 BSC6YOL137W 1494 nt12.98□□□□□ -0.33
BRE4Q07660 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.96□□□□□ -0.33
BRE4Q07660 SPT5YML010W 3192 nt12.94□□□□□ -0.34
BRE4Q07660 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.91□□□□□ -0.34
BRE4Q07660 PET122YER153C 765 nt12.9□□□□□ -0.34
BRE4Q07660 SAH1YER043C 1350 nt12.89□□□□□ -0.35
BRE4Q07660 SSA4YER103W 1929 nt12.88□□□□□ -0.35
BRE4Q07660 SHR5YOL110W 714 nt12.81□□□□□ -0.36
BRE4Q07660 URN1YPR152C 1398 nt12.79□□□□□ -0.36
BRE4Q07660 MOT3YMR070W 1473 nt12.73□□□□□ -0.37
BRE4Q07660 OPI9YLR338W 858 nt12.73□□□□□ -0.37
BRE4Q07660 ATS1YAL020C 1002 nt12.72□□□□□ -0.37
BRE4Q07660 SCR1SCR1 522 nt12.72□□□□□ -0.37
BRE4Q07660 BUD23YCR047C 828 nt12.6□□□□□ -0.39
BRE4Q07660 DEP1YAL013W 1218 nt12.59□□□□□ -0.39
BRE4Q07660 RRN5YLR141W 1092 nt12.52□□□□□ -0.41
BRE4Q07660 YDJ1YNL064C 1230 nt12.5□□□□□ -0.41
BRE4Q07660 BDF1YLR399C 2061 nt12.46□□□□□ -0.42
BRE4Q07660 RPN10YHR200W 807 nt12.37□□□□□ -0.43
BRE4Q07660 PTC2YER089C 1395 nt12.36□□□□□ -0.43
BRE4Q07660 PUN1YLR414C 792 nt12.34□□□□□ -0.43
BRE4Q07660 YNL208WYNL208W 600 nt12.33□□□□□ -0.44
BRE4Q07660 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.28□□□□□ -0.44
BRE4Q07660 NAB2YGL122C 1578 nt12.27□□□□□ -0.44
BRE4Q07660 TAT1YBR069C 1860 nt12.26□□□□□ -0.45
BRE4Q07660 MEP2YNL142W 1500 nt12.25□□□□□ -0.45
BRE4Q07660 GAR1YHR089C 618 nt12.22□□□□□ -0.45
BRE4Q07660 RSB1YOR049C 1065 nt12.2□□□□□ -0.46
BRE4Q07660 PAC11YDR488C 1602 nt12.13□□□□□ -0.47
BRE4Q07660 YJR018WYJR018W 363 nt12.13□□□□□ -0.47
BRE4Q07660 DCW1YKL046C 1350 nt12.07□□□□□ -0.48
BRE4Q07660 FIS1YIL065C 468 nt12.07□□□□□ -0.48
BRE4Q07660 YJR120WYJR120W 351 nt12□□□□□ -0.49
BRE4Q07660 DAL1YIR027C 1383 nt11.97□□□□□ -0.49
BRE4Q07660 FPR4YLR449W 1179 nt11.97□□□□□ -0.49
BRE4Q07660 YPS1YLR120C 1710 nt11.91□□□□□ -0.5
BRE4Q07660 YBR220CYBR220C 1683 nt11.91□□□□□ -0.5
BRE4Q07660 PHO4YFR034C 939 nt11.89□□□□□ -0.51
BRE4Q07660 EMI2YDR516C 1503 nt11.86□□□□□ -0.51
BRE4Q07660 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.85□□□□□ -0.51
BRE4Q07660 SSA1YAL005C 1929 nt11.84□□□□□ -0.51
BRE4Q07660 TIR1YER011W 765 nt11.83□□□□□ -0.52
BRE4Q07660 PST2YDR032C 597 nt11.82□□□□□ -0.52
BRE4Q07660 YMR090WYMR090W 684 nt11.79□□□□□ -0.52
BRE4Q07660 INM2YDR287W 879 nt11.77□□□□□ -0.53
BRE4Q07660 NVJ2YPR091C 2313 nt11.75□□□□□ -0.53
BRE4Q07660 YDR095CYDR095C 411 nt11.72□□□□□ -0.53
BRE4Q07660 YDL221WYDL221W 552 nt11.71□□□□□ -0.53
BRE4Q07660 SDH1YKL148C 1923 nt11.7□□□□□ -0.54
BRE4Q07660 RPP2BYDR382W 333 nt11.67□□□□□ -0.54
BRE4Q07660 PCH2YBR186W 1695 nt11.65□□□□□ -0.55
BRE4Q07660 SRB2YHR041C 633 nt11.63□□□□□ -0.55
BRE4Q07660 CAC2YML102W 1407 nt11.62□□□□□ -0.55
BRE4Q07660 GUT2YIL155C 1950 nt11.62□□□□□ -0.55
BRE4Q07660 YBL100CYBL100C 315 nt11.57□□□□□ -0.56
BRE4Q07660 PTP1YDL230W 1008 nt11.56□□□□□ -0.56
BRE4Q07660 SEC11YIR022W 504 nt11.54□□□□□ -0.56
BRE4Q07660 SCC4YER147C 1875 nt11.52□□□□□ -0.57
BRE4Q07660 RPP2AYOL039W 321 nt11.48□□□□□ -0.57
BRE4Q07660 IRC15YPL017C 1500 nt11.45□□□□□ -0.58
BRE4Q07660 BDH2YAL061W 1254 nt11.44□□□□□ -0.58
BRE4Q07660 PIB2YGL023C 1908 nt11.43□□□□□ -0.58
BRE4Q07660 FUN26YAL022C 1554 nt11.43□□□□□ -0.58
BRE4Q07660 GIS3YLR094C 1509 nt11.4□□□□□ -0.59
BRE4Q07660 ALF1YNL148C 765 nt11.39□□□□□ -0.59
BRE4Q07660 YSC84YHR016C 1407 nt11.37□□□□□ -0.59
BRE4Q07660 SHU1YHL006C 453 nt11.36□□□□□ -0.59
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