Protein–RNA interactions for Protein: P38289

EXO5, Exonuclease V, mitochondrial, yeastyeast

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Length 585 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
EXO5P38289 YML009W-BYML009W-B 477 nt21.71■■□□□ 1.07
EXO5P38289 NSR1YGR159C 1245 nt21.69■■□□□ 1.06
EXO5P38289 NOP1YDL014W 984 nt21.01■□□□□ 0.95
EXO5P38289 MDJ1YFL016C 1536 nt19.41■□□□□ 0.7
EXO5P38289 YKL036CYKL036C 393 nt19.3■□□□□ 0.68
EXO5P38289 Q0297Q0297 156 nt18.4■□□□□ 0.54
EXO5P38289 SRX1YKL086W 384 nt18.4■□□□□ 0.54
EXO5P38289 YJL027CYJL027C 417 nt17.98■□□□□ 0.47
EXO5P38289 SCS3YGL126W 1143 nt17.52■□□□□ 0.4
EXO5P38289 YCR051WYCR051W 669 nt17.44■□□□□ 0.38
EXO5P38289 DBP2YNL112W 1641 nt17.15■□□□□ 0.34
EXO5P38289 YOL085CYOL085C 342 nt16.75■□□□□ 0.27
EXO5P38289 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.73■□□□□ 0.27
EXO5P38289 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.73■□□□□ 0.27
EXO5P38289 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.73■□□□□ 0.27
EXO5P38289 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.73■□□□□ 0.27
EXO5P38289 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.73■□□□□ 0.27
EXO5P38289 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.73■□□□□ 0.27
EXO5P38289 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.73■□□□□ 0.27
EXO5P38289 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.73■□□□□ 0.27
EXO5P38289 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.73■□□□□ 0.27
EXO5P38289 YBR190WYBR190W 312 nt16.56■□□□□ 0.24
EXO5P38289 CCC1YLR220W 969 nt16.55■□□□□ 0.24
EXO5P38289 PKP1YIL042C 1185 nt16.53■□□□□ 0.24
EXO5P38289 RPP1BYDL130W 321 nt16.5■□□□□ 0.23
EXO5P38289 RTC3YHR087W 336 nt16.17■□□□□ 0.18
EXO5P38289 RVS167YDR388W 1449 nt16■□□□□ 0.15
EXO5P38289 SCJ1YMR214W 1134 nt15.98■□□□□ 0.15
EXO5P38289 PET122YER153C 765 nt15.8■□□□□ 0.12
EXO5P38289 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.78■□□□□ 0.12
EXO5P38289 ATS1YAL020C 1002 nt15.63■□□□□ 0.09
EXO5P38289 SCR1SCR1 522 nt15.54■□□□□ 0.08
EXO5P38289 SHR5YOL110W 714 nt15.45■□□□□ 0.06
EXO5P38289 RRN5YLR141W 1092 nt15.34■□□□□ 0.05
EXO5P38289 YDJ1YNL064C 1230 nt15.26■□□□□ 0.03
EXO5P38289 PUT4YOR348C 1884 nt15.16■□□□□ 0.02
EXO5P38289 URN1YPR152C 1398 nt15.11■□□□□ 0.01
EXO5P38289 DEP1YAL013W 1218 nt15.09■□□□□ 0.01
EXO5P38289 YER088W-BYER088W-B 147 nt15.04■□□□□ -0
EXO5P38289 GAR1YHR089C 618 nt14.95□□□□□ -0.02
EXO5P38289 RSB1YOR049C 1065 nt14.95□□□□□ -0.02
EXO5P38289 OPI9YLR338W 858 nt14.92□□□□□ -0.02
EXO5P38289 SAH1YER043C 1350 nt14.87□□□□□ -0.03
EXO5P38289 ARE1YCR048W 1833 nt14.86□□□□□ -0.03
EXO5P38289 RPN10YHR200W 807 nt14.79□□□□□ -0.04
EXO5P38289 YNL208WYNL208W 600 nt14.79□□□□□ -0.04
EXO5P38289 POA1YBR022W 534 nt14.68□□□□□ -0.06
EXO5P38289 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.64□□□□□ -0.07
EXO5P38289 PST2YDR032C 597 nt14.52□□□□□ -0.09
EXO5P38289 PUN1YLR414C 792 nt14.46□□□□□ -0.09
EXO5P38289 TIR1YER011W 765 nt14.45□□□□□ -0.1
EXO5P38289 SSA3YBL075C 1950 nt14.43□□□□□ -0.1
EXO5P38289 YJR018WYJR018W 363 nt14.4□□□□□ -0.1
EXO5P38289 BSC6YOL137W 1494 nt14.38□□□□□ -0.11
EXO5P38289 SSA1YAL005C 1929 nt14.33□□□□□ -0.11
EXO5P38289 PTC2YER089C 1395 nt14.33□□□□□ -0.12
EXO5P38289 BUD23YCR047C 828 nt14.28□□□□□ -0.12
EXO5P38289 YJR120WYJR120W 351 nt14.23□□□□□ -0.13
EXO5P38289 NAB2YGL122C 1578 nt14.14□□□□□ -0.15
EXO5P38289 SRB2YHR041C 633 nt14.13□□□□□ -0.15
EXO5P38289 RPP2BYDR382W 333 nt14.03□□□□□ -0.16
EXO5P38289 SHU1YHL006C 453 nt13.97□□□□□ -0.17
EXO5P38289 FIS1YIL065C 468 nt13.97□□□□□ -0.17
EXO5P38289 DAL1YIR027C 1383 nt13.94□□□□□ -0.18
EXO5P38289 INM2YDR287W 879 nt13.89□□□□□ -0.19
EXO5P38289 FPR4YLR449W 1179 nt13.89□□□□□ -0.19
EXO5P38289 SPT5YML010W 3192 nt13.85□□□□□ -0.19
EXO5P38289 YKL097CYKL097C 411 nt13.83□□□□□ -0.2
EXO5P38289 PHO4YFR034C 939 nt13.82□□□□□ -0.2
EXO5P38289 WWM1YFL010C 636 nt13.81□□□□□ -0.2
EXO5P38289 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.81□□□□□ -0.2
EXO5P38289 BDH2YAL061W 1254 nt13.77□□□□□ -0.21
EXO5P38289 YBL100CYBL100C 315 nt13.74□□□□□ -0.21
EXO5P38289 Q0182Q0182 405 nt13.68□□□□□ -0.22
EXO5P38289 YGR021WYGR021W 873 nt13.63□□□□□ -0.23
EXO5P38289 HOM6YJR139C 1080 nt13.63□□□□□ -0.23
EXO5P38289 YPS1YLR120C 1710 nt13.6□□□□□ -0.23
EXO5P38289 FUN26YAL022C 1554 nt13.59□□□□□ -0.23
EXO5P38289 LSM3YLR438C-A 270 nt13.56□□□□□ -0.24
EXO5P38289 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.55□□□□□ -0.24
EXO5P38289 MNP1YGL068W 585 nt13.55□□□□□ -0.24
EXO5P38289 TRM9YML014W 840 nt13.52□□□□□ -0.25
EXO5P38289 MEP2YNL142W 1500 nt13.51□□□□□ -0.25
EXO5P38289 YDR095CYDR095C 411 nt13.5□□□□□ -0.25
EXO5P38289 MOT3YMR070W 1473 nt13.48□□□□□ -0.25
EXO5P38289 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.43□□□□□ -0.26
EXO5P38289 RKM5YLR137W 1104 nt13.42□□□□□ -0.26
EXO5P38289 CCT6YDR188W 1641 nt13.4□□□□□ -0.26
EXO5P38289 ALF1YNL148C 765 nt13.38□□□□□ -0.27
EXO5P38289 YOR139CYOR139C 393 nt13.36□□□□□ -0.27
EXO5P38289 SSA4YER103W 1929 nt13.35□□□□□ -0.27
EXO5P38289 DCW1YKL046C 1350 nt13.32□□□□□ -0.28
EXO5P38289 PTP1YDL230W 1008 nt13.25□□□□□ -0.29
EXO5P38289 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.25□□□□□ -0.29
EXO5P38289 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.25□□□□□ -0.29
EXO5P38289 SIS1YNL007C 1059 nt13.24□□□□□ -0.29
EXO5P38289 RPP2AYOL039W 321 nt13.23□□□□□ -0.29
EXO5P38289 YOL037CYOL037C 354 nt13.22□□□□□ -0.29
EXO5P38289 NPL3YDR432W 1245 nt13.2□□□□□ -0.3
EXO5P38289 CAC2YML102W 1407 nt13.16□□□□□ -0.3
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