Protein–RNA interactions for Protein: P39548

YAR028W, DUP240 protein YAR028W, yeastyeast

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YAR028WP39548 NSR1YGR159C 1245 nt18.93■□□□□ 0.62
YAR028WP39548 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.64■□□□□ 0.57
YAR028WP39548 NOP1YDL014W 984 nt17.96■□□□□ 0.47
YAR028WP39548 MDJ1YFL016C 1536 nt17.19■□□□□ 0.34
YAR028WP39548 YKL036CYKL036C 393 nt16.17■□□□□ 0.18
YAR028WP39548 YJL027CYJL027C 417 nt15.84■□□□□ 0.13
YAR028WP39548 SRX1YKL086W 384 nt15.7■□□□□ 0.1
YAR028WP39548 Q0297Q0297 156 nt15.59■□□□□ 0.09
YAR028WP39548 DBP2YNL112W 1641 nt15.05■□□□□ -0
YAR028WP39548 YCR051WYCR051W 669 nt14.83□□□□□ -0.04
YAR028WP39548 YBR190WYBR190W 312 nt14.8□□□□□ -0.04
YAR028WP39548 SCS3YGL126W 1143 nt14.48□□□□□ -0.09
YAR028WP39548 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.45□□□□□ -0.1
YAR028WP39548 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.45□□□□□ -0.1
YAR028WP39548 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.45□□□□□ -0.1
YAR028WP39548 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.45□□□□□ -0.1
YAR028WP39548 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.45□□□□□ -0.1
YAR028WP39548 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.45□□□□□ -0.1
YAR028WP39548 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.45□□□□□ -0.1
YAR028WP39548 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.45□□□□□ -0.1
YAR028WP39548 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.45□□□□□ -0.1
YAR028WP39548 RTC3YHR087W 336 nt14.41□□□□□ -0.1
YAR028WP39548 CCC1YLR220W 969 nt14.26□□□□□ -0.13
YAR028WP39548 RVS167YDR388W 1449 nt14.05□□□□□ -0.16
YAR028WP39548 YOL085CYOL085C 342 nt14.01□□□□□ -0.17
YAR028WP39548 RPP1BYDL130W 321 nt13.98□□□□□ -0.17
YAR028WP39548 SCJ1YMR214W 1134 nt13.89□□□□□ -0.19
YAR028WP39548 SSA3YBL075C 1950 nt13.89□□□□□ -0.19
YAR028WP39548 PKP1YIL042C 1185 nt13.83□□□□□ -0.2
YAR028WP39548 PUT4YOR348C 1884 nt13.76□□□□□ -0.21
YAR028WP39548 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.52□□□□□ -0.25
YAR028WP39548 SHR5YOL110W 714 nt13.46□□□□□ -0.25
YAR028WP39548 PET122YER153C 765 nt13.4□□□□□ -0.26
YAR028WP39548 ARE1YCR048W 1833 nt13.37□□□□□ -0.27
YAR028WP39548 URN1YPR152C 1398 nt13.34□□□□□ -0.27
YAR028WP39548 POA1YBR022W 534 nt13.28□□□□□ -0.28
YAR028WP39548 SAH1YER043C 1350 nt13.26□□□□□ -0.29
YAR028WP39548 Q0182Q0182 405 nt13.26□□□□□ -0.29
YAR028WP39548 OPI9YLR338W 858 nt13.26□□□□□ -0.29
YAR028WP39548 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.21□□□□□ -0.29
YAR028WP39548 DEP1YAL013W 1218 nt13.2□□□□□ -0.3
YAR028WP39548 SCR1SCR1 522 nt13.14□□□□□ -0.31
YAR028WP39548 YDJ1YNL064C 1230 nt13.1□□□□□ -0.31
YAR028WP39548 BSC6YOL137W 1494 nt13.09□□□□□ -0.31
YAR028WP39548 RPN10YHR200W 807 nt13.06□□□□□ -0.32
YAR028WP39548 MOT3YMR070W 1473 nt13.01□□□□□ -0.33
YAR028WP39548 RRN5YLR141W 1092 nt12.97□□□□□ -0.33
YAR028WP39548 YNL208WYNL208W 600 nt12.97□□□□□ -0.33
YAR028WP39548 PUN1YLR414C 792 nt12.87□□□□□ -0.35
YAR028WP39548 BUD23YCR047C 828 nt12.85□□□□□ -0.35
YAR028WP39548 GAR1YHR089C 618 nt12.84□□□□□ -0.35
YAR028WP39548 ATS1YAL020C 1002 nt12.83□□□□□ -0.36
YAR028WP39548 SPT5YML010W 3192 nt12.8□□□□□ -0.36
YAR028WP39548 PTC2YER089C 1395 nt12.77□□□□□ -0.37
YAR028WP39548 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.71□□□□□ -0.37
YAR028WP39548 YJR018WYJR018W 363 nt12.71□□□□□ -0.37
YAR028WP39548 NAB2YGL122C 1578 nt12.67□□□□□ -0.38
YAR028WP39548 RSB1YOR049C 1065 nt12.56□□□□□ -0.4
YAR028WP39548 SSA4YER103W 1929 nt12.55□□□□□ -0.4
YAR028WP39548 FIS1YIL065C 468 nt12.46□□□□□ -0.41
YAR028WP39548 TIR1YER011W 765 nt12.45□□□□□ -0.42
YAR028WP39548 YJR120WYJR120W 351 nt12.43□□□□□ -0.42
YAR028WP39548 DAL1YIR027C 1383 nt12.42□□□□□ -0.42
YAR028WP39548 SSA1YAL005C 1929 nt12.38□□□□□ -0.43
YAR028WP39548 FPR4YLR449W 1179 nt12.36□□□□□ -0.43
YAR028WP39548 MEP2YNL142W 1500 nt12.34□□□□□ -0.43
YAR028WP39548 RPP2BYDR382W 333 nt12.34□□□□□ -0.43
YAR028WP39548 INM2YDR287W 879 nt12.32□□□□□ -0.44
YAR028WP39548 PHO4YFR034C 939 nt12.31□□□□□ -0.44
YAR028WP39548 YPS1YLR120C 1710 nt12.22□□□□□ -0.45
YAR028WP39548 YBL100CYBL100C 315 nt12.13□□□□□ -0.47
YAR028WP39548 DCW1YKL046C 1350 nt12.12□□□□□ -0.47
YAR028WP39548 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.1□□□□□ -0.47
YAR028WP39548 BDF1YLR399C 2061 nt12.1□□□□□ -0.47
YAR028WP39548 YDR095CYDR095C 411 nt12.09□□□□□ -0.47
YAR028WP39548 SRB2YHR041C 633 nt12.09□□□□□ -0.47
YAR028WP39548 BDH2YAL061W 1254 nt12.02□□□□□ -0.49
YAR028WP39548 FUN26YAL022C 1554 nt11.96□□□□□ -0.49
YAR028WP39548 EMI2YDR516C 1503 nt11.96□□□□□ -0.49
YAR028WP39548 PST2YDR032C 597 nt11.96□□□□□ -0.49
YAR028WP39548 TAT1YBR069C 1860 nt11.95□□□□□ -0.5
YAR028WP39548 YMR090WYMR090W 684 nt11.92□□□□□ -0.5
YAR028WP39548 YBR220CYBR220C 1683 nt11.89□□□□□ -0.51
YAR028WP39548 ALF1YNL148C 765 nt11.88□□□□□ -0.51
YAR028WP39548 PTP1YDL230W 1008 nt11.86□□□□□ -0.51
YAR028WP39548 TRM9YML014W 840 nt11.86□□□□□ -0.51
YAR028WP39548 YDL221WYDL221W 552 nt11.85□□□□□ -0.51
YAR028WP39548 RPP2AYOL039W 321 nt11.85□□□□□ -0.51
YAR028WP39548 CAC2YML102W 1407 nt11.83□□□□□ -0.52
YAR028WP39548 WWM1YFL010C 636 nt11.82□□□□□ -0.52
YAR028WP39548 LSM3YLR438C-A 270 nt11.8□□□□□ -0.52
YAR028WP39548 CCT6YDR188W 1641 nt11.78□□□□□ -0.52
YAR028WP39548 SDH1YKL148C 1923 nt11.78□□□□□ -0.52
YAR028WP39548 SIS1YNL007C 1059 nt11.73□□□□□ -0.53
YAR028WP39548 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.7□□□□□ -0.54
YAR028WP39548 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.7□□□□□ -0.54
YAR028WP39548 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.66□□□□□ -0.54
YAR028WP39548 IRC15YPL017C 1500 nt11.65□□□□□ -0.54
YAR028WP39548 SCC4YER147C 1875 nt11.64□□□□□ -0.55
YAR028WP39548 YGR021WYGR021W 873 nt11.64□□□□□ -0.55
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