Protein–RNA interactions for Protein: Q03796

TPP1, Polynucleotide 3'-phosphatase, yeastyeast

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TPP1Q03796 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.17■□□□□ 0.66
TPP1Q03796 NSR1YGR159C 1245 nt18.93■□□□□ 0.62
TPP1Q03796 NOP1YDL014W 984 nt18.81■□□□□ 0.6
TPP1Q03796 YKL036CYKL036C 393 nt17.5■□□□□ 0.39
TPP1Q03796 MDJ1YFL016C 1536 nt16.5■□□□□ 0.23
TPP1Q03796 Q0297Q0297 156 nt16.48■□□□□ 0.23
TPP1Q03796 SRX1YKL086W 384 nt16.38■□□□□ 0.21
TPP1Q03796 YJL027CYJL027C 417 nt16.37■□□□□ 0.21
TPP1Q03796 SCS3YGL126W 1143 nt15.97■□□□□ 0.15
TPP1Q03796 YCR051WYCR051W 669 nt15.55■□□□□ 0.08
TPP1Q03796 YOL085CYOL085C 342 nt15.12■□□□□ 0.01
TPP1Q03796 PKP1YIL042C 1185 nt14.82□□□□□ -0.04
TPP1Q03796 RPP1BYDL130W 321 nt14.79□□□□□ -0.04
TPP1Q03796 DBP2YNL112W 1641 nt14.68□□□□□ -0.06
TPP1Q03796 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.66□□□□□ -0.06
TPP1Q03796 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.66□□□□□ -0.06
TPP1Q03796 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.66□□□□□ -0.06
TPP1Q03796 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.66□□□□□ -0.06
TPP1Q03796 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.66□□□□□ -0.06
TPP1Q03796 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.66□□□□□ -0.06
TPP1Q03796 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.66□□□□□ -0.06
TPP1Q03796 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.66□□□□□ -0.06
TPP1Q03796 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.66□□□□□ -0.06
TPP1Q03796 CCC1YLR220W 969 nt14.51□□□□□ -0.09
TPP1Q03796 SCJ1YMR214W 1134 nt14.51□□□□□ -0.09
TPP1Q03796 ATS1YAL020C 1002 nt14.38□□□□□ -0.11
TPP1Q03796 YBR190WYBR190W 312 nt14.11□□□□□ -0.15
TPP1Q03796 SCR1SCR1 522 nt14.07□□□□□ -0.16
TPP1Q03796 PET122YER153C 765 nt14.05□□□□□ -0.16
TPP1Q03796 RVS167YDR388W 1449 nt13.98□□□□□ -0.17
TPP1Q03796 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.95□□□□□ -0.18
TPP1Q03796 RTC3YHR087W 336 nt13.8□□□□□ -0.2
TPP1Q03796 RRN5YLR141W 1092 nt13.69□□□□□ -0.22
TPP1Q03796 SSA3YBL075C 1950 nt13.6□□□□□ -0.23
TPP1Q03796 YDJ1YNL064C 1230 nt13.52□□□□□ -0.25
TPP1Q03796 SHR5YOL110W 714 nt13.5□□□□□ -0.25
TPP1Q03796 RSB1YOR049C 1065 nt13.49□□□□□ -0.25
TPP1Q03796 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.42□□□□□ -0.26
TPP1Q03796 PST2YDR032C 597 nt13.27□□□□□ -0.29
TPP1Q03796 GAR1YHR089C 618 nt13.15□□□□□ -0.3
TPP1Q03796 DEP1YAL013W 1218 nt12.98□□□□□ -0.33
TPP1Q03796 URN1YPR152C 1398 nt12.96□□□□□ -0.33
TPP1Q03796 RPN10YHR200W 807 nt12.91□□□□□ -0.34
TPP1Q03796 YKL097CYKL097C 411 nt12.88□□□□□ -0.35
TPP1Q03796 YNL208WYNL208W 600 nt12.88□□□□□ -0.35
TPP1Q03796 OPI9YLR338W 858 nt12.76□□□□□ -0.37
TPP1Q03796 Q0182Q0182 405 nt12.75□□□□□ -0.37
TPP1Q03796 TIR1YER011W 765 nt12.71□□□□□ -0.37
TPP1Q03796 SHU1YHL006C 453 nt12.65□□□□□ -0.38
TPP1Q03796 PUT4YOR348C 1884 nt12.58□□□□□ -0.4
TPP1Q03796 SAH1YER043C 1350 nt12.57□□□□□ -0.4
TPP1Q03796 MOT3YMR070W 1473 nt12.53□□□□□ -0.4
TPP1Q03796 SSA1YAL005C 1929 nt12.47□□□□□ -0.41
TPP1Q03796 PUN1YLR414C 792 nt12.43□□□□□ -0.42
TPP1Q03796 ARE1YCR048W 1833 nt12.41□□□□□ -0.42
TPP1Q03796 YJR018WYJR018W 363 nt12.4□□□□□ -0.42
TPP1Q03796 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.36□□□□□ -0.43
TPP1Q03796 RPP2BYDR382W 333 nt12.27□□□□□ -0.45
TPP1Q03796 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.26□□□□□ -0.45
TPP1Q03796 YOR139CYOR139C 393 nt12.25□□□□□ -0.45
TPP1Q03796 YGR021WYGR021W 873 nt12.24□□□□□ -0.45
TPP1Q03796 SRB2YHR041C 633 nt12.21□□□□□ -0.45
TPP1Q03796 POA1YBR022W 534 nt12.21□□□□□ -0.45
TPP1Q03796 NPL3YDR432W 1245 nt12.19□□□□□ -0.46
TPP1Q03796 PTC2YER089C 1395 nt12.18□□□□□ -0.46
TPP1Q03796 WWM1YFL010C 636 nt12.15□□□□□ -0.46
TPP1Q03796 YJR120WYJR120W 351 nt12.14□□□□□ -0.47
TPP1Q03796 HOM6YJR139C 1080 nt12.13□□□□□ -0.47
TPP1Q03796 MNP1YGL068W 585 nt12.05□□□□□ -0.48
TPP1Q03796 YOL037CYOL037C 354 nt12.04□□□□□ -0.48
TPP1Q03796 NAB2YGL122C 1578 nt12.04□□□□□ -0.48
TPP1Q03796 BUD23YCR047C 828 nt12.02□□□□□ -0.49
TPP1Q03796 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.02□□□□□ -0.49
TPP1Q03796 BDH2YAL061W 1254 nt12.01□□□□□ -0.49
TPP1Q03796 INM2YDR287W 879 nt11.98□□□□□ -0.49
TPP1Q03796 RKM5YLR137W 1104 nt11.96□□□□□ -0.49
TPP1Q03796 LSM3YLR438C-A 270 nt11.94□□□□□ -0.5
TPP1Q03796 DAL1YIR027C 1383 nt11.91□□□□□ -0.5
TPP1Q03796 BSC6YOL137W 1494 nt11.89□□□□□ -0.51
TPP1Q03796 FPR4YLR449W 1179 nt11.86□□□□□ -0.51
TPP1Q03796 YBL100CYBL100C 315 nt11.85□□□□□ -0.51
TPP1Q03796 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.8□□□□□ -0.52
TPP1Q03796 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.8□□□□□ -0.52
TPP1Q03796 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.8□□□□□ -0.52
TPP1Q03796 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.8□□□□□ -0.52
TPP1Q03796 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.8□□□□□ -0.52
TPP1Q03796 FIS1YIL065C 468 nt11.8□□□□□ -0.52
TPP1Q03796 TRM9YML014W 840 nt11.79□□□□□ -0.52
TPP1Q03796 PHO4YFR034C 939 nt11.76□□□□□ -0.53
TPP1Q03796 FUN26YAL022C 1554 nt11.71□□□□□ -0.53
TPP1Q03796 SSA4YER103W 1929 nt11.71□□□□□ -0.53
TPP1Q03796 YLR281CYLR281C 468 nt11.71□□□□□ -0.53
TPP1Q03796 SPT5YML010W 3192 nt11.7□□□□□ -0.54
TPP1Q03796 PUS2YGL063W 1113 nt11.66□□□□□ -0.54
TPP1Q03796 WHI5YOR083W 888 nt11.64□□□□□ -0.55
TPP1Q03796 CCT6YDR188W 1641 nt11.62□□□□□ -0.55
TPP1Q03796 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.57□□□□□ -0.56
TPP1Q03796 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.57□□□□□ -0.56
TPP1Q03796 ALF1YNL148C 765 nt11.55□□□□□ -0.56
TPP1Q03796 IMP2'YIL154C 1041 nt11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 23.3 ms