RNA–Protein interactions for RNA: YDR247W

VHS1, Transcript of Cytoplasmic serine/threonine protein kinase, yeastyeast

Gene VHS1, Length 1,386 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS1YDR247W YIL165CP40446 119 aa7.08□□□□□ -1.28
VHS1YDR247W UBP15P50101 1230 aa7.08□□□□□ -1.28
VHS1YDR247W MON1P53129 644 aa7.08□□□□□ -1.28
VHS1YDR247W MSH6Q03834 1242 aa7.08□□□□□ -1.28
VHS1YDR247W SNT2P53127 1403 aa7.07□□□□□ -1.28
VHS1YDR247W APM2P38700 605 aa7.07□□□□□ -1.28
VHS1YDR247W NMD2P38798 1089 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
VHS1YDR247W NUT1P53114 1132 aa7.07□□□□□ -1.28
VHS1YDR247W ITC1P53125 1264 aa7.07□□□□□ -1.28
VHS1YDR247W ULP1Q02724 621 aa7.07□□□□□ -1.28
VHS1YDR247W ADI1Q03677 179 aa7.07□□□□□ -1.28
VHS1YDR247W ESC1Q03661 1658 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
VHS1YDR247W COBP00163 385 aa7.06□□□□□ -1.28
VHS1YDR247W PYC2P32327 1180 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
VHS1YDR247W UGA4P32837 571 aa7.06□□□□□ -1.28
VHS1YDR247W RVS167P39743 482 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
VHS1YDR247W TCB1Q12466 1186 aa7.06□□□□□ -1.28
VHS1YDR247W DNF1P32660 1571 aa7.06□□□□□ -1.28
VHS1YDR247W CDC34P14682 295 aa7.05□□□□□ -1.28
VHS1YDR247W YKL091CP33324 310 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
VHS1YDR247W IOC3P43596 787 aa7.05□□□□□ -1.28
VHS1YDR247W DOS2P54858 310 aa7.05□□□□□ -1.28
VHS1YDR247W GDE1Q02979 1223 aa7.05□□□□□ -1.28
VHS1YDR247W TY1B-JR2P47100 1755 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
VHS1YDR247W TY1B-ER2Q03619 1755 aa7.04□□□□□ -1.28
VHS1YDR247W TY1B-MR1Q04214 1755 aa7.04□□□□□ -1.28
VHS1YDR247W TY1B-MR2Q04670 1755 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
VHS1YDR247W TY1B-LR1Q12088 1755 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
VHS1YDR247W TY1B-NL1Q12112 1755 aa7.04□□□□□ -1.28
VHS1YDR247W TY1B-GR1Q12141 1755 aa7.04□□□□□ -1.28
VHS1YDR247W TY1B-BLQ12490 1755 aa7.04□□□□□ -1.28
VHS1YDR247W NCL1P38205 684 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
VHS1YDR247W YAF9P53930 226 aa7.04□□□□□ -1.28
VHS1YDR247W NSE3Q05541 303 aa7.04□□□□□ -1.28
VHS1YDR247W PMT7Q06644 662 aa7.04□□□□□ -1.28
VHS1YDR247W RPP1AP05318 106 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
VHS1YDR247W OSW7P43611 510 aa7.03□□□□□ -1.28
VHS1YDR247W FAA4P47912 694 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
VHS1YDR247W RNH70P53331 553 aa7.03□□□□□ -1.28
VHS1YDR247W YNR040WP53736 256 aa7.03□□□□□ -1.28
VHS1YDR247W STI1P15705 589 aaKnown RBP RIP-Chip data7.02□□□□□ -1.29not detected
VHS1YDR247W DUR3P33413 735 aa7.02□□□□□ -1.29
VHS1YDR247W SQT1P35184 431 aa7.02□□□□□ -1.29
VHS1YDR247W SPC42P36094 363 aa7.02□□□□□ -1.29
VHS1YDR247W PIC2P40035 300 aa7.02□□□□□ -1.29
VHS1YDR247W UBP2Q01476 1272 aa7.02□□□□□ -1.29
VHS1YDR247W MRPL16P38064 232 aa7.01□□□□□ -1.29
VHS1YDR247W SAP155P43612 1002 aa7.01□□□□□ -1.29
VHS1YDR247W RSM26P47141 266 aa7.01□□□□□ -1.29
VHS1YDR247W RTT10Q08924 1013 aa7.01□□□□□ -1.29
VHS1YDR247W CDC25P04821 1589 aa7□□□□□ -1.29
VHS1YDR247W CAT8P39113 1433 aa7□□□□□ -1.29
VHS1YDR247W CDC19P00549 500 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
VHS1YDR247W DUT1P33317 147 aa7□□□□□ -1.29
VHS1YDR247W YER156CP40093 338 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
VHS1YDR247W RSC2Q06488 889 aa7□□□□□ -1.29
VHS1YDR247W CDC53Q12018 815 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
VHS1YDR247W NUP159P40477 1460 aa7□□□□□ -1.29
VHS1YDR247W IRC20Q06554 1556 aa7□□□□□ -1.29
VHS1YDR247W GCR1P07261 785 aa6.99□□□□□ -1.29
VHS1YDR247W PPG1P32838 368 aa6.99□□□□□ -1.29
VHS1YDR247W PRS1P32895 427 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
VHS1YDR247W PPT1P53043 513 aa6.99□□□□□ -1.29
VHS1YDR247W YGR053CP53234 283 aa6.99□□□□□ -1.29
VHS1YDR247W IOC4Q04213 475 aa6.99□□□□□ -1.29
VHS1YDR247W YLR346CQ06139 101 aa6.99□□□□□ -1.29
VHS1YDR247W YOR131CQ12486 218 aa6.99□□□□□ -1.29
VHS1YDR247W PRI2P20457 528 aa6.98□□□□□ -1.29
VHS1YDR247W GRX1P25373 110 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
VHS1YDR247W RIM11P38615 370 aa6.98□□□□□ -1.29
VHS1YDR247W RPN4Q03465 531 aa6.98□□□□□ -1.29
VHS1YDR247W MRL1Q06815 381 aa6.98□□□□□ -1.29
VHS1YDR247W OPI10Q08202 246 aa6.98□□□□□ -1.29
VHS1YDR247W TMA46Q12000 345 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
VHS1YDR247W GCN2P15442 1659 aa6.98□□□□□ -1.29
VHS1YDR247W GEA2P39993 1459 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
VHS1YDR247W CIT2P08679 460 aa6.97□□□□□ -1.29
VHS1YDR247W FUS1P11710 512 aa6.97□□□□□ -1.29
VHS1YDR247W RAD27P26793 382 aa6.97□□□□□ -1.29
VHS1YDR247W XKS1P42826 600 aa6.97□□□□□ -1.29
VHS1YDR247W GCR2Q01722 534 aa6.97□□□□□ -1.29
VHS1YDR247W TDA5Q06417 326 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
VHS1YDR247W BDF2Q07442 638 aa6.97□□□□□ -1.29
VHS1YDR247W CMR1Q12510 522 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
VHS1YDR247W PEX28P38848 579 aa6.96□□□□□ -1.29
VHS1YDR247W NAN1Q02931 896 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
VHS1YDR247W FAL1Q12099 399 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
VHS1YDR247W SRB8P25648 1427 aa6.96□□□□□ -1.3
VHS1YDR247W IDI1P15496 288 aa6.95□□□□□ -1.3
VHS1YDR247W NPR1P22211 790 aa6.95□□□□□ -1.3
VHS1YDR247W OSH7P38755 437 aa6.95□□□□□ -1.3
VHS1YDR247W SHU2P38957 223 aa6.95□□□□□ -1.3
VHS1YDR247W HEH2Q03281 663 aa6.95□□□□□ -1.3
VHS1YDR247W GDB1Q06625 1536 aa6.95□□□□□ -1.3
VHS1YDR247W TAF13P11747 167 aa6.95□□□□□ -1.3
VHS1YDR247W PRP5P21372 849 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
VHS1YDR247W TAT2P38967 592 aa6.95□□□□□ -1.3
VHS1YDR247W SPF1P39986 1215 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
VHS1YDR247W BRE2P43132 505 aa6.95□□□□□ -1.3
VHS1YDR247W PEX13P80667 386 aa6.95□□□□□ -1.3
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