Protein–RNA interactions for Protein: Q12466

TCB1, Tricalbin-1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TCB1Q12466 YML009W-BYML009W-B 477 nt27.04■■□□□ 1.92
TCB1Q12466 NOP1YDL014W 984 nt26.5■■□□□ 1.83
TCB1Q12466 NSR1YGR159C 1245 nt26.31■■□□□ 1.8
TCB1Q12466 YKL036CYKL036C 393 nt25.01■■□□□ 1.59
TCB1Q12466 YJL027CYJL027C 417 nt23.48■■□□□ 1.35
TCB1Q12466 Q0297Q0297 156 nt23.38■■□□□ 1.33
TCB1Q12466 SRX1YKL086W 384 nt23.16■■□□□ 1.3
TCB1Q12466 SCS3YGL126W 1143 nt23.07■■□□□ 1.28
TCB1Q12466 MDJ1YFL016C 1536 nt22.84■■□□□ 1.25
TCB1Q12466 YCR051WYCR051W 669 nt22.05■■□□□ 1.12
TCB1Q12466 YOL085CYOL085C 342 nt21.65■■□□□ 1.06
TCB1Q12466 PKP1YIL042C 1185 nt21.29■■□□□ 1
TCB1Q12466 SCJ1YMR214W 1134 nt21.15■□□□□ 0.98
TCB1Q12466 RPP1BYDL130W 321 nt21■□□□□ 0.95
TCB1Q12466 ATS1YAL020C 1002 nt20.8■□□□□ 0.92
TCB1Q12466 TRN1tP(UGG)A 72 nt20.58■□□□□ 0.89
TCB1Q12466 SUF9tP(UGG)F 72 nt20.58■□□□□ 0.89
TCB1Q12466 SUF8tP(UGG)H 72 nt20.58■□□□□ 0.89
TCB1Q12466 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt20.58■□□□□ 0.89
TCB1Q12466 SUF7tP(UGG)M 72 nt20.58■□□□□ 0.89
TCB1Q12466 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt20.58■□□□□ 0.89
TCB1Q12466 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt20.58■□□□□ 0.89
TCB1Q12466 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt20.58■□□□□ 0.89
TCB1Q12466 SUF11tP(UGG)O2 72 nt20.58■□□□□ 0.89
TCB1Q12466 CCC1YLR220W 969 nt20.43■□□□□ 0.86
TCB1Q12466 DBP2YNL112W 1641 nt20.42■□□□□ 0.86
TCB1Q12466 PET122YER153C 765 nt19.99■□□□□ 0.79
TCB1Q12466 SCR1SCR1 522 nt19.95■□□□□ 0.78
TCB1Q12466 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt19.69■□□□□ 0.74
TCB1Q12466 RRN5YLR141W 1092 nt19.49■□□□□ 0.71
TCB1Q12466 RVS167YDR388W 1449 nt19.34■□□□□ 0.69
TCB1Q12466 RTC3YHR087W 336 nt19.29■□□□□ 0.68
TCB1Q12466 YBR190WYBR190W 312 nt19.29■□□□□ 0.68
TCB1Q12466 RSB1YOR049C 1065 nt19.28■□□□□ 0.68
TCB1Q12466 PST2YDR032C 597 nt19.16■□□□□ 0.66
TCB1Q12466 YER088W-BYER088W-B 147 nt19.11■□□□□ 0.65
TCB1Q12466 YDJ1YNL064C 1230 nt19.01■□□□□ 0.63
TCB1Q12466 SHR5YOL110W 714 nt18.81■□□□□ 0.6
TCB1Q12466 YKL097CYKL097C 411 nt18.73■□□□□ 0.59
TCB1Q12466 GAR1YHR089C 618 nt18.54■□□□□ 0.56
TCB1Q12466 SHU1YHL006C 453 nt18.25■□□□□ 0.51
TCB1Q12466 DEP1YAL013W 1218 nt18.12■□□□□ 0.49
TCB1Q12466 URN1YPR152C 1398 nt17.93■□□□□ 0.46
TCB1Q12466 TIR1YER011W 765 nt17.88■□□□□ 0.45
TCB1Q12466 YNL208WYNL208W 600 nt17.87■□□□□ 0.45
TCB1Q12466 YOR139CYOR139C 393 nt17.86■□□□□ 0.45
TCB1Q12466 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt17.82■□□□□ 0.44
TCB1Q12466 RPN10YHR200W 807 nt17.79■□□□□ 0.44
TCB1Q12466 NPL3YDR432W 1245 nt17.6■□□□□ 0.41
TCB1Q12466 OPI9YLR338W 858 nt17.54■□□□□ 0.4
TCB1Q12466 SSA1YAL005C 1929 nt17.53■□□□□ 0.4
TCB1Q12466 SRB2YHR041C 633 nt17.36■□□□□ 0.37
TCB1Q12466 SAH1YER043C 1350 nt17.28■□□□□ 0.36
TCB1Q12466 MNP1YGL068W 585 nt17.26■□□□□ 0.35
TCB1Q12466 YGR021WYGR021W 873 nt17.26■□□□□ 0.35
TCB1Q12466 HOM6YJR139C 1080 nt17.23■□□□□ 0.35
TCB1Q12466 WWM1YFL010C 636 nt17.2■□□□□ 0.34
TCB1Q12466 YOL037CYOL037C 354 nt17.18■□□□□ 0.34
TCB1Q12466 YJR018WYJR018W 363 nt17.15■□□□□ 0.34
TCB1Q12466 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt17.13■□□□□ 0.33
TCB1Q12466 IMT4tM(CAU)E 72 nt17.13■□□□□ 0.33
TCB1Q12466 IMT3tM(CAU)J3 72 nt17.13■□□□□ 0.33
TCB1Q12466 IMT1tM(CAU)O1 72 nt17.13■□□□□ 0.33
TCB1Q12466 IMT2tM(CAU)P 72 nt17.13■□□□□ 0.33
TCB1Q12466 PUT4YOR348C 1884 nt17.04■□□□□ 0.32
TCB1Q12466 PUN1YLR414C 792 nt17.03■□□□□ 0.32
TCB1Q12466 YJR120WYJR120W 351 nt16.99■□□□□ 0.31
TCB1Q12466 RKM5YLR137W 1104 nt16.98■□□□□ 0.31
TCB1Q12466 RPP2BYDR382W 333 nt16.96■□□□□ 0.31
TCB1Q12466 ARE1YCR048W 1833 nt16.93■□□□□ 0.3
TCB1Q12466 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt16.89■□□□□ 0.29
TCB1Q12466 PUS2YGL063W 1113 nt16.8■□□□□ 0.28
TCB1Q12466 YLR281CYLR281C 468 nt16.74■□□□□ 0.27
TCB1Q12466 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt16.73■□□□□ 0.27
TCB1Q12466 PTC2YER089C 1395 nt16.73■□□□□ 0.27
TCB1Q12466 SSA3YBL075C 1950 nt16.72■□□□□ 0.27
TCB1Q12466 BDH2YAL061W 1254 nt16.71■□□□□ 0.27
TCB1Q12466 MOT3YMR070W 1473 nt16.69■□□□□ 0.26
TCB1Q12466 WHI5YOR083W 888 nt16.61■□□□□ 0.25
TCB1Q12466 LSM3YLR438C-A 270 nt16.6■□□□□ 0.25
TCB1Q12466 POA1YBR022W 534 nt16.6■□□□□ 0.25
TCB1Q12466 BSC6YOL137W 1494 nt16.5■□□□□ 0.23
TCB1Q12466 INM2YDR287W 879 nt16.45■□□□□ 0.22
TCB1Q12466 BUD23YCR047C 828 nt16.42■□□□□ 0.22
TCB1Q12466 NAB2YGL122C 1578 nt16.42■□□□□ 0.22
TCB1Q12466 YBL100CYBL100C 315 nt16.39■□□□□ 0.21
TCB1Q12466 FMP45YDL222C 930 nt16.38■□□□□ 0.21
TCB1Q12466 FPR4YLR449W 1179 nt16.34■□□□□ 0.21
TCB1Q12466 YPR011CYPR011C 981 nt16.33■□□□□ 0.2
TCB1Q12466 DAL1YIR027C 1383 nt16.33■□□□□ 0.2
TCB1Q12466 DSK2YMR276W 1122 nt16.32■□□□□ 0.2
TCB1Q12466 TRM9YML014W 840 nt16.31■□□□□ 0.2
TCB1Q12466 YLR236CYLR236C 324 nt16.25■□□□□ 0.19
TCB1Q12466 YCH1YGR203W 447 nt16.24■□□□□ 0.19
TCB1Q12466 FIS1YIL065C 468 nt16.23■□□□□ 0.19
TCB1Q12466 MRPL8YJL063C 717 nt16.23■□□□□ 0.19
TCB1Q12466 FUN26YAL022C 1554 nt16.22■□□□□ 0.19
TCB1Q12466 IMP2'YIL154C 1041 nt16.22■□□□□ 0.19
TCB1Q12466 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt16.17■□□□□ 0.18
TCB1Q12466 PHO4YFR034C 939 nt16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.1 ms