Protein–RNA interactions for Protein: Q06139

YLR346C, Uncharacterized protein YLR346C, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR346CQ06139 NSR1YGR159C 1245 nt18.38■□□□□ 0.53
YLR346CQ06139 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.04■□□□□ 0.48
YLR346CQ06139 NOP1YDL014W 984 nt17.47■□□□□ 0.39
YLR346CQ06139 MDJ1YFL016C 1536 nt16.58■□□□□ 0.24
YLR346CQ06139 YKL036CYKL036C 393 nt15.67■□□□□ 0.1
YLR346CQ06139 YJL027CYJL027C 417 nt15.36■□□□□ 0.05
YLR346CQ06139 SRX1YKL086W 384 nt15.21■□□□□ 0.03
YLR346CQ06139 Q0297Q0297 156 nt15.11■□□□□ 0.01
YLR346CQ06139 DBP2YNL112W 1641 nt14.51□□□□□ -0.09
YLR346CQ06139 YCR051WYCR051W 669 nt14.39□□□□□ -0.11
YLR346CQ06139 YBR190WYBR190W 312 nt14.35□□□□□ -0.11
YLR346CQ06139 RTC3YHR087W 336 nt13.99□□□□□ -0.17
YLR346CQ06139 SCS3YGL126W 1143 nt13.98□□□□□ -0.17
YLR346CQ06139 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.96□□□□□ -0.17
YLR346CQ06139 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.96□□□□□ -0.17
YLR346CQ06139 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.96□□□□□ -0.17
YLR346CQ06139 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.96□□□□□ -0.17
YLR346CQ06139 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.96□□□□□ -0.17
YLR346CQ06139 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.96□□□□□ -0.17
YLR346CQ06139 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.96□□□□□ -0.17
YLR346CQ06139 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.96□□□□□ -0.17
YLR346CQ06139 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.96□□□□□ -0.17
YLR346CQ06139 CCC1YLR220W 969 nt13.83□□□□□ -0.2
YLR346CQ06139 RVS167YDR388W 1449 nt13.66□□□□□ -0.22
YLR346CQ06139 YOL085CYOL085C 342 nt13.57□□□□□ -0.24
YLR346CQ06139 RPP1BYDL130W 321 nt13.55□□□□□ -0.24
YLR346CQ06139 SSA3YBL075C 1950 nt13.4□□□□□ -0.27
YLR346CQ06139 PKP1YIL042C 1185 nt13.36□□□□□ -0.27
YLR346CQ06139 SCJ1YMR214W 1134 nt13.35□□□□□ -0.27
YLR346CQ06139 YGR139WYGR139W 339 nt13.31□□□□□ -0.28
YLR346CQ06139 PUT4YOR348C 1884 nt13.28□□□□□ -0.28
YLR346CQ06139 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.09□□□□□ -0.31
YLR346CQ06139 SHR5YOL110W 714 nt13.05□□□□□ -0.32
YLR346CQ06139 PET122YER153C 765 nt12.94□□□□□ -0.34
YLR346CQ06139 URN1YPR152C 1398 nt12.92□□□□□ -0.34
YLR346CQ06139 ARE1YCR048W 1833 nt12.91□□□□□ -0.34
YLR346CQ06139 POA1YBR022W 534 nt12.86□□□□□ -0.35
YLR346CQ06139 OPI9YLR338W 858 nt12.84□□□□□ -0.35
YLR346CQ06139 SAH1YER043C 1350 nt12.83□□□□□ -0.36
YLR346CQ06139 SCR1SCR1 522 nt12.78□□□□□ -0.36
YLR346CQ06139 DEP1YAL013W 1218 nt12.76□□□□□ -0.37
YLR346CQ06139 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.74□□□□□ -0.37
YLR346CQ06139 RPN10YHR200W 807 nt12.7□□□□□ -0.38
YLR346CQ06139 YDJ1YNL064C 1230 nt12.7□□□□□ -0.38
YLR346CQ06139 BSC6YOL137W 1494 nt12.64□□□□□ -0.39
YLR346CQ06139 Q0182Q0182 405 nt12.62□□□□□ -0.39
YLR346CQ06139 YNL208WYNL208W 600 nt12.59□□□□□ -0.39
YLR346CQ06139 RRN5YLR141W 1092 nt12.56□□□□□ -0.4
YLR346CQ06139 MOT3YMR070W 1473 nt12.49□□□□□ -0.41
YLR346CQ06139 PUN1YLR414C 792 nt12.49□□□□□ -0.41
YLR346CQ06139 BUD23YCR047C 828 nt12.44□□□□□ -0.42
YLR346CQ06139 GAR1YHR089C 618 nt12.44□□□□□ -0.42
YLR346CQ06139 ATS1YAL020C 1002 nt12.43□□□□□ -0.42
YLR346CQ06139 PTC2YER089C 1395 nt12.37□□□□□ -0.43
YLR346CQ06139 SPT5YML010W 3192 nt12.33□□□□□ -0.44
YLR346CQ06139 YJR018WYJR018W 363 nt12.32□□□□□ -0.44
YLR346CQ06139 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.3□□□□□ -0.44
YLR346CQ06139 NAB2YGL122C 1578 nt12.3□□□□□ -0.44
YLR346CQ06139 NME1NME1 340 nt12.29□□□□□ -0.44
YLR346CQ06139 RSB1YOR049C 1065 nt12.18□□□□□ -0.46
YLR346CQ06139 SSA4YER103W 1929 nt12.11□□□□□ -0.47
YLR346CQ06139 TIR1YER011W 765 nt12.06□□□□□ -0.48
YLR346CQ06139 DAL1YIR027C 1383 nt12.04□□□□□ -0.48
YLR346CQ06139 RPP2BYDR382W 333 nt12.01□□□□□ -0.49
YLR346CQ06139 INM2YDR287W 879 nt11.99□□□□□ -0.49
YLR346CQ06139 FPR4YLR449W 1179 nt11.99□□□□□ -0.49
YLR346CQ06139 FIS1YIL065C 468 nt11.98□□□□□ -0.49
YLR346CQ06139 SSA1YAL005C 1929 nt11.96□□□□□ -0.5
YLR346CQ06139 MEP2YNL142W 1500 nt11.93□□□□□ -0.5
YLR346CQ06139 YJR120WYJR120W 351 nt11.93□□□□□ -0.5
YLR346CQ06139 CSM2YIL132C 642 nt11.91□□□□□ -0.5
YLR346CQ06139 PHO4YFR034C 939 nt11.89□□□□□ -0.51
YLR346CQ06139 YPS1YLR120C 1710 nt11.82□□□□□ -0.52
YLR346CQ06139 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.74□□□□□ -0.53
YLR346CQ06139 YBL100CYBL100C 315 nt11.74□□□□□ -0.53
YLR346CQ06139 PAU21YOR394W 495 nt11.69□□□□□ -0.54
YLR346CQ06139 PAU22YPL282C 495 nt11.69□□□□□ -0.54
YLR346CQ06139 YDR095CYDR095C 411 nt11.68□□□□□ -0.54
YLR346CQ06139 DCW1YKL046C 1350 nt11.67□□□□□ -0.54
YLR346CQ06139 BDF1YLR399C 2061 nt11.66□□□□□ -0.54
YLR346CQ06139 BDH2YAL061W 1254 nt11.66□□□□□ -0.54
YLR346CQ06139 YMR090WYMR090W 684 nt11.61□□□□□ -0.55
YLR346CQ06139 ARO7YPR060C 771 nt11.61□□□□□ -0.55
YLR346CQ06139 FUN26YAL022C 1554 nt11.59□□□□□ -0.55
YLR346CQ06139 SRB2YHR041C 633 nt11.59□□□□□ -0.55
YLR346CQ06139 PST2YDR032C 597 nt11.58□□□□□ -0.56
YLR346CQ06139 PAM17YKR065C 594 nt11.58□□□□□ -0.56
YLR346CQ06139 EMI2YDR516C 1503 nt11.56□□□□□ -0.56
YLR346CQ06139 ALF1YNL148C 765 nt11.56□□□□□ -0.56
YLR346CQ06139 TRM9YML014W 840 nt11.55□□□□□ -0.56
YLR346CQ06139 TAT1YBR069C 1860 nt11.51□□□□□ -0.57
YLR346CQ06139 RPP2AYOL039W 321 nt11.49□□□□□ -0.57
YLR346CQ06139 VAR1Q0140 1197 nt11.48□□□□□ -0.57
YLR346CQ06139 YBR220CYBR220C 1683 nt11.48□□□□□ -0.57
YLR346CQ06139 LSM3YLR438C-A 270 nt11.47□□□□□ -0.57
YLR346CQ06139 YDL221WYDL221W 552 nt11.45□□□□□ -0.58
YLR346CQ06139 PTP1YDL230W 1008 nt11.43□□□□□ -0.58
YLR346CQ06139 WWM1YFL010C 636 nt11.42□□□□□ -0.58
YLR346CQ06139 CCT6YDR188W 1641 nt11.41□□□□□ -0.58
YLR346CQ06139 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.7 ms