Protein–RNA interactions for Protein: Q12018

CDC53, Cell division control protein 53, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CDC53Q12018 YML009W-BYML009W-B 477 nt22.35■■□□□ 1.17
CDC53Q12018 NSR1YGR159C 1245 nt22.04■■□□□ 1.12
CDC53Q12018 NOP1YDL014W 984 nt21.66■■□□□ 1.06
CDC53Q12018 YKL036CYKL036C 393 nt20.08■□□□□ 0.81
CDC53Q12018 MDJ1YFL016C 1536 nt19.63■□□□□ 0.73
CDC53Q12018 Q0297Q0297 156 nt18.98■□□□□ 0.63
CDC53Q12018 SRX1YKL086W 384 nt18.94■□□□□ 0.62
CDC53Q12018 YJL027CYJL027C 417 nt18.8■□□□□ 0.6
CDC53Q12018 SCS3YGL126W 1143 nt18.34■□□□□ 0.53
CDC53Q12018 YCR051WYCR051W 669 nt18.05■□□□□ 0.48
CDC53Q12018 YOL085CYOL085C 342 nt17.4■□□□□ 0.38
CDC53Q12018 DBP2YNL112W 1641 nt17.34■□□□□ 0.37
CDC53Q12018 PKP1YIL042C 1185 nt17.22■□□□□ 0.35
CDC53Q12018 TRN1tP(UGG)A 72 nt17.1■□□□□ 0.33
CDC53Q12018 SUF9tP(UGG)F 72 nt17.1■□□□□ 0.33
CDC53Q12018 SUF8tP(UGG)H 72 nt17.1■□□□□ 0.33
CDC53Q12018 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt17.1■□□□□ 0.33
CDC53Q12018 SUF7tP(UGG)M 72 nt17.1■□□□□ 0.33
CDC53Q12018 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt17.1■□□□□ 0.33
CDC53Q12018 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt17.1■□□□□ 0.33
CDC53Q12018 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt17.1■□□□□ 0.33
CDC53Q12018 SUF11tP(UGG)O2 72 nt17.1■□□□□ 0.33
CDC53Q12018 RPP1BYDL130W 321 nt17.05■□□□□ 0.32
CDC53Q12018 CCC1YLR220W 969 nt17.02■□□□□ 0.32
CDC53Q12018 YBR190WYBR190W 312 nt16.62■□□□□ 0.25
CDC53Q12018 ATS1YAL020C 1002 nt16.4■□□□□ 0.22
CDC53Q12018 RTC3YHR087W 336 nt16.35■□□□□ 0.21
CDC53Q12018 PET122YER153C 765 nt16.34■□□□□ 0.21
CDC53Q12018 RVS167YDR388W 1449 nt16.3■□□□□ 0.2
CDC53Q12018 SCJ1YMR214W 1134 nt16.29■□□□□ 0.2
CDC53Q12018 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt16.21■□□□□ 0.19
CDC53Q12018 SCR1SCR1 522 nt16.13■□□□□ 0.17
CDC53Q12018 RRN5YLR141W 1092 nt15.87■□□□□ 0.13
CDC53Q12018 SHR5YOL110W 714 nt15.74■□□□□ 0.11
CDC53Q12018 YDJ1YNL064C 1230 nt15.63■□□□□ 0.09
CDC53Q12018 RSB1YOR049C 1065 nt15.58■□□□□ 0.08
CDC53Q12018 YER088W-BYER088W-B 147 nt15.54■□□□□ 0.08
CDC53Q12018 DEP1YAL013W 1218 nt15.39■□□□□ 0.05
CDC53Q12018 GAR1YHR089C 618 nt15.37■□□□□ 0.05
CDC53Q12018 URN1YPR152C 1398 nt15.31■□□□□ 0.04
CDC53Q12018 Q0182Q0182 405 nt15.26■□□□□ 0.03
CDC53Q12018 PST2YDR032C 597 nt15.16■□□□□ 0.02
CDC53Q12018 PUT4YOR348C 1884 nt15.06■□□□□ 0
CDC53Q12018 YNL208WYNL208W 600 nt15.05■□□□□ -0
CDC53Q12018 RPN10YHR200W 807 nt15.03■□□□□ -0
CDC53Q12018 OPI9YLR338W 858 nt15.03■□□□□ -0
CDC53Q12018 SAH1YER043C 1350 nt14.98□□□□□ -0.01
CDC53Q12018 SSA3YBL075C 1950 nt14.87□□□□□ -0.03
CDC53Q12018 ARE1YCR048W 1833 nt14.83□□□□□ -0.04
CDC53Q12018 TIR1YER011W 765 nt14.81□□□□□ -0.04
CDC53Q12018 MOT3YMR070W 1473 nt14.74□□□□□ -0.05
CDC53Q12018 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.68□□□□□ -0.06
CDC53Q12018 POA1YBR022W 534 nt14.65□□□□□ -0.06
CDC53Q12018 SSA1YAL005C 1929 nt14.64□□□□□ -0.07
CDC53Q12018 YKL097CYKL097C 411 nt14.62□□□□□ -0.07
CDC53Q12018 YJR018WYJR018W 363 nt14.59□□□□□ -0.07
CDC53Q12018 SHU1YHL006C 453 nt14.58□□□□□ -0.08
CDC53Q12018 PUN1YLR414C 792 nt14.58□□□□□ -0.08
CDC53Q12018 SRB2YHR041C 633 nt14.46□□□□□ -0.09
CDC53Q12018 PTC2YER089C 1395 nt14.45□□□□□ -0.1
CDC53Q12018 YJR120WYJR120W 351 nt14.4□□□□□ -0.1
CDC53Q12018 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt14.4□□□□□ -0.1
CDC53Q12018 BUD23YCR047C 828 nt14.38□□□□□ -0.11
CDC53Q12018 BSC6YOL137W 1494 nt14.3□□□□□ -0.12
CDC53Q12018 RPP2BYDR382W 333 nt14.29□□□□□ -0.12
CDC53Q12018 WWM1YFL010C 636 nt14.22□□□□□ -0.13
CDC53Q12018 NAB2YGL122C 1578 nt14.2□□□□□ -0.14
CDC53Q12018 FPR4YLR449W 1179 nt14.1□□□□□ -0.15
CDC53Q12018 MNP1YGL068W 585 nt14.08□□□□□ -0.16
CDC53Q12018 YGR021WYGR021W 873 nt14.06□□□□□ -0.16
CDC53Q12018 HOM6YJR139C 1080 nt14.06□□□□□ -0.16
CDC53Q12018 YOR139CYOR139C 393 nt14.04□□□□□ -0.16
CDC53Q12018 DAL1YIR027C 1383 nt14.04□□□□□ -0.16
CDC53Q12018 FIS1YIL065C 468 nt14.03□□□□□ -0.16
CDC53Q12018 BDH2YAL061W 1254 nt14.02□□□□□ -0.17
CDC53Q12018 INM2YDR287W 879 nt14.01□□□□□ -0.17
CDC53Q12018 YBL100CYBL100C 315 nt13.94□□□□□ -0.18
CDC53Q12018 PHO4YFR034C 939 nt13.92□□□□□ -0.18
CDC53Q12018 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.91□□□□□ -0.18
CDC53Q12018 NPL3YDR432W 1245 nt13.9□□□□□ -0.18
CDC53Q12018 RKM5YLR137W 1104 nt13.85□□□□□ -0.19
CDC53Q12018 LSM3YLR438C-A 270 nt13.81□□□□□ -0.2
CDC53Q12018 FUN26YAL022C 1554 nt13.78□□□□□ -0.2
CDC53Q12018 TRM9YML014W 840 nt13.76□□□□□ -0.21
CDC53Q12018 YOL037CYOL037C 354 nt13.76□□□□□ -0.21
CDC53Q12018 SPT5YML010W 3192 nt13.75□□□□□ -0.21
CDC53Q12018 YPS1YLR120C 1710 nt13.6□□□□□ -0.23
CDC53Q12018 CCT6YDR188W 1641 nt13.58□□□□□ -0.24
CDC53Q12018 ALF1YNL148C 765 nt13.58□□□□□ -0.24
CDC53Q12018 YDR095CYDR095C 411 nt13.53□□□□□ -0.24
CDC53Q12018 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.49□□□□□ -0.25
CDC53Q12018 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt13.47□□□□□ -0.25
CDC53Q12018 IMT4tM(CAU)E 72 nt13.47□□□□□ -0.25
CDC53Q12018 IMT3tM(CAU)J3 72 nt13.47□□□□□ -0.25
CDC53Q12018 IMT1tM(CAU)O1 72 nt13.47□□□□□ -0.25
CDC53Q12018 IMT2tM(CAU)P 72 nt13.47□□□□□ -0.25
CDC53Q12018 YLR281CYLR281C 468 nt13.46□□□□□ -0.25
CDC53Q12018 SSA4YER103W 1929 nt13.46□□□□□ -0.25
CDC53Q12018 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.45□□□□□ -0.26
CDC53Q12018 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.45□□□□□ -0.26
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