Protein–RNA interactions for Protein: Q12510

CMR1, DNA damage-binding protein CMR1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CMR1Q12510 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.81■□□□□ 0.76
CMR1Q12510 NSR1YGR159C 1245 nt19.78■□□□□ 0.76
CMR1Q12510 NOP1YDL014W 984 nt19.33■□□□□ 0.68
CMR1Q12510 MDJ1YFL016C 1536 nt17.96■□□□□ 0.47
CMR1Q12510 YKL036CYKL036C 393 nt17.95■□□□□ 0.46
CMR1Q12510 Q0297Q0297 156 nt16.9■□□□□ 0.3
CMR1Q12510 SRX1YKL086W 384 nt16.83■□□□□ 0.28
CMR1Q12510 YJL027CYJL027C 417 nt16.82■□□□□ 0.28
CMR1Q12510 SCS3YGL126W 1143 nt16.39■□□□□ 0.21
CMR1Q12510 YCR051WYCR051W 669 nt16.05■□□□□ 0.16
CMR1Q12510 DBP2YNL112W 1641 nt15.72■□□□□ 0.11
CMR1Q12510 YOL085CYOL085C 342 nt15.51■□□□□ 0.07
CMR1Q12510 YBR190WYBR190W 312 nt15.34■□□□□ 0.05
CMR1Q12510 PKP1YIL042C 1185 nt15.29■□□□□ 0.04
CMR1Q12510 RPP1BYDL130W 321 nt15.19■□□□□ 0.02
CMR1Q12510 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.19■□□□□ 0.02
CMR1Q12510 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.19■□□□□ 0.02
CMR1Q12510 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.19■□□□□ 0.02
CMR1Q12510 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.19■□□□□ 0.02
CMR1Q12510 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.19■□□□□ 0.02
CMR1Q12510 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.19■□□□□ 0.02
CMR1Q12510 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.19■□□□□ 0.02
CMR1Q12510 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.19■□□□□ 0.02
CMR1Q12510 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.19■□□□□ 0.02
CMR1Q12510 CCC1YLR220W 969 nt15.04■□□□□ -0
CMR1Q12510 RTC3YHR087W 336 nt15.02■□□□□ -0
CMR1Q12510 SCJ1YMR214W 1134 nt14.71□□□□□ -0.05
CMR1Q12510 RVS167YDR388W 1449 nt14.7□□□□□ -0.06
CMR1Q12510 ATS1YAL020C 1002 nt14.7□□□□□ -0.06
CMR1Q12510 PET122YER153C 765 nt14.49□□□□□ -0.09
CMR1Q12510 SCR1SCR1 522 nt14.45□□□□□ -0.1
CMR1Q12510 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.37□□□□□ -0.11
CMR1Q12510 PUT4YOR348C 1884 nt14.21□□□□□ -0.13
CMR1Q12510 SHR5YOL110W 714 nt14.11□□□□□ -0.15
CMR1Q12510 RRN5YLR141W 1092 nt14.09□□□□□ -0.15
CMR1Q12510 Q0182Q0182 405 nt14.06□□□□□ -0.16
CMR1Q12510 SSA3YBL075C 1950 nt14.05□□□□□ -0.16
CMR1Q12510 URN1YPR152C 1398 nt13.94□□□□□ -0.18
CMR1Q12510 RSB1YOR049C 1065 nt13.9□□□□□ -0.18
CMR1Q12510 YDJ1YNL064C 1230 nt13.88□□□□□ -0.19
CMR1Q12510 ARE1YCR048W 1833 nt13.85□□□□□ -0.19
CMR1Q12510 DEP1YAL013W 1218 nt13.85□□□□□ -0.19
CMR1Q12510 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.8□□□□□ -0.2
CMR1Q12510 SAH1YER043C 1350 nt13.8□□□□□ -0.2
CMR1Q12510 OPI9YLR338W 858 nt13.78□□□□□ -0.2
CMR1Q12510 POA1YBR022W 534 nt13.74□□□□□ -0.21
CMR1Q12510 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.71□□□□□ -0.21
CMR1Q12510 RPN10YHR200W 807 nt13.64□□□□□ -0.23
CMR1Q12510 MOT3YMR070W 1473 nt13.62□□□□□ -0.23
CMR1Q12510 GAR1YHR089C 618 nt13.6□□□□□ -0.23
CMR1Q12510 YNL208WYNL208W 600 nt13.57□□□□□ -0.24
CMR1Q12510 PST2YDR032C 597 nt13.55□□□□□ -0.24
CMR1Q12510 BSC6YOL137W 1494 nt13.52□□□□□ -0.25
CMR1Q12510 PUN1YLR414C 792 nt13.38□□□□□ -0.27
CMR1Q12510 BUD23YCR047C 828 nt13.36□□□□□ -0.27
CMR1Q12510 PTC2YER089C 1395 nt13.28□□□□□ -0.28
CMR1Q12510 YJR018WYJR018W 363 nt13.25□□□□□ -0.29
CMR1Q12510 YKL097CYKL097C 411 nt13.18□□□□□ -0.3
CMR1Q12510 NAB2YGL122C 1578 nt13.15□□□□□ -0.3
CMR1Q12510 TIR1YER011W 765 nt13.11□□□□□ -0.31
CMR1Q12510 SPT5YML010W 3192 nt13.08□□□□□ -0.32
CMR1Q12510 SSA1YAL005C 1929 nt13.01□□□□□ -0.33
CMR1Q12510 YJR120WYJR120W 351 nt13□□□□□ -0.33
CMR1Q12510 SHU1YHL006C 453 nt12.99□□□□□ -0.33
CMR1Q12510 FIS1YIL065C 468 nt12.97□□□□□ -0.33
CMR1Q12510 DAL1YIR027C 1383 nt12.93□□□□□ -0.34
CMR1Q12510 FPR4YLR449W 1179 nt12.91□□□□□ -0.34
CMR1Q12510 RPP2BYDR382W 333 nt12.9□□□□□ -0.34
CMR1Q12510 PHO4YFR034C 939 nt12.82□□□□□ -0.36
CMR1Q12510 SSA4YER103W 1929 nt12.8□□□□□ -0.36
CMR1Q12510 INM2YDR287W 879 nt12.79□□□□□ -0.36
CMR1Q12510 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.77□□□□□ -0.37
CMR1Q12510 SRB2YHR041C 633 nt12.76□□□□□ -0.37
CMR1Q12510 MEP2YNL142W 1500 nt12.71□□□□□ -0.38
CMR1Q12510 YBL100CYBL100C 315 nt12.67□□□□□ -0.38
CMR1Q12510 YPS1YLR120C 1710 nt12.67□□□□□ -0.38
CMR1Q12510 BDH2YAL061W 1254 nt12.58□□□□□ -0.4
CMR1Q12510 YGR021WYGR021W 873 nt12.57□□□□□ -0.4
CMR1Q12510 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.57□□□□□ -0.4
CMR1Q12510 WWM1YFL010C 636 nt12.55□□□□□ -0.4
CMR1Q12510 YDR095CYDR095C 411 nt12.54□□□□□ -0.4
CMR1Q12510 YOR139CYOR139C 393 nt12.54□□□□□ -0.4
CMR1Q12510 DCW1YKL046C 1350 nt12.53□□□□□ -0.4
CMR1Q12510 NPL3YDR432W 1245 nt12.52□□□□□ -0.41
CMR1Q12510 FUN26YAL022C 1554 nt12.5□□□□□ -0.41
CMR1Q12510 MNP1YGL068W 585 nt12.47□□□□□ -0.41
CMR1Q12510 HOM6YJR139C 1080 nt12.47□□□□□ -0.41
CMR1Q12510 ALF1YNL148C 765 nt12.4□□□□□ -0.42
CMR1Q12510 TRM9YML014W 840 nt12.39□□□□□ -0.43
CMR1Q12510 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.36□□□□□ -0.43
CMR1Q12510 EMI2YDR516C 1503 nt12.34□□□□□ -0.43
CMR1Q12510 YOL037CYOL037C 354 nt12.34□□□□□ -0.43
CMR1Q12510 LSM3YLR438C-A 270 nt12.33□□□□□ -0.44
CMR1Q12510 BDF1YLR399C 2061 nt12.31□□□□□ -0.44
CMR1Q12510 RKM5YLR137W 1104 nt12.31□□□□□ -0.44
CMR1Q12510 RPP2AYOL039W 321 nt12.3□□□□□ -0.44
CMR1Q12510 CCT6YDR188W 1641 nt12.29□□□□□ -0.44
CMR1Q12510 PTP1YDL230W 1008 nt12.28□□□□□ -0.44
CMR1Q12510 YMR090WYMR090W 684 nt12.26□□□□□ -0.45
CMR1Q12510 CAC2YML102W 1407 nt12.25□□□□□ -0.45
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