Protein–RNA interactions for Protein: Q08924

RTT10, Regulator of Ty1 transposition protein 10, yeastyeast

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTT10Q08924 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.14■□□□□ 0.81
RTT10Q08924 NSR1YGR159C 1245 nt19.77■□□□□ 0.76
RTT10Q08924 NOP1YDL014W 984 nt19.72■□□□□ 0.75
RTT10Q08924 YKL036CYKL036C 393 nt18.46■□□□□ 0.55
RTT10Q08924 Q0297Q0297 156 nt17.35■□□□□ 0.37
RTT10Q08924 YJL027CYJL027C 417 nt17.29■□□□□ 0.36
RTT10Q08924 MDJ1YFL016C 1536 nt17.26■□□□□ 0.35
RTT10Q08924 SRX1YKL086W 384 nt17.22■□□□□ 0.35
RTT10Q08924 SCS3YGL126W 1143 nt16.94■□□□□ 0.3
RTT10Q08924 YCR051WYCR051W 669 nt16.36■□□□□ 0.21
RTT10Q08924 YOL085CYOL085C 342 nt15.97■□□□□ 0.15
RTT10Q08924 PKP1YIL042C 1185 nt15.69■□□□□ 0.1
RTT10Q08924 RPP1BYDL130W 321 nt15.57■□□□□ 0.08
RTT10Q08924 DBP2YNL112W 1641 nt15.39■□□□□ 0.05
RTT10Q08924 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.39■□□□□ 0.05
RTT10Q08924 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.39■□□□□ 0.05
RTT10Q08924 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.39■□□□□ 0.05
RTT10Q08924 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.39■□□□□ 0.05
RTT10Q08924 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.39■□□□□ 0.05
RTT10Q08924 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.39■□□□□ 0.05
RTT10Q08924 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.39■□□□□ 0.05
RTT10Q08924 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.39■□□□□ 0.05
RTT10Q08924 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.39■□□□□ 0.05
RTT10Q08924 SCJ1YMR214W 1134 nt15.39■□□□□ 0.05
RTT10Q08924 CCC1YLR220W 969 nt15.25■□□□□ 0.03
RTT10Q08924 ATS1YAL020C 1002 nt15.24■□□□□ 0.03
RTT10Q08924 SSA3YBL075C 1950 nt14.87□□□□□ -0.03
RTT10Q08924 PET122YER153C 765 nt14.83□□□□□ -0.04
RTT10Q08924 SCR1SCR1 522 nt14.77□□□□□ -0.05
RTT10Q08924 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.66□□□□□ -0.06
RTT10Q08924 YBR190WYBR190W 312 nt14.65□□□□□ -0.06
RTT10Q08924 RVS167YDR388W 1449 nt14.57□□□□□ -0.08
RTT10Q08924 Q0182Q0182 405 nt14.49□□□□□ -0.09
RTT10Q08924 RRN5YLR141W 1092 nt14.44□□□□□ -0.1
RTT10Q08924 RTC3YHR087W 336 nt14.35□□□□□ -0.11
RTT10Q08924 RSB1YOR049C 1065 nt14.23□□□□□ -0.13
RTT10Q08924 YDJ1YNL064C 1230 nt14.18□□□□□ -0.14
RTT10Q08924 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.15□□□□□ -0.14
RTT10Q08924 SHR5YOL110W 714 nt14.11□□□□□ -0.15
RTT10Q08924 MOT3YMR070W 1473 nt14.11□□□□□ -0.15
RTT10Q08924 PST2YDR032C 597 nt14.06□□□□□ -0.16
RTT10Q08924 GAR1YHR089C 618 nt13.82□□□□□ -0.2
RTT10Q08924 YKL097CYKL097C 411 nt13.67□□□□□ -0.22
RTT10Q08924 DEP1YAL013W 1218 nt13.61□□□□□ -0.23
RTT10Q08924 URN1YPR152C 1398 nt13.54□□□□□ -0.24
RTT10Q08924 YNL208WYNL208W 600 nt13.44□□□□□ -0.26
RTT10Q08924 RPN10YHR200W 807 nt13.42□□□□□ -0.26
RTT10Q08924 SHU1YHL006C 453 nt13.41□□□□□ -0.26
RTT10Q08924 TIR1YER011W 765 nt13.34□□□□□ -0.27
RTT10Q08924 OPI9YLR338W 858 nt13.28□□□□□ -0.28
RTT10Q08924 PUT4YOR348C 1884 nt13.27□□□□□ -0.29
RTT10Q08924 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.12□□□□□ -0.31
RTT10Q08924 SSA1YAL005C 1929 nt13.11□□□□□ -0.31
RTT10Q08924 SAH1YER043C 1350 nt13.11□□□□□ -0.31
RTT10Q08924 YOR139CYOR139C 393 nt13.05□□□□□ -0.32
RTT10Q08924 SRB2YHR041C 633 nt12.93□□□□□ -0.34
RTT10Q08924 YJR018WYJR018W 363 nt12.93□□□□□ -0.34
RTT10Q08924 ARE1YCR048W 1833 nt12.92□□□□□ -0.34
RTT10Q08924 NPL3YDR432W 1245 nt12.9□□□□□ -0.34
RTT10Q08924 PUN1YLR414C 792 nt12.9□□□□□ -0.34
RTT10Q08924 YGR021WYGR021W 873 nt12.83□□□□□ -0.36
RTT10Q08924 POA1YBR022W 534 nt12.83□□□□□ -0.36
RTT10Q08924 WWM1YFL010C 636 nt12.8□□□□□ -0.36
RTT10Q08924 HOM6YJR139C 1080 nt12.79□□□□□ -0.36
RTT10Q08924 RPP2BYDR382W 333 nt12.77□□□□□ -0.37
RTT10Q08924 YJR120WYJR120W 351 nt12.77□□□□□ -0.37
RTT10Q08924 MNP1YGL068W 585 nt12.76□□□□□ -0.37
RTT10Q08924 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.76□□□□□ -0.37
RTT10Q08924 PTC2YER089C 1395 nt12.69□□□□□ -0.38
RTT10Q08924 YOL037CYOL037C 354 nt12.68□□□□□ -0.38
RTT10Q08924 SSA4YER103W 1929 nt12.67□□□□□ -0.38
RTT10Q08924 BSC6YOL137W 1494 nt12.65□□□□□ -0.38
RTT10Q08924 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.6□□□□□ -0.39
RTT10Q08924 RKM5YLR137W 1104 nt12.6□□□□□ -0.39
RTT10Q08924 PAC11YDR488C 1602 nt12.57□□□□□ -0.4
RTT10Q08924 BDH2YAL061W 1254 nt12.55□□□□□ -0.4
RTT10Q08924 SPT5YML010W 3192 nt12.55□□□□□ -0.4
RTT10Q08924 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.54□□□□□ -0.4
RTT10Q08924 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.54□□□□□ -0.4
RTT10Q08924 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.54□□□□□ -0.4
RTT10Q08924 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.54□□□□□ -0.4
RTT10Q08924 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.54□□□□□ -0.4
RTT10Q08924 NAB2YGL122C 1578 nt12.49□□□□□ -0.41
RTT10Q08924 BUD23YCR047C 828 nt12.49□□□□□ -0.41
RTT10Q08924 INM2YDR287W 879 nt12.45□□□□□ -0.42
RTT10Q08924 LSM3YLR438C-A 270 nt12.45□□□□□ -0.42
RTT10Q08924 NVJ2YPR091C 2313 nt12.44□□□□□ -0.42
RTT10Q08924 DAL1YIR027C 1383 nt12.38□□□□□ -0.43
RTT10Q08924 YBL100CYBL100C 315 nt12.37□□□□□ -0.43
RTT10Q08924 YLR281CYLR281C 468 nt12.36□□□□□ -0.43
RTT10Q08924 FPR4YLR449W 1179 nt12.36□□□□□ -0.43
RTT10Q08924 BDF1YLR399C 2061 nt12.36□□□□□ -0.43
RTT10Q08924 PUS2YGL063W 1113 nt12.34□□□□□ -0.43
RTT10Q08924 FIS1YIL065C 468 nt12.31□□□□□ -0.44
RTT10Q08924 TRM9YML014W 840 nt12.28□□□□□ -0.44
RTT10Q08924 WHI5YOR083W 888 nt12.28□□□□□ -0.44
RTT10Q08924 PHO4YFR034C 939 nt12.25□□□□□ -0.45
RTT10Q08924 FUN26YAL022C 1554 nt12.23□□□□□ -0.45
RTT10Q08924 TAT1YBR069C 1860 nt12.16□□□□□ -0.46
RTT10Q08924 CCT6YDR188W 1641 nt12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.9 ms