Protein–RNA interactions for Protein: Q06625

GDB1, Glycogen debranching enzyme, yeastyeast

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Length 1,536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GDB1Q06625 YML009W-BYML009W-B 477 nt31.34■■■□□ 2.61
GDB1Q06625 NOP1YDL014W 984 nt30.26■■■□□ 2.43
GDB1Q06625 NSR1YGR159C 1245 nt29.98■■■□□ 2.39
GDB1Q06625 YKL036CYKL036C 393 nt28.84■■■□□ 2.21
GDB1Q06625 YJL027CYJL027C 417 nt27.07■■□□□ 1.92
GDB1Q06625 Q0297Q0297 156 nt26.84■■□□□ 1.89
GDB1Q06625 SCS3YGL126W 1143 nt26.81■■□□□ 1.88
GDB1Q06625 SRX1YKL086W 384 nt26.65■■□□□ 1.86
GDB1Q06625 MDJ1YFL016C 1536 nt26.51■■□□□ 1.83
GDB1Q06625 YCR051WYCR051W 669 nt25.47■■□□□ 1.67
GDB1Q06625 YOL085CYOL085C 342 nt24.86■■□□□ 1.57
GDB1Q06625 PKP1YIL042C 1185 nt24.72■■□□□ 1.55
GDB1Q06625 SCJ1YMR214W 1134 nt24.22■■□□□ 1.47
GDB1Q06625 RPP1BYDL130W 321 nt24.1■■□□□ 1.45
GDB1Q06625 ATS1YAL020C 1002 nt23.94■■□□□ 1.42
GDB1Q06625 TRN1tP(UGG)A 72 nt23.8■■□□□ 1.4
GDB1Q06625 SUF9tP(UGG)F 72 nt23.8■■□□□ 1.4
GDB1Q06625 SUF8tP(UGG)H 72 nt23.8■■□□□ 1.4
GDB1Q06625 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt23.8■■□□□ 1.4
GDB1Q06625 SUF7tP(UGG)M 72 nt23.8■■□□□ 1.4
GDB1Q06625 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt23.8■■□□□ 1.4
GDB1Q06625 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt23.8■■□□□ 1.4
GDB1Q06625 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt23.8■■□□□ 1.4
GDB1Q06625 SUF11tP(UGG)O2 72 nt23.8■■□□□ 1.4
GDB1Q06625 CCC1YLR220W 969 nt23.57■■□□□ 1.36
GDB1Q06625 DBP2YNL112W 1641 nt23.56■■□□□ 1.36
GDB1Q06625 PET122YER153C 765 nt23.19■■□□□ 1.3
GDB1Q06625 SCR1SCR1 522 nt22.91■■□□□ 1.26
GDB1Q06625 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt22.67■■□□□ 1.22
GDB1Q06625 RRN5YLR141W 1092 nt22.38■■□□□ 1.17
GDB1Q06625 RTC3YHR087W 336 nt22.37■■□□□ 1.17
GDB1Q06625 RSB1YOR049C 1065 nt22.33■■□□□ 1.17
GDB1Q06625 RVS167YDR388W 1449 nt22.19■■□□□ 1.14
GDB1Q06625 YBR190WYBR190W 312 nt22■■□□□ 1.11
GDB1Q06625 YER088W-BYER088W-B 147 nt21.99■■□□□ 1.11
GDB1Q06625 PST2YDR032C 597 nt21.98■■□□□ 1.11
GDB1Q06625 YDJ1YNL064C 1230 nt21.75■■□□□ 1.07
GDB1Q06625 YKL097CYKL097C 411 nt21.69■■□□□ 1.06
GDB1Q06625 SHR5YOL110W 714 nt21.63■■□□□ 1.05
GDB1Q06625 GAR1YHR089C 618 nt21.37■■□□□ 1.01
GDB1Q06625 SHU1YHL006C 453 nt21.16■□□□□ 0.98
GDB1Q06625 DEP1YAL013W 1218 nt21.03■□□□□ 0.96
GDB1Q06625 YOR139CYOR139C 393 nt20.77■□□□□ 0.92
GDB1Q06625 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt20.72■□□□□ 0.91
GDB1Q06625 URN1YPR152C 1398 nt20.69■□□□□ 0.9
GDB1Q06625 TIR1YER011W 765 nt20.56■□□□□ 0.88
GDB1Q06625 YNL208WYNL208W 600 nt20.44■□□□□ 0.86
GDB1Q06625 NPL3YDR432W 1245 nt20.37■□□□□ 0.85
GDB1Q06625 RPN10YHR200W 807 nt20.36■□□□□ 0.85
GDB1Q06625 SRB2YHR041C 633 nt20.28■□□□□ 0.84
GDB1Q06625 MNP1YGL068W 585 nt20.25■□□□□ 0.83
GDB1Q06625 SSA1YAL005C 1929 nt20.22■□□□□ 0.83
GDB1Q06625 OPI9YLR338W 858 nt20.07■□□□□ 0.8
GDB1Q06625 SAH1YER043C 1350 nt19.93■□□□□ 0.78
GDB1Q06625 WWM1YFL010C 636 nt19.93■□□□□ 0.78
GDB1Q06625 HOM6YJR139C 1080 nt19.91■□□□□ 0.78
GDB1Q06625 YOL037CYOL037C 354 nt19.88■□□□□ 0.77
GDB1Q06625 YGR021WYGR021W 873 nt19.85■□□□□ 0.77
GDB1Q06625 YJR120WYJR120W 351 nt19.79■□□□□ 0.76
GDB1Q06625 PUT4YOR348C 1884 nt19.71■□□□□ 0.75
GDB1Q06625 YJR018WYJR018W 363 nt19.67■□□□□ 0.74
GDB1Q06625 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt19.66■□□□□ 0.74
GDB1Q06625 IMT4tM(CAU)E 72 nt19.66■□□□□ 0.74
GDB1Q06625 IMT3tM(CAU)J3 72 nt19.66■□□□□ 0.74
GDB1Q06625 IMT1tM(CAU)O1 72 nt19.66■□□□□ 0.74
GDB1Q06625 IMT2tM(CAU)P 72 nt19.66■□□□□ 0.74
GDB1Q06625 RKM5YLR137W 1104 nt19.61■□□□□ 0.73
GDB1Q06625 ARE1YCR048W 1833 nt19.59■□□□□ 0.73
GDB1Q06625 PUN1YLR414C 792 nt19.47■□□□□ 0.71
GDB1Q06625 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt19.45■□□□□ 0.7
GDB1Q06625 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt19.41■□□□□ 0.7
GDB1Q06625 RPP2BYDR382W 333 nt19.41■□□□□ 0.7
GDB1Q06625 MOT3YMR070W 1473 nt19.39■□□□□ 0.69
GDB1Q06625 PUS2YGL063W 1113 nt19.39■□□□□ 0.69
GDB1Q06625 SSA3YBL075C 1950 nt19.33■□□□□ 0.69
GDB1Q06625 YLR281CYLR281C 468 nt19.25■□□□□ 0.67
GDB1Q06625 BDH2YAL061W 1254 nt19.2■□□□□ 0.66
GDB1Q06625 PTC2YER089C 1395 nt19.16■□□□□ 0.66
GDB1Q06625 POA1YBR022W 534 nt19.15■□□□□ 0.66
GDB1Q06625 WHI5YOR083W 888 nt19.15■□□□□ 0.66
GDB1Q06625 BSC6YOL137W 1494 nt19.13■□□□□ 0.65
GDB1Q06625 YLR236CYLR236C 324 nt19.06■□□□□ 0.64
GDB1Q06625 FMP45YDL222C 930 nt19.05■□□□□ 0.64
GDB1Q06625 BUD23YCR047C 828 nt18.98■□□□□ 0.63
GDB1Q06625 YBL100CYBL100C 315 nt18.93■□□□□ 0.62
GDB1Q06625 YPR011CYPR011C 981 nt18.92■□□□□ 0.62
GDB1Q06625 FIS1YIL065C 468 nt18.9■□□□□ 0.62
GDB1Q06625 DSK2YMR276W 1122 nt18.87■□□□□ 0.61
GDB1Q06625 LSM3YLR438C-A 270 nt18.83■□□□□ 0.6
GDB1Q06625 FPR4YLR449W 1179 nt18.81■□□□□ 0.6
GDB1Q06625 NAB2YGL122C 1578 nt18.74■□□□□ 0.59
GDB1Q06625 PHO4YFR034C 939 nt18.72■□□□□ 0.59
GDB1Q06625 YCH1YGR203W 447 nt18.69■□□□□ 0.58
GDB1Q06625 DAL1YIR027C 1383 nt18.68■□□□□ 0.58
GDB1Q06625 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt18.67■□□□□ 0.58
GDB1Q06625 LPX1YOR084W 1164 nt18.64■□□□□ 0.57
GDB1Q06625 INM2YDR287W 879 nt18.62■□□□□ 0.57
GDB1Q06625 MRPL8YJL063C 717 nt18.61■□□□□ 0.57
GDB1Q06625 FUN26YAL022C 1554 nt18.6■□□□□ 0.57
GDB1Q06625 TRM9YML014W 840 nt18.57■□□□□ 0.56
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