Protein–RNA interactions for Protein: P53127

SNT2, E3 ubiquitin-protein ligase SNT2, yeastyeast

Predictions only

Length 1,403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNT2P53127 YML009W-BYML009W-B 477 nt31.94■■■□□ 2.7
SNT2P53127 NOP1YDL014W 984 nt30.91■■■□□ 2.54
SNT2P53127 NSR1YGR159C 1245 nt30.75■■■□□ 2.51
SNT2P53127 YKL036CYKL036C 393 nt29.33■■■□□ 2.29
SNT2P53127 YJL027CYJL027C 417 nt27.61■■■□□ 2.01
SNT2P53127 Q0297Q0297 156 nt27.3■■□□□ 1.96
SNT2P53127 SCS3YGL126W 1143 nt27.21■■□□□ 1.95
SNT2P53127 MDJ1YFL016C 1536 nt27.18■■□□□ 1.94
SNT2P53127 SRX1YKL086W 384 nt27.11■■□□□ 1.93
SNT2P53127 YCR051WYCR051W 669 nt25.97■■□□□ 1.75
SNT2P53127 YOL085CYOL085C 342 nt25.37■■□□□ 1.65
SNT2P53127 PKP1YIL042C 1185 nt25.18■■□□□ 1.62
SNT2P53127 SCJ1YMR214W 1134 nt24.73■■□□□ 1.55
SNT2P53127 RPP1BYDL130W 321 nt24.56■■□□□ 1.52
SNT2P53127 ATS1YAL020C 1002 nt24.43■■□□□ 1.5
SNT2P53127 TRN1tP(UGG)A 72 nt24.23■■□□□ 1.47
SNT2P53127 SUF9tP(UGG)F 72 nt24.23■■□□□ 1.47
SNT2P53127 SUF8tP(UGG)H 72 nt24.23■■□□□ 1.47
SNT2P53127 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt24.23■■□□□ 1.47
SNT2P53127 SUF7tP(UGG)M 72 nt24.23■■□□□ 1.47
SNT2P53127 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt24.23■■□□□ 1.47
SNT2P53127 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt24.23■■□□□ 1.47
SNT2P53127 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt24.23■■□□□ 1.47
SNT2P53127 SUF11tP(UGG)O2 72 nt24.23■■□□□ 1.47
SNT2P53127 CCC1YLR220W 969 nt24.18■■□□□ 1.46
SNT2P53127 DBP2YNL112W 1641 nt24.13■■□□□ 1.45
SNT2P53127 PET122YER153C 765 nt23.6■■□□□ 1.37
SNT2P53127 SCR1SCR1 522 nt23.33■■□□□ 1.32
SNT2P53127 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt23.12■■□□□ 1.29
SNT2P53127 RRN5YLR141W 1092 nt22.88■■□□□ 1.25
SNT2P53127 RTC3YHR087W 336 nt22.85■■□□□ 1.25
SNT2P53127 RSB1YOR049C 1065 nt22.72■■□□□ 1.23
SNT2P53127 RVS167YDR388W 1449 nt22.71■■□□□ 1.23
SNT2P53127 YBR190WYBR190W 312 nt22.63■■□□□ 1.21
SNT2P53127 PST2YDR032C 597 nt22.42■■□□□ 1.18
SNT2P53127 YER088W-BYER088W-B 147 nt22.42■■□□□ 1.18
SNT2P53127 YDJ1YNL064C 1230 nt22.18■■□□□ 1.14
SNT2P53127 YKL097CYKL097C 411 nt22.1■■□□□ 1.13
SNT2P53127 SHR5YOL110W 714 nt22.1■■□□□ 1.13
SNT2P53127 GAR1YHR089C 618 nt21.88■■□□□ 1.09
SNT2P53127 DEP1YAL013W 1218 nt21.57■■□□□ 1.04
SNT2P53127 SHU1YHL006C 453 nt21.51■■□□□ 1.03
SNT2P53127 URN1YPR152C 1398 nt21.21■□□□□ 0.99
SNT2P53127 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt21.11■□□□□ 0.97
SNT2P53127 YOR139CYOR139C 393 nt21.1■□□□□ 0.97
SNT2P53127 TIR1YER011W 765 nt21.02■□□□□ 0.96
SNT2P53127 YNL208WYNL208W 600 nt20.96■□□□□ 0.95
SNT2P53127 RPN10YHR200W 807 nt20.85■□□□□ 0.93
SNT2P53127 NPL3YDR432W 1245 nt20.75■□□□□ 0.91
SNT2P53127 SRB2YHR041C 633 nt20.7■□□□□ 0.9
SNT2P53127 SSA1YAL005C 1929 nt20.69■□□□□ 0.9
SNT2P53127 OPI9YLR338W 858 nt20.61■□□□□ 0.89
SNT2P53127 MNP1YGL068W 585 nt20.53■□□□□ 0.88
SNT2P53127 SAH1YER043C 1350 nt20.52■□□□□ 0.88
SNT2P53127 WWM1YFL010C 636 nt20.34■□□□□ 0.85
SNT2P53127 HOM6YJR139C 1080 nt20.25■□□□□ 0.83
SNT2P53127 YJR018WYJR018W 363 nt20.19■□□□□ 0.82
SNT2P53127 YJR120WYJR120W 351 nt20.18■□□□□ 0.82
SNT2P53127 YGR021WYGR021W 873 nt20.17■□□□□ 0.82
SNT2P53127 PUT4YOR348C 1884 nt20.16■□□□□ 0.82
SNT2P53127 YOL037CYOL037C 354 nt20.14■□□□□ 0.81
SNT2P53127 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt20.1■□□□□ 0.81
SNT2P53127 IMT4tM(CAU)E 72 nt20.1■□□□□ 0.81
SNT2P53127 IMT3tM(CAU)J3 72 nt20.1■□□□□ 0.81
SNT2P53127 IMT1tM(CAU)O1 72 nt20.1■□□□□ 0.81
SNT2P53127 IMT2tM(CAU)P 72 nt20.1■□□□□ 0.81
SNT2P53127 ARE1YCR048W 1833 nt20.06■□□□□ 0.8
SNT2P53127 PUN1YLR414C 792 nt19.99■□□□□ 0.79
SNT2P53127 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt19.96■□□□□ 0.79
SNT2P53127 RKM5YLR137W 1104 nt19.96■□□□□ 0.79
SNT2P53127 RPP2BYDR382W 333 nt19.89■□□□□ 0.77
SNT2P53127 PUS2YGL063W 1113 nt19.79■□□□□ 0.76
SNT2P53127 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt19.77■□□□□ 0.76
SNT2P53127 PTC2YER089C 1395 nt19.77■□□□□ 0.76
SNT2P53127 MOT3YMR070W 1473 nt19.75■□□□□ 0.75
SNT2P53127 POA1YBR022W 534 nt19.7■□□□□ 0.74
SNT2P53127 SSA3YBL075C 1950 nt19.68■□□□□ 0.74
SNT2P53127 BDH2YAL061W 1254 nt19.62■□□□□ 0.73
SNT2P53127 YLR281CYLR281C 468 nt19.59■□□□□ 0.73
SNT2P53127 BSC6YOL137W 1494 nt19.58■□□□□ 0.72
SNT2P53127 BUD23YCR047C 828 nt19.57■□□□□ 0.72
SNT2P53127 WHI5YOR083W 888 nt19.5■□□□□ 0.71
SNT2P53127 FPR4YLR449W 1179 nt19.42■□□□□ 0.7
SNT2P53127 FMP45YDL222C 930 nt19.39■□□□□ 0.69
SNT2P53127 YBL100CYBL100C 315 nt19.37■□□□□ 0.69
SNT2P53127 FIS1YIL065C 468 nt19.32■□□□□ 0.68
SNT2P53127 YLR236CYLR236C 324 nt19.32■□□□□ 0.68
SNT2P53127 LSM3YLR438C-A 270 nt19.29■□□□□ 0.68
SNT2P53127 YPR011CYPR011C 981 nt19.29■□□□□ 0.68
SNT2P53127 NAB2YGL122C 1578 nt19.29■□□□□ 0.68
SNT2P53127 DAL1YIR027C 1383 nt19.21■□□□□ 0.67
SNT2P53127 INM2YDR287W 879 nt19.18■□□□□ 0.66
SNT2P53127 PHO4YFR034C 939 nt19.17■□□□□ 0.66
SNT2P53127 DSK2YMR276W 1122 nt19.17■□□□□ 0.66
SNT2P53127 FUN26YAL022C 1554 nt19.11■□□□□ 0.65
SNT2P53127 TRM9YML014W 840 nt19.09■□□□□ 0.65
SNT2P53127 YCH1YGR203W 447 nt19.07■□□□□ 0.64
SNT2P53127 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt19.03■□□□□ 0.64
SNT2P53127 MRPL8YJL063C 717 nt18.99■□□□□ 0.63
SNT2P53127 UBX6YJL048C 1191 nt18.93■□□□□ 0.62
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