RNA–Protein interactions for RNA: YPR069C

SPE3, Transcript of Spermidine synthase, yeastyeast

Gene SPE3, Length 882 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE3YPR069C IOC4Q04213 475 aa9□□□□□ -0.97
SPE3YPR069C GSC2P40989 1895 aa9□□□□□ -0.97
SPE3YPR069C VHR2P40041 505 aa8.99□□□□□ -0.97
SPE3YPR069C MSM1P22438 575 aa8.98□□□□□ -0.97
SPE3YPR069C FRD1P32614 470 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
SPE3YPR069C APL2P36000 726 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
SPE3YPR069C RPN1P38764 993 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
SPE3YPR069C SAS4Q04003 481 aa8.98□□□□□ -0.97
SPE3YPR069C DPL1Q05567 589 aa8.98□□□□□ -0.97
SPE3YPR069C TSR3Q12094 313 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
SPE3YPR069C GLC3P32775 704 aa8.97□□□□□ -0.97
SPE3YPR069C MAM1P40065 302 aa8.97□□□□□ -0.97
SPE3YPR069C PRD1P25375 712 aa8.96□□□□□ -0.98
SPE3YPR069C ZDS1P50111 915 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
SPE3YPR069C TIM50Q02776 476 aa8.96□□□□□ -0.98
SPE3YPR069C YIL089WP40500 205 aa8.95□□□□□ -0.98
SPE3YPR069C FET4P40988 552 aa8.95□□□□□ -0.98
SPE3YPR069C YLR271WQ06152 274 aa8.95□□□□□ -0.98
SPE3YPR069C RTR1P40084 226 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
SPE3YPR069C TYW1Q08960 810 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
SPE3YPR069C COQ4O13525 335 aa8.93□□□□□ -0.98
SPE3YPR069C GAP1P19145 602 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
SPE3YPR069C PEA2P40091 420 aa8.93□□□□□ -0.98
SPE3YPR069C VPS64Q03944 604 aa8.93□□□□□ -0.98
SPE3YPR069C BMS1Q08965 1183 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
SPE3YPR069C DUR1,2P32528 1835 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
SPE3YPR069C YGR117CP53270 476 aa8.92□□□□□ -0.98
SPE3YPR069C ZDS2P54786 942 aa8.92□□□□□ -0.98
SPE3YPR069C EMP47P43555 445 aa8.91□□□□□ -0.98
SPE3YPR069C YOL057WQ08225 711 aa8.91□□□□□ -0.98
SPE3YPR069C SET4P42948 560 aa8.9□□□□□ -0.98
SPE3YPR069C PSD2P53037 1138 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
SPE3YPR069C NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data8.89□□□□□ -0.99not detected
SPE3YPR069C TIF4632P39936 914 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
SPE3YPR069C YJR008WP47085 338 aa8.89□□□□□ -0.99
SPE3YPR069C DNM1P54861 757 aa8.89□□□□□ -0.99
SPE3YPR069C KRE2P27809 442 aa8.88□□□□□ -0.99
SPE3YPR069C GYP7P48365 746 aa8.88□□□□□ -0.99
SPE3YPR069C TRM44Q02648 567 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
SPE3YPR069C UBX2Q04228 584 aa8.88□□□□□ -0.99
SPE3YPR069C AIM7Q12156 149 aa8.88□□□□□ -0.99
SPE3YPR069C ICP55P40051 511 aa8.87□□□□□ -0.99
SPE3YPR069C CWC15Q03772 175 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
SPE3YPR069C CRF1Q04930 467 aa8.87□□□□□ -0.99
SPE3YPR069C THI22Q06490 572 aa8.87□□□□□ -0.99
SPE3YPR069C DPH6Q12429 685 aa8.87□□□□□ -0.99
SPE3YPR069C SRF1Q12516 437 aa8.87□□□□□ -0.99
SPE3YPR069C SWI1P09547 1314 aa8.86□□□□□ -0.99
SPE3YPR069C TRP5P00931 707 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
SPE3YPR069C FCP1Q03254 732 aa8.86□□□□□ -0.99
SPE3YPR069C PKH1Q03407 766 aa8.86□□□□□ -0.99
SPE3YPR069C GAS5Q08193 484 aa8.86□□□□□ -0.99
SPE3YPR069C SAC3P46674 1301 aa8.85□□□□□ -0.99
SPE3YPR069C AFG2P32794 780 aa8.85□□□□□ -0.99
SPE3YPR069C CST6P40535 587 aa8.85□□□□□ -0.99
SPE3YPR069C VPS4P52917 437 aa8.85□□□□□ -0.99
SPE3YPR069C YDR306CQ06640 478 aa8.85□□□□□ -0.99
SPE3YPR069C RTT109Q07794 436 aa8.85□□□□□ -0.99
SPE3YPR069C RRG1Q12167 365 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
SPE3YPR069C TIF6Q12522 245 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
SPE3YPR069C HPR1P17629 752 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
SPE3YPR069C STV1P37296 890 aa8.84□□□□□ -0.99
SPE3YPR069C YBR287WP38355 427 aa8.84□□□□□ -0.99
SPE3YPR069C SET1P38827 1080 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
SPE3YPR069C HVG1P0CE11 249 aa8.83□□□□□ -1
SPE3YPR069C BSD2P38356 321 aa8.83□□□□□ -1
SPE3YPR069C SPL2P38839 148 aa8.82□□□□□ -1
SPE3YPR069C MPP10P47083 593 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
SPE3YPR069C HEF3P53978 1044 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
SPE3YPR069C FLO11P08640 1367 aa8.81□□□□□ -1
SPE3YPR069C SDH2P21801 266 aa8.8□□□□□ -1
SPE3YPR069C RRT6P53117 311 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
SPE3YPR069C ITC1P53125 1264 aa8.8□□□□□ -1
SPE3YPR069C RPT4P53549 437 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
SPE3YPR069C SRT1Q03175 343 aa8.8□□□□□ -1
SPE3YPR069C MGM1P32266 881 aa8.79□□□□□ -1
SPE3YPR069C NUP133P36161 1157 aa8.79□□□□□ -1
SPE3YPR069C PRP42Q03776 544 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
SPE3YPR069C CST9Q06032 482 aa8.79□□□□□ -1
SPE3YPR069C CSR2Q12734 1121 aa8.79□□□□□ -1
SPE3YPR069C MRP7P12687 371 aa8.78□□□□□ -1
SPE3YPR069C PCS60P38137 543 aaKnown RBP RIP-Chip data8.78□□□□□ -1not detected
SPE3YPR069C MTC5Q03897 1148 aa8.78□□□□□ -1
SPE3YPR069C THI3Q07471 609 aa8.78□□□□□ -1
SPE3YPR069C NCS6P53088 359 aa8.77□□□□□ -1.01
SPE3YPR069C TPD3P31383 635 aa8.76□□□□□ -1.01
SPE3YPR069C NGR1P32831 672 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
SPE3YPR069C MOT2P34909 587 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
SPE3YPR069C UTP7P40055 554 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
SPE3YPR069C PSH1Q12161 406 aa8.76□□□□□ -1.01
SPE3YPR069C CBP1P07252 654 aa8.75□□□□□ -1.01
SPE3YPR069C PNT1P38969 423 aa8.75□□□□□ -1.01
SPE3YPR069C GSM1P42950 618 aa8.75□□□□□ -1.01
SPE3YPR069C SEN54Q02825 467 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
SPE3YPR069C ARG82P07250 355 aa8.74□□□□□ -1.01
SPE3YPR069C LCB1P25045 558 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
SPE3YPR069C RSC30P38781 883 aa8.74□□□□□ -1.01
SPE3YPR069C MTC3P53077 123 aa8.74□□□□□ -1.01
SPE3YPR069C YDL144CQ07589 356 aa8.74□□□□□ -1.01
SPE3YPR069C ACK1Q07622 623 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
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